More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0774 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 254 aa  513  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  100 
 
 		 254 aa  513  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4043  Methyltransferase type 11  60 
 
 		 250 aa  279  4e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3930  Methyltransferase type 11  60 
 
 		 250 aa  279  4e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.56855 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  55.82 
 
 		 250 aa  263  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  55.2 
 
 		 251 aa  263  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  52.21 
 
 		 250 aa  263  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  54.86 
 
 		 256 aa  261  8e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  55.02 
 
 		 250 aa  258  7e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  53.41 
 
 		 250 aa  258  9e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  55.02 
 
 		 250 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  55.02 
 
 		 250 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  55.82 
 
 		 250 aa  256  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  52.61 
 
 		 250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  54.76 
 
 		 250 aa  251  7e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  54.76 
 
 		 250 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0336  methyltransferase type 11  54.32 
 
 		 261 aa  249  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.549644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  52.26 
 
 		 256 aa  249  4e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  52.67 
 
 		 256 aa  249  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  52.26 
 
 		 256 aa  248  6e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  50.2 
 
 		 257 aa  248  7e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1008  methyltransferase type 11  52.02 
 
 		 256 aa  246  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  53.6 
 
 		 251 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  53.6 
 
 		 251 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  53.2 
 
 		 251 aa  241  7e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  51.44 
 
 		 256 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  50.81 
 
 		 255 aa  241  9e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  47.43 
 
 		 258 aa  240  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  54.17 
 
 		 259 aa  241  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  52.8 
 
 		 251 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  52.8 
 
 		 251 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  52.3 
 
 		 255 aa  240  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  52.8 
 
 		 251 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  52.8 
 
 		 251 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  52.52 
 
 		 254 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3440  Methyltransferase type 11  49.8 
 
 		 256 aa  238  5.999999999999999e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  53.16 
 
 		 261 aa  238  6.999999999999999e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  52.1 
 
 		 254 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  53.33 
 
 		 259 aa  236  4e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  51.68 
 
 		 254 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  51.24 
 
 		 253 aa  235  6e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  51.68 
 
 		 254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  52.92 
 
 		 259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0587  UbiE/COQ5 methyltransferase  50.39 
 
 		 261 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846793  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5564  methyltransferase type 11  56.67 
 
 		 258 aa  230  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  48.15 
 
 		 256 aa  229  3e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0249  Methyltransferase type 11  51 
 
 		 260 aa  229  5e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0220437  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  48.56 
 
 		 256 aa  225  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  48.56 
 
 		 256 aa  224  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  48.56 
 
 		 256 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  48.56 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  48.15 
 
 		 256 aa  221  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2729  SAM-dependent methyltransferase  45.04 
 
 		 264 aa  209  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  47.44 
 
 		 256 aa  208  7e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2361  methyltransferase type 11  50 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00203  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  50.25 
 
 		 207 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.224373  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3398  Methyltransferase type 11  50.75 
 
 		 207 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00208  hypothetical protein  50.25 
 
 		 207 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3455  methyltransferase type 11  49.75 
 
 		 207 aa  198  6e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.915003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0206  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  49.25 
 
 		 207 aa  196  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3145  hypothetical protein  49.46 
 
 		 204 aa  188  7e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.725921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3296  hypothetical protein  48.39 
 
 		 212 aa  187  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.114197  normal  0.0687983 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23770  putative biotin synthesis protein  52.81 
 
 		 187 aa  185  6e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0761957 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3284  methyltransferase type 11  49.4 
 
 		 173 aa  172  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.859694  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2339  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.26 
 
 		 261 aa  146  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260847 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1066  putative methyltransferase  35.5 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000495873  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2697  methyltransferase type 11  31.71 
 
 		 264 aa  143  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2621  methyltransferase  31.4 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.548426  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2695  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.99 
 
 		 258 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0592543  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2644  methyltransferase  30.99 
 
 		 261 aa  142  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0423484  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2890  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.99 
 
 		 258 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2906  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.45 
 
 		 261 aa  142  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2893  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.99 
 
 		 261 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234775 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2929  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.99 
 
 		 261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00250227  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2941  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.99 
 
 		 261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000113284  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0301  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.67 
 
 		 257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0798  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.3 
 
 		 259 aa  89  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4556  methyltransferase type 11  39.75 
 
 		 253 aa  88.6  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.17 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.29 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0587723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  31.69 
 
 		 207 aa  78.2  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2016  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.94 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3752  Methyltransferase type 11  33.71 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.51014  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  34.93 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.51 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  34.69 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.48 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87708  predicted protein  36.59 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  41.74 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  37.93 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.05 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.31 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0485  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.42 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.693247  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2013  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.54 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1848  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  38.32 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.329247 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  28.49 
 
 		 202 aa  72  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  42.48 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  36.43 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.29 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.45 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>