More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1223 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 219 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  48.83 
 
 		 218 aa  221  6e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  47 
 
 		 218 aa  197  9e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1251  methyltransferase, putative  48.85 
 
 		 229 aa  196  3e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0825  Methyltransferase type 12  44.65 
 
 		 216 aa  191  1e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1238  methyltransferase type 11  46.23 
 
 		 219 aa  190  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0204  Methyltransferase type 12  43 
 
 		 203 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0885  methyltransferase, putative  41.86 
 
 		 214 aa  154  7e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.784579  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0864  methyltransferase type 12  37.44 
 
 		 204 aa  154  9e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000143474  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1055  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  37.8 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.265378 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  37.86 
 
 		 210 aa  148  8e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  34.45 
 
 		 209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  34.93 
 
 		 209 aa  143  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2544  methyltransferase type 12  36.19 
 
 		 200 aa  132  5e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1466  Methyltransferase type 12  38.31 
 
 		 199 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1392  putative S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  32.68 
 
 		 208 aa  124  9e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0586874  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2810  methyltransferase type 12  34.13 
 
 		 207 aa  121  8e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4039  methyltransferase type 12  34.74 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.668919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2029  Methyltransferase type 12  33 
 
 		 215 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1449  methyltransferase, putative  34.3 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02405  methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14390)  32.46 
 
 		 258 aa  98.2  9e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1649  Methyltransferase type 12  30.37 
 
 		 200 aa  88.2  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.70723e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1469  Methyltransferase type 12  26.7 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  25.95 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001478  SAM-dependent methyltransferase  25.96 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.544466  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0221  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.664721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.15 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  28.81 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  27.93 
 
 		 312 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  27.6 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.15 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  31.47 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10090  methyltransferase  29.92 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.542368  normal  0.16327 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30108  methyltransferase  28.82 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.101863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  26.32 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  25.82 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.34 
 
 		 244 aa  62  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 349 aa  61.6  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  29.13 
 
 		 259 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0403  putative methyltransferase  23.36 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00297063  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  28.33 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  28.33 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4583  Methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.130075 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  37.76 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05419  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.77 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  28.37 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.61 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  32.23 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0960  methyltransferase  29.73 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  27.66 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  27.66 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  27.66 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  27.66 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  27.66 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0356  ArsR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.208931  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  27.66 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  27.66 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  28.24 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  24.04 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0996  Methyltransferase type 11  27 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.73 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.9 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3858  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  26.58 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1029  methyltransferase type 11  27.61 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  29.2 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7789  Methyltransferase type 11  27.91 
 
 		 276 aa  58.2  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.527057 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  29.2 
 
 		 254 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3471  methyltransferase type 11  26.24 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  27.18 
 
 		 259 aa  58.2  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.2 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  30.34 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  28.65 
 
 		 2490 aa  57.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  28.36 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2807  methyltransferase type 11  26.39 
 
 		 341 aa  57.8  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.160359  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  28.03 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.61 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  24.31 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.17 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  28.16 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4055  putative methyltransferase  28.68 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  28.97 
 
 		 254 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  28.69 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  32.23 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9102  hypothetical protein  26.97 
 
 		 268 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.84 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2290  Methyltransferase type 11  31.21 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  22.51 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  27.07 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0530  putative methylase  30.84 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  25.73 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  28.37 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.186171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>