More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2883 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  525  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  65.74 
 
 		 259 aa  344  7e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  53.78 
 
 		 255 aa  285  7e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  54.15 
 
 		 255 aa  277  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0663  hypothetical protein  50.2 
 
 		 255 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  49.8 
 
 		 255 aa  264  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  52.12 
 
 		 260 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  52.76 
 
 		 256 aa  255  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  40.08 
 
 		 246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  40.08 
 
 		 243 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  40.25 
 
 		 239 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  40.25 
 
 		 239 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  40.93 
 
 		 239 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  40.4 
 
 		 242 aa  159  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  38.43 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  38.82 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  36.78 
 
 		 247 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  36.73 
 
 		 254 aa  145  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6308  Methyltransferase type 11  38 
 
 		 263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  33.59 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  39.9 
 
 		 243 aa  132  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  37.65 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  36.09 
 
 		 259 aa  129  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  35.39 
 
 		 252 aa  128  8.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  35.37 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 270 aa  122  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86084  methyltransferase  28.72 
 
 		 333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0255585 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1725  Methyltransferase type 11  46.09 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.873166  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1188  hypothetical protein  38.24 
 
 		 251 aa  102  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.304723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1167  methyltransferase  38.24 
 
 		 251 aa  102  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1282  hypothetical protein  38.24 
 
 		 251 aa  102  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1169  methyltransferase  38.24 
 
 		 251 aa  102  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.374772  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1362  hypothetical protein  37.5 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.40676e-29 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1428  hypothetical protein  37.5 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.097485  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2996  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  39.51 
 
 		 254 aa  99.4  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3523  Methyltransferase type 11  41.61 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1326  hypothetical protein  37.4 
 
 		 251 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0618  Methyltransferase type 11  31.71 
 
 		 249 aa  94.7  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.269288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00809  hypothetical protein  43.41 
 
 		 242 aa  93.2  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721636  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0692  methyltransferase type 11  40.62 
 
 		 252 aa  93.2  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.75 
 
 		 265 aa  89.7  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27240  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.77 
 
 		 308 aa  86.7  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3409  type 11 methyltransferase  30.08 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03990  expressed protein  28.06 
 
 		 364 aa  80.9  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.50925  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2174  Methyltransferase type 11  40.31 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0827328  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6142  methyltransferase type 11  31.13 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3652  Methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39.39 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.76501  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  36.72 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0017  Methyltransferase type 11  28.79 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0407189 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3042  methyltransferase type 11  33.78 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2733  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3369  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.209889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3140  Methyltransferase type 11  33.78 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3241  Methyltransferase type 11  33.78 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3543  Methyltransferase type 11  33.8 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  41.28 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2163  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal  0.0704024 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1654  methyltransferase type 11  28.92 
 
 		 173 aa  67  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.682174  hitchhiker  0.00196009 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2918  Methyltransferase type 11  33.1 
 
 		 264 aa  67  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1418  putative methyltransferase  33.33 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.282901  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5557  Methyltransferase type 12  36.64 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0383  Methyltransferase type 11  28.03 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4070  MerR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.487071  normal  0.354959 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4328  Methyltransferase type 11  35.88 
 
 		 188 aa  65.1  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0455  methyltransferase type 11  36.29 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2517  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000257486 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  30.11 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1753  putative methyltransferase  29.93 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.148038  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0410  Methyltransferase type 11  27.23 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.371089 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3567  Methyltransferase type 11  38.33 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197641  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1419  putative methyltransferase  29.93 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.412346  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1752  putative methyltransferase  30.56 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.610135  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  39.62 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0503  hypothetical protein  26.32 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.61991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  34.93 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5511  methyltransferase  30.07 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.139687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  35.61 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  39.78 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4278  Methyltransferase type 11  37.27 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.867588  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0795  hypothetical protein  34.71 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0842  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  42.55 
 
 		 235 aa  62  0.000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3305  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2792  hypothetical protein  34.71 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4501  methyltransferase type 11  37.89 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.162908 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13690  putative methyltransferase  31.65 
 
 		 249 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.784995  normal  0.84173 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3326  Methyltransferase type 11  36.61 
 
 		 186 aa  61.6  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2798  methyltransferase type 11  30.99 
 
 		 272 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1471  Methyltransferase type 11  35.48 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  34.51 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.41 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  41.67 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1760  type 11 methyltransferase  25.94 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.4 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  27.44 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0445  Methyltransferase type 11  28.92 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00103969  normal  0.712757 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2357  biotin biosynthesis protein BioC  29.55 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5476  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608762  normal  0.384797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>