More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1599 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  98.02 
 
 		 354 aa  661    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  100 
 
 		 349 aa  676    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  92.69 
 
 		 342 aa  611  9.999999999999999e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  78.35 
 
 		 339 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  79.05 
 
 		 328 aa  483  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  77.53 
 
 		 327 aa  480  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  55.23 
 
 		 337 aa  335  7.999999999999999e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  56.84 
 
 		 349 aa  316  4e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  52.01 
 
 		 341 aa  310  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  52.32 
 
 		 341 aa  308  5.9999999999999995e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  52.01 
 
 		 341 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  55.66 
 
 		 335 aa  300  2e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  54.98 
 
 		 340 aa  296  3e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2116  methyltransferase type 11  50.96 
 
 		 340 aa  293  4e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126777 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  50.6 
 
 		 341 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  50.99 
 
 		 341 aa  284  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  50.47 
 
 		 341 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 337 aa  266  4e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  50.45 
 
 		 330 aa  259  5.0000000000000005e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  47.87 
 
 		 317 aa  251  1e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3410  ArsR family transcriptional regulator  49.35 
 
 		 329 aa  246  4.9999999999999997e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0187563  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0808  transcriptional regulator, ArsR family  48.02 
 
 		 324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.203378 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  43.83 
 
 		 341 aa  227  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2402  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 323 aa  224  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  45.69 
 
 		 328 aa  219  5e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  37.62 
 
 		 305 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  38.08 
 
 		 306 aa  172  9e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  36.54 
 
 		 309 aa  159  5e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 309 aa  156  6e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  35.67 
 
 		 305 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 348 aa  155  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  35.83 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  35.33 
 
 		 307 aa  153  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  37.89 
 
 		 307 aa  149  8e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  34.39 
 
 		 307 aa  142  7e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  34.83 
 
 		 312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2305  transcriptional regulator, ArsR family  37.01 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1067  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 305 aa  128  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.420275 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 312 aa  125  8.000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07110  ArsR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 333 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0650  putative transcriptional regulator  35.39 
 
 		 329 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  36.2 
 
 		 309 aa  125  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05540  ArsR family regulatory protein  34.54 
 
 		 336 aa  124  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  36.01 
 
 		 331 aa  122  8e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 334 aa  122  9e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0356  ArsR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.208931  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0160  methyltransferase type 11  38.17 
 
 		 322 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0747842 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5268  ArsR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 331 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4793  regulatory protein, ArsR  33.99 
 
 		 331 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5015  ArsR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 330 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1667 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4966  ArsR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 330 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4839  ArsR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 330 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0384  transcriptional regulator, ArsR family  32.36 
 
 		 331 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3041  methyltransferase type 11  29.97 
 
 		 333 aa  114  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0500  ArsR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1232  ArsR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1265  transcriptional regulator  32.97 
 
 		 309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0162  transcriptional regulator, ArsR family  36.45 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0173  transcriptional regulator, ArsR family  36.93 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0471  ArsR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 335 aa  103  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.421006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0155  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 		 326 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  29.19 
 
 		 206 aa  93.6  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  29.67 
 
 		 206 aa  91.3  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25.84 
 
 		 207 aa  87.8  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  39.29 
 
 		 258 aa  87  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.78 
 
 		 420 aa  86.7  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25.28 
 
 		 207 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  28.12 
 
 		 355 aa  82.8  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41 
 
 		 250 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  33.7 
 
 		 212 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1238  methyltransferase type 11  27.4 
 
 		 219 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  49.41 
 
 		 120 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.14 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  49.41 
 
 		 125 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  43 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  42.99 
 
 		 124 aa  74.3  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3724  methyltransferase type 11  40.48 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.29 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  39.53 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  48.24 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  38.41 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03490  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.05 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04480  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.52 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.110079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  37.96 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.51 
 
 		 255 aa  72.4  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  41.11 
 
 		 95 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1279  UbiE/COQ5 methyltransferase  39 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0352  Methyltransferase type 11  36.54 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  37.96 
 
 		 213 aa  72  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 131 aa  71.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  42 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 120 aa  71.2  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  39.52 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  35.51 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2984  methyltransferase type 11  38.3 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452511  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  38.24 
 
 		 117 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  34.44 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  41.12 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>