195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5557 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5557  Methyltransferase type 12  100 
 
 
257 aa  516  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2996  methyltransferase type 11  40.71 
 
 
273 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1471  Methyltransferase type 11  39.75 
 
 
256 aa  133  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3652  Methyltransferase type 11  36.47 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2869  Methyltransferase type 11  30.5 
 
 
275 aa  87.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2163  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 
284 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal  0.0704024 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1760  type 11 methyltransferase  29.89 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  32.56 
 
 
247 aa  81.3  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3409  type 11 methyltransferase  39.1 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3523  Methyltransferase type 11  31.63 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1533  Methyltransferase type 12  25.87 
 
 
259 aa  79  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295316  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  38.35 
 
 
260 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  31.65 
 
 
243 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5336  hypothetical protein  30.68 
 
 
274 aa  76.3  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671975  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  31.14 
 
 
255 aa  75.9  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0383  Methyltransferase type 11  33.58 
 
 
277 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  29.24 
 
 
246 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  35.34 
 
 
255 aa  73.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  31.1 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4141  methyltransferase type 11  27.91 
 
 
273 aa  72.4  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2918  Methyltransferase type 11  27.73 
 
 
264 aa  72.4  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  33.83 
 
 
255 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  29.96 
 
 
242 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  40.15 
 
 
254 aa  71.6  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0503  hypothetical protein  24.71 
 
 
278 aa  70.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.61991  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  36.64 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.84 
 
 
265 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  28.76 
 
 
239 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  35.11 
 
 
259 aa  69.7  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1457  Methyltransferase type 12  35.11 
 
 
248 aa  69.3  0.00000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.129024  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2382  Methyltransferase type 11  29.1 
 
 
495 aa  69.3  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.571429  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6308  Methyltransferase type 11  32.84 
 
 
263 aa  68.9  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  28.33 
 
 
239 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  28.33 
 
 
239 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0663  hypothetical protein  33.08 
 
 
255 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 
254 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0692  methyltransferase type 11  28.21 
 
 
252 aa  64.7  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1362  hypothetical protein  28.28 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.40676e-29 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1428  hypothetical protein  28.28 
 
 
251 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.097485  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6142  methyltransferase type 11  32.18 
 
 
261 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1167  methyltransferase  27.03 
 
 
251 aa  62.8  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1169  methyltransferase  26.9 
 
 
251 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.374772  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1188  hypothetical protein  27.59 
 
 
251 aa  62.4  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.304723  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1282  hypothetical protein  27.59 
 
 
251 aa  62.4  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  34.64 
 
 
259 aa  62.4  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2192  methyltransferase type 11  32.12 
 
 
279 aa  62  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4001  Methyltransferase type 11  26.45 
 
 
248 aa  62  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  40.68 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1326  hypothetical protein  27.82 
 
 
251 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  41.24 
 
 
243 aa  61.2  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  35.82 
 
 
256 aa  60.1  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  24.52 
 
 
267 aa  59.7  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  26 
 
 
252 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0618  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 
249 aa  58.2  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.269288  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2174  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
276 aa  58.5  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0827328  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  32.58 
 
 
256 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3567  Methyltransferase type 11  38.17 
 
 
242 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197641  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00809  hypothetical protein  34.65 
 
 
242 aa  58.5  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721636  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  33.58 
 
 
245 aa  57.4  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  28.5 
 
 
257 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  34.81 
 
 
271 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1725  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 
256 aa  55.8  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.873166  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0200  hypothetical protein  30.6 
 
 
311 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3479  methyltransferase type 11  37.84 
 
 
252 aa  55.5  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0924796 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4141  putative methyltransferase  31.54 
 
 
273 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.34511  normal  0.0273084 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1418  putative methyltransferase  25.58 
 
 
259 aa  53.1  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.282901  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3418  methyltransferase type 11  38.98 
 
 
254 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.268365  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  26.57 
 
 
269 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48590  hypothetical protein  27.78 
 
 
248 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00740974  normal  0.0133617 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5296  Methyltransferase type 11  26.94 
 
 
282 aa  52.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.374487  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  25.87 
 
 
269 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0381  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.43 
 
 
261 aa  52  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.111253  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  32.41 
 
 
258 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0301  Methyltransferase type 12  33.86 
 
 
243 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0017  Methyltransferase type 11  24.54 
 
 
254 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0407189 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13690  putative methyltransferase  30.6 
 
 
249 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.784995  normal  0.84173 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1226  hypothetical protein  29.01 
 
 
249 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3543  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
261 aa  50.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2287  Methyltransferase type 11  31.93 
 
 
250 aa  49.7  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0455227 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3140  Methyltransferase type 11  30.59 
 
 
255 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6333  Methyltransferase type 11  27.97 
 
 
259 aa  49.3  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00315247  hitchhiker  0.000727551 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1916  putative SAM-dependent methyltransferase  35.35 
 
 
299 aa  49.3  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3241  Methyltransferase type 11  30.59 
 
 
255 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  25 
 
 
269 aa  48.9  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  25 
 
 
269 aa  48.9  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  25 
 
 
269 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  25 
 
 
269 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5511  methyltransferase  26.23 
 
 
249 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.139687  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  25 
 
 
269 aa  48.9  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.33 
 
 
280 aa  48.9  0.00009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.76501  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1317  ribosomal RNA adenine dimethylase  27.27 
 
 
279 aa  48.5  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222413  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1753  putative methyltransferase  21.48 
 
 
257 aa  48.1  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.148038  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2033  methyltransferase  31.46 
 
 
302 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.931745  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1748  hypothetical protein  28.66 
 
 
253 aa  47.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  23.61 
 
 
269 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  31.67 
 
 
382 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7600  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.73 
 
 
254 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.192206 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1752  putative methyltransferase  24.22 
 
 
253 aa  47.4  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.610135  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  29.75 
 
 
323 aa  47  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2361  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
291 aa  47  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>