More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4556 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4556  methyltransferase type 11  100 
 
 		 253 aa  504  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0798  UbiE/COQ5 methyltransferase  43.03 
 
 		 259 aa  188  7e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  36.42 
 
 		 257 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  36.22 
 
 		 250 aa  109  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  35.53 
 
 		 250 aa  108  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  39.29 
 
 		 250 aa  105  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  35.54 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.5 
 
 		 251 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.37 
 
 		 251 aa  102  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.5 
 
 		 251 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  35.93 
 
 		 256 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  35.33 
 
 		 256 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.5 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3440  Methyltransferase type 11  34.68 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.5 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  35.93 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  35.93 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.5 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.5 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  35.33 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.94 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  35.68 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.73 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.33 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.71 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.93 
 
 		 251 aa  99.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 250 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.06 
 
 		 254 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4043  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3930  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.56855 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  33.72 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  36.47 
 
 		 254 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  33.17 
 
 		 256 aa  96.3  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  36.53 
 
 		 254 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  37.13 
 
 		 254 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  35.2 
 
 		 250 aa  95.5  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  48.08 
 
 		 225 aa  94.7  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  32.31 
 
 		 250 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  34.5 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  31.79 
 
 		 250 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2339  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.39 
 
 		 261 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260847 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  34.91 
 
 		 256 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.1 
 
 		 255 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  39.75 
 
 		 254 aa  92.4  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  39.75 
 
 		 254 aa  92.4  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  35.5 
 
 		 259 aa  92  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2621  methyltransferase  29.83 
 
 		 261 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.548426  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  35.5 
 
 		 259 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3370  Methyltransferase type 11  45.16 
 
 		 253 aa  91.3  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2695  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.67 
 
 		 258 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0592543  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2644  methyltransferase  29.67 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0423484  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2941  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.83 
 
 		 261 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000113284  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2893  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.67 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234775 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2890  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.67 
 
 		 258 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3752  Methyltransferase type 11  35.53 
 
 		 259 aa  90.9  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.51014  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2906  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.83 
 
 		 261 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  39.49 
 
 		 273 aa  89.7  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1066  putative methyltransferase  34.1 
 
 		 273 aa  89.7  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000495873  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5564  methyltransferase type 11  39.79 
 
 		 258 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1683  Methyltransferase type 11  49.11 
 
 		 287 aa  88.6  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.430407  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1607  Methyltransferase type 11  49.11 
 
 		 287 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  40.74 
 
 		 275 aa  87.8  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1008  methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  32.37 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  37.76 
 
 		 272 aa  87  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0587  UbiE/COQ5 methyltransferase  40.94 
 
 		 261 aa  86.3  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846793  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0301  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.84 
 
 		 257 aa  86.7  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 281 aa  85.9  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  41.13 
 
 		 256 aa  85.9  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  38.89 
 
 		 258 aa  85.5  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2697  methyltransferase type 11  29.83 
 
 		 264 aa  85.5  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147687  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0336  methyltransferase type 11  42.74 
 
 		 261 aa  85.1  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.549644  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2929  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.12 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00250227  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3145  hypothetical protein  39.05 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.725921  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1804  methyltransferase type 11  47.32 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4211  methyltransferase type 11  42.98 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4438  methyltransferase type 11  42.98 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  33.71 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1851  methyltransferase type 11  47.32 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.249225 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4277  methyltransferase type 11  42.98 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3296  hypothetical protein  39.05 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.114197  normal  0.0687983 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  35 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  41.18 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1785  methyltransferase type 11  47.32 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0456688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0249  Methyltransferase type 11  33.51 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0220437  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3028  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  38.84 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.57312  normal  0.365128 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4511  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  43.65 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  32.11 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  37.72 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  29.21 
 
 		 213 aa  81.3  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.25 
 
 		 201 aa  81.3  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  41.88 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  40.74 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  39.83 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.67 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  36.13 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4209  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  39.2 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1190  UbiE/COQ5 methyltransferase  44.04 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>