More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3006 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  100 
 
 
305 aa  599  1e-170  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  70.86 
 
 
310 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  68.98 
 
 
307 aa  408  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  69.21 
 
 
309 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  67.99 
 
 
305 aa  403  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  56.11 
 
 
306 aa  323  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  46.81 
 
 
348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  44.98 
 
 
307 aa  226  4e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  43.89 
 
 
309 aa  225  6e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  42.91 
 
 
307 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  44.29 
 
 
312 aa  217  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0356  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
304 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.208931  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2305  transcriptional regulator, ArsR family  43.39 
 
 
311 aa  196  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  38.8 
 
 
328 aa  186  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05540  ArsR family regulatory protein  39.44 
 
 
336 aa  183  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  38.7 
 
 
327 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  37.95 
 
 
342 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  37.62 
 
 
354 aa  175  9e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  37.62 
 
 
349 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
339 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  37.46 
 
 
334 aa  170  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5015  ArsR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
330 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.1667 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4966  ArsR family transcriptional regulator  37.41 
 
 
330 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4839  ArsR family transcriptional regulator  37.41 
 
 
330 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0808  transcriptional regulator, ArsR family  38.61 
 
 
324 aa  166  5e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.203378 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
337 aa  166  5e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0650  putative transcriptional regulator  37.85 
 
 
329 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4793  regulatory protein, ArsR  36.21 
 
 
331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07110  ArsR family transcriptional regulator  37.85 
 
 
333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0384  transcriptional regulator, ArsR family  36.55 
 
 
331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0500  ArsR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
330 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3041  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
333 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  36.51 
 
 
330 aa  159  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  36.52 
 
 
341 aa  158  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2402  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
323 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  32.69 
 
 
341 aa  155  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5268  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
331 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149036  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  33.01 
 
 
341 aa  155  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2116  methyltransferase type 11  34.77 
 
 
340 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.126777 
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  32.69 
 
 
341 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
337 aa  152  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1067  transcriptional regulator, ArsR family  35.23 
 
 
305 aa  152  5e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.420275 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3410  ArsR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
329 aa  148  9e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0187563  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  33.99 
 
 
341 aa  146  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  35.15 
 
 
312 aa  145  6e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
328 aa  144  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
317 aa  145  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0471  ArsR family transcriptional regulator  28.77 
 
 
335 aa  142  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.421006  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  34.52 
 
 
341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  34.28 
 
 
341 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
340 aa  139  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  36.46 
 
 
349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  34.34 
 
 
335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0160  methyltransferase type 11  37.55 
 
 
322 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0747842 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.6 
 
 
207 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.6 
 
 
207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0173  transcriptional regulator, ArsR family  35.5 
 
 
326 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0155  ArsR family transcriptional regulator  35.5 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0162  transcriptional regulator, ArsR family  35.18 
 
 
326 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  35.22 
 
 
309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  37.43 
 
 
212 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  34.78 
 
 
206 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  35.22 
 
 
331 aa  107  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1232  ArsR family transcriptional regulator  33.22 
 
 
309 aa  100  4e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1265  transcriptional regulator  33.22 
 
 
309 aa  100  4e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  31.02 
 
 
206 aa  99.4  7e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  27.37 
 
 
420 aa  91.3  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  28.25 
 
 
355 aa  82  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  33.55 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  41.13 
 
 
225 aa  79  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  34.41 
 
 
207 aa  79  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0285  hypothetical protein  28.9 
 
 
242 aa  78.2  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218355  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.62 
 
 
268 aa  77.4  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.95 
 
 
265 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1926  Methyltransferase type 11  41.74 
 
 
281 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  30.22 
 
 
218 aa  75.5  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0251  arsenite S-adenosylmethyltransferase  38.6 
 
 
272 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  30.77 
 
 
213 aa  74.7  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  46.84 
 
 
117 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  37.38 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  32.43 
 
 
624 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0825  Methyltransferase type 12  29.78 
 
 
216 aa  72.4  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  45.71 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  44.23 
 
 
236 aa  72.4  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1392  putative S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  28.73 
 
 
208 aa  72  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0586874  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  39.81 
 
 
267 aa  72  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  42.72 
 
 
257 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  36.02 
 
 
265 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1731  arsenical resistance operon repressor  50.7 
 
 
105 aa  70.5  0.00000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0861085  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  43.18 
 
 
115 aa  70.5  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6112  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.64 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  33.33 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2791  arsenite S-adenosylmethyltransferase  37.04 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  32.79 
 
 
279 aa  69.7  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  39.45 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  33.5 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  47.95 
 
 
132 aa  69.3  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0160  arsenical resistence operon repressor ArsR  36.84 
 
 
115 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.571922  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1602  regulatory protein ArsR  36.84 
 
 
115 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.10653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>