More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0078 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  100 
 
 		 259 aa  534  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  65.74 
 
 		 257 aa  344  7e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  58.5 
 
 		 255 aa  314  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  55.38 
 
 		 255 aa  276  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  54.37 
 
 		 256 aa  268  5e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  53.17 
 
 		 260 aa  267  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  51.2 
 
 		 255 aa  266  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0663  hypothetical protein  50.6 
 
 		 255 aa  261  6e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  42.63 
 
 		 239 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  42.63 
 
 		 239 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  42.63 
 
 		 239 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  41.7 
 
 		 243 aa  172  5e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  40.08 
 
 		 246 aa  171  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  41.35 
 
 		 242 aa  170  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  35.36 
 
 		 247 aa  149  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  37.27 
 
 		 256 aa  150  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  35.56 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  38.14 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6308  Methyltransferase type 11  34.7 
 
 		 263 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  47.26 
 
 		 271 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 243 aa  133  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  51.88 
 
 		 245 aa  131  7.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 257 aa  129  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  39.71 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  35.53 
 
 		 270 aa  123  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 252 aa  122  8e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86084  methyltransferase  25.33 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0255585 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1362  hypothetical protein  38.16 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.40676e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1167  methyltransferase  38.16 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1725  Methyltransferase type 11  31.66 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.873166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1428  hypothetical protein  38.16 
 
 		 251 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.097485  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1188  hypothetical protein  37.5 
 
 		 251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.304723  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1282  hypothetical protein  37.5 
 
 		 251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3523  Methyltransferase type 11  41.01 
 
 		 257 aa  108  7.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1169  methyltransferase  37.5 
 
 		 251 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.374772  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0618  Methyltransferase type 11  34.01 
 
 		 249 aa  105  7e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.269288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  38.51 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1326  hypothetical protein  37.5 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0692  methyltransferase type 11  42.19 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27240  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.32 
 
 		 308 aa  102  6e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00809  hypothetical protein  39.44 
 
 		 242 aa  99.8  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721636  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  40.77 
 
 		 265 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6142  methyltransferase type 11  33.03 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3409  type 11 methyltransferase  30.87 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2996  methyltransferase type 11  35.61 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03990  expressed protein  26.47 
 
 		 364 aa  81.3  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.50925  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3652  Methyltransferase type 11  35.34 
 
 		 266 aa  78.6  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39.75 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.76501  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  35.48 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1419  putative methyltransferase  32.33 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.412346  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1753  putative methyltransferase  32.33 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.148038  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0017  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0407189 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0455  methyltransferase type 11  34.64 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3076  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.851189  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5476  Methyltransferase type 11  27.75 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608762  normal  0.384797 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2883  methyltransferase type 11  34.08 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0898399  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  28.65 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4070  MerR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.487071  normal  0.354959 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20830  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  44.23 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  38.84 
 
 		 225 aa  72  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0795  hypothetical protein  37.7 
 
 		 250 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  27.84 
 
 		 250 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  34.72 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0383  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  41.67 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  31.68 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3543  Methyltransferase type 11  33.77 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1471  Methyltransferase type 11  33.81 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  41.67 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  32.65 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  41.67 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  41.67 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6503  Methyltransferase type 11  33.85 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2163  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal  0.0704024 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  41.67 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1457  Methyltransferase type 12  36.81 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.129024  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  41.67 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  27.46 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4501  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.162908 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  33.78 
 
 		 255 aa  68.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0563  Methyltransferase type 11  34.35 
 
 		 253 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.267542  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  40.74 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3927  methyltransferase type 11  34.19 
 
 		 228 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.852956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5511  methyltransferase  35.56 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.139687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0842  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.18 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3305  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  42.31 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2174  Methyltransferase type 11  34.88 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0827328  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9140  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.59 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1638  Methyltransferase type 11  37.74 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  0.179609 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1418  putative methyltransferase  31.54 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.282901  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3567  Methyltransferase type 11  31.16 
 
 		 242 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197641  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.34 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2874  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.41 
 
 		 273 aa  67  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.34 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0503  hypothetical protein  27.82 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.61991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.34 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0981  methyltransferase type 11  35.43 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3569  methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1752  putative methyltransferase  30.77 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.610135  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  34.75 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>