More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0606 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  100 
 
 
254 aa  491  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  46.22 
 
 
256 aa  177  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  44.67 
 
 
242 aa  175  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  45.31 
 
 
247 aa  171  7.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  43.67 
 
 
246 aa  169  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  42.39 
 
 
243 aa  168  7e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  44.44 
 
 
275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  42.44 
 
 
239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  42.37 
 
 
239 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  42.37 
 
 
239 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  50 
 
 
243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  39.05 
 
 
259 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  40.16 
 
 
255 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  44.26 
 
 
271 aa  156  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6308  Methyltransferase type 11  39.75 
 
 
263 aa  152  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  46.67 
 
 
245 aa  149  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  45 
 
 
270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  40.08 
 
 
255 aa  145  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  36.73 
 
 
257 aa  145  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  35.56 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0663  hypothetical protein  37.65 
 
 
255 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  36.93 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  36.51 
 
 
252 aa  132  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  37.65 
 
 
257 aa  131  9e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  40.16 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  41.54 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  35.62 
 
 
254 aa  115  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0618  Methyltransferase type 11  32.48 
 
 
249 aa  107  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.269288  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27240  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.72 
 
 
308 aa  103  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.15 
 
 
265 aa  102  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1362  hypothetical protein  32.93 
 
 
251 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.40676e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1188  hypothetical protein  25.76 
 
 
251 aa  99.8  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.304723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1167  methyltransferase  25.76 
 
 
251 aa  99.8  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1282  hypothetical protein  25.76 
 
 
251 aa  99.8  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1169  methyltransferase  25.33 
 
 
251 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.374772  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1428  hypothetical protein  31.71 
 
 
251 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.097485  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1326  hypothetical protein  31.74 
 
 
251 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3409  type 11 methyltransferase  36.6 
 
 
263 aa  94.4  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00809  hypothetical protein  32.49 
 
 
242 aa  94  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721636  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1725  Methyltransferase type 11  33.2 
 
 
256 aa  94  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.873166  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3523  Methyltransferase type 11  38.69 
 
 
257 aa  92.8  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0692  methyltransferase type 11  37.41 
 
 
252 aa  90.5  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2996  methyltransferase type 11  33.47 
 
 
273 aa  88.6  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6142  methyltransferase type 11  31.15 
 
 
261 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48660  Methyltransferase type 11 protein  41.98 
 
 
254 aa  83.2  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302894  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.83 
 
 
280 aa  80.9  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.76501  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2792  hypothetical protein  40.8 
 
 
250 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1748  hypothetical protein  37.9 
 
 
253 aa  77  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6503  Methyltransferase type 11  37.98 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4501  methyltransferase type 11  44.66 
 
 
249 aa  77  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.162908 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86084  methyltransferase  27.74 
 
 
333 aa  77  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0255585 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0445  Methyltransferase type 11  35.77 
 
 
252 aa  75.9  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00103969  normal  0.712757 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3241  Methyltransferase type 11  42.19 
 
 
255 aa  75.9  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3140  Methyltransferase type 11  42.19 
 
 
255 aa  75.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3042  methyltransferase type 11  42.19 
 
 
254 aa  75.5  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1760  type 11 methyltransferase  39.29 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0795  hypothetical protein  38.46 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2163  Methyltransferase type 11  45.19 
 
 
284 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal  0.0704024 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4141  methyltransferase type 11  42.65 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2174  Methyltransferase type 11  35.04 
 
 
276 aa  74.3  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0827328  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  40.52 
 
 
226 aa  73.6  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0563  Methyltransferase type 11  37.8 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.267542  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3369  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.209889  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2733  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  31.75 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  40.52 
 
 
226 aa  72.8  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3133  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 
246 aa  72.4  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998668  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2869  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 
275 aa  72  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4078  methyltransferase type 11  38.81 
 
 
259 aa  71.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  40.56 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3953  methyltransferase type 11  39.06 
 
 
250 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13690  putative methyltransferase  36.69 
 
 
249 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.784995  normal  0.84173 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  28.23 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2169  hypothetical protein  37.06 
 
 
248 aa  69.3  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0210043 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4099  methyltransferase type 11  39.81 
 
 
248 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29470  hypothetical protein  38.28 
 
 
250 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4175  methyltransferase type 11  39.81 
 
 
248 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14805  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0132  Methyltransferase type 11  37.25 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0017  Methyltransferase type 11  35.04 
 
 
254 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0407189 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  40.78 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4001  Methyltransferase type 11  38.17 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1471  Methyltransferase type 11  41.13 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3569  methyltransferase type 11  40 
 
 
208 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4526  methyltransferase type 11  41.22 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0503  hypothetical protein  25.41 
 
 
278 aa  67  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.61991  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3543  Methyltransferase type 11  37.09 
 
 
261 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0383  Methyltransferase type 11  25.94 
 
 
277 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5557  Methyltransferase type 12  40.15 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4330  methyltransferase type 11  38.89 
 
 
248 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.510233  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  47.37 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.5 
 
 
250 aa  65.9  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  39.26 
 
 
251 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  39.26 
 
 
251 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 
252 aa  65.9  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  45.54 
 
 
274 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  35.16 
 
 
268 aa  65.5  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25.81 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  38.26 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  39.62 
 
 
268 aa  65.5  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  39.8 
 
 
305 aa  65.5  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>