More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2181 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  100 
 
 
250 aa  502  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  80.32 
 
 
250 aa  413  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  81.53 
 
 
250 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  74 
 
 
251 aa  378  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  73.09 
 
 
250 aa  370  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  73.09 
 
 
250 aa  370  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  72.69 
 
 
250 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  74.8 
 
 
251 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  72.29 
 
 
250 aa  364  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  74.8 
 
 
251 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  72.29 
 
 
250 aa  362  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  72.29 
 
 
250 aa  362  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  74 
 
 
251 aa  362  4e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  74 
 
 
251 aa  362  4e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  74 
 
 
251 aa  362  4e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  74 
 
 
251 aa  362  4e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  72.29 
 
 
250 aa  361  6e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  73.6 
 
 
251 aa  359  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  59.13 
 
 
256 aa  281  5.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  55.82 
 
 
257 aa  275  6e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0587  UbiE/COQ5 methyltransferase  56.98 
 
 
261 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846793  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  54.47 
 
 
255 aa  261  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  53.41 
 
 
254 aa  258  9e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  53.41 
 
 
254 aa  258  9e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  54.29 
 
 
254 aa  255  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3440  Methyltransferase type 11  53.85 
 
 
256 aa  255  5e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  54.07 
 
 
254 aa  254  9e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3930  Methyltransferase type 11  53.01 
 
 
250 aa  254  9e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.56855 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4043  Methyltransferase type 11  53.01 
 
 
250 aa  254  9e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  54.66 
 
 
256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  54.66 
 
 
256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  54.66 
 
 
256 aa  253  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  54.66 
 
 
256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  53.85 
 
 
256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0336  methyltransferase type 11  54.66 
 
 
261 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.549644  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1008  methyltransferase type 11  54.84 
 
 
256 aa  253  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  53.47 
 
 
253 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  53.66 
 
 
254 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  53.44 
 
 
256 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  53.88 
 
 
254 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  54.25 
 
 
256 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  53.04 
 
 
256 aa  251  1e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  52.63 
 
 
256 aa  249  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  51.01 
 
 
255 aa  248  6e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  52.42 
 
 
256 aa  247  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  53.82 
 
 
259 aa  239  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  53.41 
 
 
259 aa  239  4e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5564  methyltransferase type 11  55.65 
 
 
258 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  52.02 
 
 
259 aa  235  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  48.99 
 
 
258 aa  235  6e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0249  Methyltransferase type 11  52.21 
 
 
260 aa  233  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0220437  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  49.38 
 
 
261 aa  231  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2729  SAM-dependent methyltransferase  44.94 
 
 
264 aa  218  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  50.21 
 
 
256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2361  methyltransferase type 11  49.19 
 
 
254 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23770  putative biotin synthesis protein  54.4 
 
 
187 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0761957 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00203  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  49.25 
 
 
207 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.224373  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00208  hypothetical protein  49.25 
 
 
207 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3145  hypothetical protein  49.46 
 
 
204 aa  186  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.725921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3296  hypothetical protein  49.46 
 
 
212 aa  186  4e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.114197  normal  0.0687983 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3455  methyltransferase type 11  48.76 
 
 
207 aa  185  8e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.915003  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0206  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  48.76 
 
 
207 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3398  Methyltransferase type 11  48.26 
 
 
207 aa  182  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3284  methyltransferase type 11  50 
 
 
173 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.859694  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2339  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.05 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260847 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2929  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.49 
 
 
261 aa  135  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00250227  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2697  methyltransferase type 11  31.14 
 
 
264 aa  134  9e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147687  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1066  putative methyltransferase  34.2 
 
 
273 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000495873  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2644  methyltransferase  29.06 
 
 
261 aa  133  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0423484  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2621  methyltransferase  29.06 
 
 
261 aa  133  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.548426  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2906  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.77 
 
 
261 aa  133  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2695  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.06 
 
 
258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0592543  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2890  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.06 
 
 
258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2893  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  28.63 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234775 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2941  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  28.63 
 
 
261 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000113284  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0301  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.42 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4556  methyltransferase type 11  36.22 
 
 
253 aa  101  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0798  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.55 
 
 
259 aa  94  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.17 
 
 
207 aa  79  0.00000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  36.31 
 
 
335 aa  76.3  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
233 aa  75.5  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.63 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  35.21 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  37.38 
 
 
280 aa  73.6  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  40 
 
 
415 aa  73.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  27.5 
 
 
213 aa  73.2  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  37.38 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  37.07 
 
 
251 aa  73.2  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  40.54 
 
 
409 aa  73.2  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  37.38 
 
 
277 aa  72.8  0.000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  29.03 
 
 
236 aa  72.4  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  33.16 
 
 
260 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1717  Methyltransferase type 11  35.76 
 
 
239 aa  72  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  38.66 
 
 
209 aa  72  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  27.84 
 
 
259 aa  71.6  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 
225 aa  72  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0400  methyltransferase type 11  40.35 
 
 
248 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.555595  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  29.27 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  38.32 
 
 
265 aa  70.5  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  37.38 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>