More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1451 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 341 aa  679    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  99.41 
 
 		 341 aa  675    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  92.96 
 
 		 341 aa  641    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  64.11 
 
 		 337 aa  421  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  58.01 
 
 		 341 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  56.8 
 
 		 341 aa  362  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  57.78 
 
 		 341 aa  349  4e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2116  methyltransferase type 11  59.43 
 
 		 340 aa  342  5e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126777 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  54.77 
 
 		 349 aa  328  7e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  52.05 
 
 		 328 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 327 aa  311  9e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  54.19 
 
 		 339 aa  310  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  52.01 
 
 		 349 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  53.9 
 
 		 354 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  53.42 
 
 		 342 aa  306  3e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  50.96 
 
 		 317 aa  303  3.0000000000000004e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  53.04 
 
 		 340 aa  298  8e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  51.85 
 
 		 335 aa  295  8e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  51.27 
 
 		 337 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  51.6 
 
 		 330 aa  279  6e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3410  ArsR family transcriptional regulator  45.06 
 
 		 329 aa  261  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0187563  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0808  transcriptional regulator, ArsR family  43.93 
 
 		 324 aa  218  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.203378 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 341 aa  216  5e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2402  ArsR family transcriptional regulator  45.81 
 
 		 323 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 328 aa  212  9e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 305 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  35.21 
 
 		 306 aa  151  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 309 aa  151  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  32.87 
 
 		 305 aa  147  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  32.68 
 
 		 307 aa  146  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  31.67 
 
 		 310 aa  143  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  31.45 
 
 		 309 aa  138  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  32.34 
 
 		 307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 		 309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  29.32 
 
 		 307 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 348 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  35 
 
 		 331 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  30.77 
 
 		 312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0356  ArsR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 304 aa  117  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.208931  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3041  methyltransferase type 11  27.12 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0160  methyltransferase type 11  32.24 
 
 		 322 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0747842 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 312 aa  109  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1232  ArsR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 309 aa  108  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1265  transcriptional regulator  33.57 
 
 		 309 aa  108  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2305  transcriptional regulator, ArsR family  31.21 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0384  transcriptional regulator, ArsR family  30.07 
 
 		 331 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4793  regulatory protein, ArsR  29.29 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05540  ArsR family regulatory protein  29.39 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0173  transcriptional regulator, ArsR family  29.14 
 
 		 326 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0155  ArsR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 326 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0162  transcriptional regulator, ArsR family  29.37 
 
 		 326 aa  96.7  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5268  ArsR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 331 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0471  ArsR family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 335 aa  95.1  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.421006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07110  ArsR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 333 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.46 
 
 		 420 aa  92.8  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1067  transcriptional regulator, ArsR family  25.96 
 
 		 305 aa  92.4  9e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.420275 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0650  putative transcriptional regulator  28.67 
 
 		 329 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  29.35 
 
 		 206 aa  90.5  4e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 334 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0500  ArsR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 330 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  31.16 
 
 		 206 aa  89.7  7e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4966  ArsR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 330 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4839  ArsR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 330 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28 
 
 		 207 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5015  ArsR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1667 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.43 
 
 		 207 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 125 aa  80.5  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  48.78 
 
 		 125 aa  80.1  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  36.11 
 
 		 212 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  31.75 
 
 		 209 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  34.39 
 
 		 272 aa  75.9  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  50.65 
 
 		 136 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  52.05 
 
 		 124 aa  73.9  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  30.56 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3202  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  39.39 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  44.12 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  35.07 
 
 		 275 aa  72.4  0.000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  44.16 
 
 		 95 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 131 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6701  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.84 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  45.95 
 
 		 120 aa  71.6  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  46.05 
 
 		 124 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.78 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  44.66 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  45.68 
 
 		 102 aa  70.1  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  46.75 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  39.64 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0880  amidohydrolase  39.62 
 
 		 629 aa  69.7  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 211 aa  68.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 209 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2432  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.52 
 
 		 260 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  44.16 
 
 		 129 aa  68.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  33.93 
 
 		 115 aa  67.8  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 		 122 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0798  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.17 
 
 		 259 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3551  demethylmenaquinone methyltransferase  37.7 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>