More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6142 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6142  methyltransferase type 11  100 
 
 		 261 aa  517  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  71.14 
 
 		 265 aa  350  2e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3409  type 11 methyltransferase  46 
 
 		 263 aa  182  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  39.06 
 
 		 254 aa  155  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  36.18 
 
 		 247 aa  102  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  33.93 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  32.89 
 
 		 246 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  33.5 
 
 		 239 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  33.5 
 
 		 239 aa  95.5  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  33.5 
 
 		 239 aa  95.5  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3543  Methyltransferase type 11  33.46 
 
 		 261 aa  94  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  32 
 
 		 242 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2996  methyltransferase type 11  33.72 
 
 		 273 aa  90.5  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6308  Methyltransferase type 11  32.63 
 
 		 263 aa  89.7  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  33.03 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  30.98 
 
 		 256 aa  87.8  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  42.47 
 
 		 256 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  42.11 
 
 		 243 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  36.65 
 
 		 255 aa  85.9  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  38.78 
 
 		 252 aa  85.5  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  31.15 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  37.37 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  37.42 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0503  hypothetical protein  25.9 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.61991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  30.2 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3652  Methyltransferase type 11  34.24 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1362  hypothetical protein  33.09 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.40676e-29 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27240  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.43 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1167  methyltransferase  33.09 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  31.13 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1188  hypothetical protein  33.09 
 
 		 251 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.304723  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1282  hypothetical protein  33.09 
 
 		 251 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  32 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1169  methyltransferase  33.09 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.374772  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  41.82 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1428  hypothetical protein  32.35 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.097485  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3523  Methyltransferase type 11  26.95 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  37.35 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0618  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.269288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0017  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0407189 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00809  hypothetical protein  29.63 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721636  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0383  Methyltransferase type 11  28.4 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1326  hypothetical protein  31.39 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2163  Methyltransferase type 11  43.08 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal  0.0704024 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  30.36 
 
 		 255 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  39.57 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0663  hypothetical protein  29.55 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  37.31 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1533  Methyltransferase type 12  31.3 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295316  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4001  Methyltransferase type 11  38.41 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2918  Methyltransferase type 11  36.31 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1471  Methyltransferase type 11  31.08 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0692  methyltransferase type 11  30 
 
 		 252 aa  67  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  37.69 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1725  Methyltransferase type 11  37.68 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.873166  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1760  type 11 methyltransferase  41.27 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4141  methyltransferase type 11  40.16 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  41.88 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.76501  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1629  hypothetical protein  32.03 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1457  Methyltransferase type 12  38.24 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.129024  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3567  Methyltransferase type 11  34.11 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197641  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  34.74 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5557  Methyltransferase type 12  32.2 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5336  hypothetical protein  39.84 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1226  hypothetical protein  35.25 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2382  Methyltransferase type 11  34.19 
 
 		 495 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.571429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  39.6 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0795  hypothetical protein  31.42 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2869  Methyltransferase type 11  38.89 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1748  hypothetical protein  34.88 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1167  methyltransferase type 11  28.95 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13690  putative methyltransferase  35.71 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.784995  normal  0.84173 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  33.33 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2174  Methyltransferase type 11  28.34 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0827328  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  43.01 
 
 		 274 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5511  methyltransferase  27.2 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.139687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52120  trans-aconitate methyltransferase 1  25.55 
 
 		 310 aa  58.9  0.00000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.94 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1418  putative methyltransferase  26.74 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.282901  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29451  hypothetical protein  29.35 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86084  methyltransferase  31.78 
 
 		 333 aa  58.5  0.00000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0255585 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2590  methyltransferase type 11  27.63 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1752  putative methyltransferase  29.05 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.610135  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0310  Methyltransferase type 11  29.2 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1477  methyltransferase type 11  33.08 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0734  Methyltransferase type 11  29.75 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.599547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  28.28 
 
 		 240 aa  57  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.6 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  43.01 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6644  methyltransferase type 11  36.8 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  34.81 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  21.11 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  35.29 
 
 		 325 aa  55.5  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  37.31 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 250 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  36.19 
 
 		 312 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1753  putative methyltransferase  28.47 
 
 		 257 aa  54.7  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.148038  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5792  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2477  Methyltransferase type 11  28.15 
 
 		 213 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>