More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3041 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3041  methyltransferase type 11  100 
 
 
333 aa  682    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07110  ArsR family transcriptional regulator  49.23 
 
 
333 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5268  ArsR family transcriptional regulator  48.57 
 
 
331 aa  293  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149036  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0650  putative transcriptional regulator  49.23 
 
 
329 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0471  ArsR family transcriptional regulator  44.41 
 
 
335 aa  291  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.421006  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5015  ArsR family transcriptional regulator  48.63 
 
 
330 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.1667 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0500  ArsR family transcriptional regulator  48.32 
 
 
330 aa  289  6e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4966  ArsR family transcriptional regulator  48.17 
 
 
330 aa  288  9e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4839  ArsR family transcriptional regulator  48.17 
 
 
330 aa  288  9e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0384  transcriptional regulator, ArsR family  47.48 
 
 
331 aa  285  7e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05540  ArsR family regulatory protein  46.88 
 
 
336 aa  282  4.0000000000000003e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4793  regulatory protein, ArsR  47.78 
 
 
331 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  46.63 
 
 
334 aa  276  5e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
305 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  36.46 
 
 
306 aa  151  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  32.98 
 
 
310 aa  142  8e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  34.35 
 
 
307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  33.79 
 
 
305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  32.27 
 
 
309 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
348 aa  122  7e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  32.89 
 
 
307 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  30.61 
 
 
341 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  30.3 
 
 
342 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
327 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  29.87 
 
 
339 aa  116  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
337 aa  115  8.999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  29.32 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  29.41 
 
 
341 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  30.31 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3410  ArsR family transcriptional regulator  30.66 
 
 
329 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0187563  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  29.97 
 
 
349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  30.07 
 
 
354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  27.12 
 
 
341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  27.12 
 
 
341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  26.87 
 
 
341 aa  110  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1067  transcriptional regulator, ArsR family  27.76 
 
 
305 aa  109  7.000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.420275 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  30.91 
 
 
307 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  29.53 
 
 
337 aa  103  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  29.3 
 
 
330 aa  102  8e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  27.65 
 
 
341 aa  100  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  25.41 
 
 
341 aa  97.4  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2116  methyltransferase type 11  25.33 
 
 
340 aa  94.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.126777 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  28.62 
 
 
317 aa  90.9  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2305  transcriptional regulator, ArsR family  30.77 
 
 
311 aa  90.5  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
349 aa  89  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0356  ArsR family transcriptional regulator  26.14 
 
 
304 aa  87.8  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.208931  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.84 
 
 
207 aa  87  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.09 
 
 
207 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  26.21 
 
 
328 aa  83.2  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0808  transcriptional regulator, ArsR family  28.01 
 
 
324 aa  83.2  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.203378 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  26.87 
 
 
340 aa  81.6  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  25.68 
 
 
312 aa  80.5  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  25.86 
 
 
335 aa  80.5  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2402  ArsR family transcriptional regulator  26.28 
 
 
323 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0160  methyltransferase type 11  29.52 
 
 
322 aa  73.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0747842 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  26.84 
 
 
309 aa  69.7  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  26.67 
 
 
331 aa  66.6  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  44.74 
 
 
119 aa  66.2  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2029  Methyltransferase type 12  28.29 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  41.46 
 
 
124 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  33.58 
 
 
206 aa  64.7  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0204  Methyltransferase type 12  27.1 
 
 
203 aa  64.3  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
125 aa  62.4  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  36.05 
 
 
124 aa  62  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.12 
 
 
420 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  36.05 
 
 
124 aa  62  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
127 aa  61.6  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  32.1 
 
 
119 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  29.77 
 
 
206 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 
123 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
123 aa  61.6  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  42.03 
 
 
183 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 
104 aa  60.8  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  42.86 
 
 
123 aa  60.8  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1265  transcriptional regulator  25.37 
 
 
309 aa  60.8  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1232  ArsR family transcriptional regulator  25.37 
 
 
309 aa  60.8  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0173  transcriptional regulator, ArsR family  27.68 
 
 
326 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  39.13 
 
 
126 aa  60.5  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0162  transcriptional regulator, ArsR family  27.34 
 
 
326 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  34.88 
 
 
120 aa  59.7  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0155  ArsR family transcriptional regulator  27.02 
 
 
326 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  28.05 
 
 
213 aa  59.7  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  40.3 
 
 
116 aa  59.3  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
124 aa  58.9  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  43.66 
 
 
117 aa  58.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  37.68 
 
 
116 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  35.96 
 
 
119 aa  58.9  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1854  ArsR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
104 aa  58.2  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1238  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
219 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  32.58 
 
 
93 aa  57.4  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2434  transcriptional regulator, ArsR family  39.68 
 
 
111 aa  57.4  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  42.62 
 
 
94 aa  57  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  32.1 
 
 
125 aa  57  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 
113 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2695  UbiE/COQ5 family methlytransferase  24.06 
 
 
258 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0592543  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
110 aa  56.6  0.0000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  31.46 
 
 
118 aa  56.6  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  31.52 
 
 
123 aa  56.6  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  33.72 
 
 
125 aa  56.6  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>