More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1872 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 112 aa  228  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2350  transcriptional regulator, ArsR family  96.43 
 
 		 112 aa  217  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.917554  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  62.83 
 
 		 113 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2952  ArsR family transcriptional regulator  58.41 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0522  ArsR family transcriptional regulator  57.52 
 
 		 113 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1154  transcriptional regulator, ArsR family  49.12 
 
 		 113 aa  110  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303698  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 127 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  47.17 
 
 		 115 aa  98.6  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  47.79 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1845  transcriptional regulator, ArsR family  52.78 
 
 		 138 aa  93.2  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2335  ArsR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 115 aa  92  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3820  regulatory protein, ArsR  46.94 
 
 		 115 aa  92  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1220  regulatory protein, ArsR  51.85 
 
 		 115 aa  90.1  9e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  48.45 
 
 		 117 aa  89.7  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  38.39 
 
 		 117 aa  90.1  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  46.6 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2391  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  57.89 
 
 		 106 aa  87.4  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1301  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 112 aa  85.1  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3265  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  45.05 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  50 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0532  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0944  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  52.7 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0793455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3281  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  52.7 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3499  ArsR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0532  arsenical resistence operon repressor  53.42 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3415  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  52.7 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.64554  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0532  ArsR family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4255  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  53.95 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0970362 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  47.5 
 
 		 128 aa  80.1  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2563  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 112 aa  80.1  0.000000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000881945  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1138  regulatory protein, ArsR  48.68 
 
 		 89 aa  80.1  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.191131 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03350  DNA-binding transcriptional repressor  52.78 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449816  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0213  transcriptional regulator, ArsR family  52.78 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0215  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  52.78 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3984  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  52.78 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3703  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  52.78 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 258 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03303  hypothetical protein  52.78 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.521109  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3793  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  52.78 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.462226 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25920  regulatory protein, ArsR family  47.06 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3820  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  52.78 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4850  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  52.78 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_876  transcriptional regulator, ArsR family  36.61 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00297  transcriptional regulator  36.28 
 
 		 111 aa  77.8  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3781  ArsR family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00283923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  52.17 
 
 		 117 aa  77  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3738  ArsR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03333  predicted transcriptional regulator  45.95 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2713  ArsR family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 114 aa  77  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  49.33 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35130  arsenic resistance transcriptional regulator  46.05 
 
 		 116 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.362165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002125  transcriptional regulator ArsR family  43.68 
 
 		 111 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0417  ArsR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 115 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  46.99 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0892  ArsR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  41.41 
 
 		 307 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 317 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1851  regulatory protein ArsR  46.48 
 
 		 114 aa  74.3  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120336  hitchhiker  0.00320391 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2400  ArsR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00774399 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2876  ArsR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.557946  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2969  ArsR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 120 aa  73.6  0.0000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530376 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2718  arsenic resistance transcriptional regulator  44.74 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3077  ArsR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0821  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5146  ArsR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 118 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.426195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3034  regulatory protein, ArsR  44.74 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3638  regulatory protein, ArsR  45.68 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.28 
 
 		 93 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 115 aa  71.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2819  transcriptional regulator, ArsR family  46.48 
 
 		 109 aa  72  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  51.56 
 
 		 106 aa  71.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 114 aa  71.2  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0666  transcriptional regulator, ArsR family  35.19 
 
 		 105 aa  70.9  0.000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0936  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00366082  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  41.24 
 
 		 310 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 125 aa  70.1  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  47.22 
 
 		 98 aa  69.3  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0567  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.702064 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  42.35 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  47.76 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  45.24 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 348 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0586  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.516582  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 		 307 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  46.27 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  45.71 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  44.59 
 
 		 94 aa  67.8  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  44.59 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  44.29 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>