More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5294 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  100 
 
 
259 aa  509  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  88.8 
 
 
259 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  87.64 
 
 
259 aa  441  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0249  Methyltransferase type 11  60.08 
 
 
260 aa  260  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0220437  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0336  methyltransferase type 11  57.6 
 
 
261 aa  259  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.549644  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  52.96 
 
 
255 aa  257  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5564  methyltransferase type 11  62.06 
 
 
258 aa  254  8e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  53.39 
 
 
254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  53.78 
 
 
254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  51.76 
 
 
255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  52.99 
 
 
254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  51.21 
 
 
256 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  54.15 
 
 
258 aa  252  4.0000000000000004e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  50.81 
 
 
256 aa  251  6e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  49.8 
 
 
257 aa  251  6e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  52.59 
 
 
254 aa  251  7e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  50.4 
 
 
256 aa  251  1e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  51.41 
 
 
250 aa  249  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2361  methyltransferase type 11  59.68 
 
 
254 aa  248  5e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  50 
 
 
256 aa  248  8e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2729  SAM-dependent methyltransferase  52.23 
 
 
264 aa  246  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1008  methyltransferase type 11  52.96 
 
 
256 aa  245  4.9999999999999997e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  55.14 
 
 
256 aa  244  8e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  50.81 
 
 
256 aa  242  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  52.63 
 
 
253 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  50.81 
 
 
256 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  54.17 
 
 
254 aa  241  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  54.17 
 
 
254 aa  241  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  52.42 
 
 
256 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  50 
 
 
256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  48.02 
 
 
256 aa  239  4e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  50 
 
 
256 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  51.81 
 
 
250 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  49.6 
 
 
256 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3440  Methyltransferase type 11  48.22 
 
 
256 aa  237  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  53.63 
 
 
250 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3930  Methyltransferase type 11  56.85 
 
 
250 aa  237  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.56855 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4043  Methyltransferase type 11  56.85 
 
 
250 aa  237  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  52.02 
 
 
250 aa  235  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  53.63 
 
 
250 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  53.23 
 
 
250 aa  234  8e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  53.23 
 
 
250 aa  234  8e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  52.82 
 
 
250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  52.42 
 
 
250 aa  229  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  51.24 
 
 
261 aa  228  7e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  52.61 
 
 
251 aa  228  9e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  52.02 
 
 
250 aa  227  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0587  UbiE/COQ5 methyltransferase  51.59 
 
 
261 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  53.01 
 
 
251 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  53.01 
 
 
251 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  52.61 
 
 
251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  52.21 
 
 
251 aa  211  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  52.21 
 
 
251 aa  211  7e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  52.21 
 
 
251 aa  211  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  52.21 
 
 
251 aa  211  7e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3398  Methyltransferase type 11  49.25 
 
 
207 aa  193  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00203  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  48.76 
 
 
207 aa  192  5e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.224373  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00208  hypothetical protein  48.76 
 
 
207 aa  192  5e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3455  methyltransferase type 11  48.26 
 
 
207 aa  190  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.915003  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0206  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  48.76 
 
 
207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23770  putative biotin synthesis protein  53.3 
 
 
187 aa  184  8e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0761957 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3145  hypothetical protein  46.53 
 
 
204 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.725921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3296  hypothetical protein  46.53 
 
 
212 aa  180  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.114197  normal  0.0687983 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3284  methyltransferase type 11  50.9 
 
 
173 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.859694  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1066  putative methyltransferase  35.51 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000495873  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2339  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.62 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260847 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2906  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.62 
 
 
261 aa  137  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2697  methyltransferase type 11  31.62 
 
 
264 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2621  methyltransferase  30.25 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.548426  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2893  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.83 
 
 
261 aa  132  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234775 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2695  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.41 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0592543  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2644  methyltransferase  29.41 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0423484  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2890  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.41 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2929  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.83 
 
 
261 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00250227  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2941  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.83 
 
 
261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000113284  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0301  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.35 
 
 
257 aa  102  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4556  methyltransferase type 11  34.5 
 
 
253 aa  92.8  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3752  Methyltransferase type 11  35.45 
 
 
259 aa  87.8  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.51014  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0798  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.64 
 
 
259 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  33.5 
 
 
267 aa  76.3  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.75 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  42.34 
 
 
339 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  39.86 
 
 
327 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.94 
 
 
223 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.11 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.19 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  28.57 
 
 
258 aa  72  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  40.38 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1717  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 
239 aa  71.6  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1836  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  30.19 
 
 
246 aa  71.6  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  29.8 
 
 
213 aa  71.2  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  38.64 
 
 
349 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  38.64 
 
 
354 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.67 
 
 
283 aa  69.3  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1761  DNA topoisomerase II  28.45 
 
 
658 aa  68.9  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 
342 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  28.84 
 
 
206 aa  68.2  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1201  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.61 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.32 
 
 
276 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>