More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1224 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  100 
 
 		 206 aa  433  1e-121  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  84.95 
 
 		 206 aa  376  1e-103  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  46.7 
 
 		 212 aa  211  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.93 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.93 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.1 
 
 		 420 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  34.08 
 
 		 310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  33.52 
 
 		 307 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 305 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 309 aa  104  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 337 aa  102  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  31.11 
 
 		 307 aa  101  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 348 aa  101  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  29.35 
 
 		 306 aa  100  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  31.18 
 
 		 305 aa  98.2  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  30.98 
 
 		 307 aa  96.7  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 340 aa  94.4  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  29.57 
 
 		 312 aa  93.6  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  31.71 
 
 		 335 aa  93.2  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  32.22 
 
 		 309 aa  92.8  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  29.67 
 
 		 354 aa  91.3  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  29.67 
 
 		 349 aa  91.3  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 339 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 341 aa  90.5  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 330 aa  90.5  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 317 aa  91.3  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 341 aa  90.5  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  29.95 
 
 		 328 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  28.86 
 
 		 341 aa  87.8  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  28.09 
 
 		 342 aa  87  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 327 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2305  transcriptional regulator, ArsR family  28.26 
 
 		 311 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0356  ArsR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 304 aa  81.6  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.208931  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  31.4 
 
 		 341 aa  80.9  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  27.7 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07110  ArsR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0650  putative transcriptional regulator  33.15 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0808  transcriptional regulator, ArsR family  33.52 
 
 		 324 aa  78.6  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.203378 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1067  transcriptional regulator, ArsR family  30.14 
 
 		 305 aa  78.6  0.00000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.420275 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  28.49 
 
 		 349 aa  78.2  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  32.81 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  30.41 
 
 		 341 aa  75.9  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  30.41 
 
 		 341 aa  75.5  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5268  ArsR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 331 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0173  transcriptional regulator, ArsR family  32.12 
 
 		 326 aa  75.5  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.7 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  35.82 
 
 		 295 aa  74.7  0.0000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0162  transcriptional regulator, ArsR family  31.61 
 
 		 326 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05540  ArsR family regulatory protein  31.28 
 
 		 336 aa  73.9  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0155  ArsR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5015  ArsR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 330 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1667 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  30.66 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2116  methyltransferase type 11  30.1 
 
 		 340 aa  72  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126777 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4966  ArsR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 330 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4839  ArsR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 330 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.96 
 
 		 248 aa  71.2  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1078  SAM-dependent methyltransferase  29.93 
 
 		 201 aa  71.2  0.000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.215412  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0384  transcriptional regulator, ArsR family  30 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0825  Methyltransferase type 12  29.1 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  27.01 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 341 aa  69.7  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 328 aa  68.9  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1238  methyltransferase type 11  26.92 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0160  methyltransferase type 11  32.9 
 
 		 322 aa  68.6  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0747842 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4278  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 186 aa  67.8  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.867588  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2811  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.481855  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4328  Methyltransferase type 11  35.58 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0500  ArsR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 330 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  29.08 
 
 		 309 aa  67  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4793  regulatory protein, ArsR  28.33 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  29.08 
 
 		 331 aa  65.9  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2402  ArsR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 323 aa  65.9  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  32.79 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2897  Methyltransferase type 11  28.47 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  25.55 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1181  Methyltransferase type 11  36.13 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.694662  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0471  ArsR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.421006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0798  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.01 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  27.75 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1251  methyltransferase, putative  30.59 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  25.82 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2820  methyltransferase type 11  33.59 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.219288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  30.52 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 411 aa  62.4  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1110  hypothetical protein  29.03 
 
 		 267 aa  62  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  33.33 
 
 		 312 aa  62  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  35.04 
 
 		 409 aa  62  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  33.91 
 
 		 267 aa  62  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1535  methyltransferase type 11  32.81 
 
 		 265 aa  62  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0615869  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2029  Methyltransferase type 12  26.67 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 265 aa  61.2  0.000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  34.55 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  25.13 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  30.58 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3041  methyltransferase type 11  29.77 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>