More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2305 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2305  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 311 aa  622  1e-177  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  49.18 
 
 		 307 aa  280  3e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 309 aa  278  8e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  49.35 
 
 		 307 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  47.88 
 
 		 312 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 		 348 aa  254  9e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  43.39 
 
 		 305 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  42.03 
 
 		 310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0356  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.208931  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  41.96 
 
 		 307 aa  196  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  41.26 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  40 
 
 		 306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 		 328 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 339 aa  150  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 312 aa  149  7e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  37.01 
 
 		 354 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  37.01 
 
 		 349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0808  transcriptional regulator, ArsR family  37.75 
 
 		 324 aa  146  5e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.203378 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  36.52 
 
 		 342 aa  142  7e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 327 aa  142  9e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1067  transcriptional regulator, ArsR family  35.31 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.420275 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  34.6 
 
 		 330 aa  133  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 340 aa  133  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0160  methyltransferase type 11  39.26 
 
 		 322 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0747842 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 337 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  33.44 
 
 		 341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  33.44 
 
 		 341 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  33.68 
 
 		 309 aa  123  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3410  ArsR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 329 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0187563  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 328 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  34.35 
 
 		 349 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0471  ArsR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.421006  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 341 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 341 aa  119  7.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05540  ArsR family regulatory protein  33.1 
 
 		 336 aa  119  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 334 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5268  ArsR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 331 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  33.81 
 
 		 331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  32.58 
 
 		 341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  31.07 
 
 		 341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07110  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  35.63 
 
 		 335 aa  117  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 337 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0650  putative transcriptional regulator  33.68 
 
 		 329 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2402  ArsR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 323 aa  116  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.43 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0500  ArsR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 330 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.89 
 
 		 207 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5015  ArsR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 330 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1667 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0384  transcriptional regulator, ArsR family  32.53 
 
 		 331 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4793  regulatory protein, ArsR  32.06 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2116  methyltransferase type 11  31.18 
 
 		 340 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126777 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4966  ArsR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 330 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4839  ArsR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 330 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0173  transcriptional regulator, ArsR family  36.15 
 
 		 326 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3041  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 333 aa  102  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0155  ArsR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 326 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0162  transcriptional regulator, ArsR family  35.14 
 
 		 326 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1232  ArsR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 309 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1265  transcriptional regulator  30.28 
 
 		 309 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  33.87 
 
 		 212 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  29.89 
 
 		 206 aa  90.1  4e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  29.12 
 
 		 206 aa  85.5  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  32.11 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.21 
 
 		 420 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  37.5 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  28.31 
 
 		 355 aa  70.1  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.58 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  30.29 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  43.56 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.37 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1731  arsenical resistance operon repressor  41.57 
 
 		 105 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0861085  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2350  transcriptional regulator, ArsR family  43.01 
 
 		 112 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.917554  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0611  hypothetical protein  27.81 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0892  ArsR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 112 aa  64.7  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  40.28 
 
 		 94 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  40.28 
 
 		 94 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  38.04 
 
 		 248 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  37.23 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_550  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.47 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00760121  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  38.54 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1633  Methyltransferase type 11  39.02 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  33.64 
 
 		 117 aa  63.5  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  30.13 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1846  methyltransferase, putative  33.33 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.528406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2876  ArsR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.557946  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3603  Methyltransferase type 11  34.15 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000473766 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  34.42 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04590  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.62 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.886413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  38.33 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  32.74 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  42.25 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2563  transcriptional regulator, ArsR family  37.63 
 
 		 112 aa  62  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000881945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>