More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2590 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2590  methyltransferase type 11  100 
 
 		 260 aa  530  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4141  putative methyltransferase  42.57 
 
 		 273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.34511  normal  0.0273084 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0541  methyltransferase type 12  38.82 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00203248 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2192  methyltransferase type 11  34.47 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3579  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase protein  39.53 
 
 		 280 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.0849156 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0450  methyltransferase type 12  35.34 
 
 		 263 aa  139  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2323  hypothetical protein  33.73 
 
 		 252 aa  125  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.569628  normal  0.0283599 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0200  hypothetical protein  33.46 
 
 		 311 aa  125  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5352  methyltransferase type 11  37.7 
 
 		 268 aa  115  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1533  Methyltransferase type 12  26.86 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0798  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.62 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  28.16 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.77 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2174  Methyltransferase type 11  25.43 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0827328  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1167  methyltransferase type 11  28.31 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0301  Methyltransferase type 12  25.51 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0795  hypothetical protein  26.5 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4526  methyltransferase type 11  27.68 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6503  Methyltransferase type 11  28.44 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  32.37 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  36.04 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  33.09 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1362  hypothetical protein  31.9 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.40676e-29 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0618  Methyltransferase type 11  25.9 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.269288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0383  Methyltransferase type 11  29.94 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3567  Methyltransferase type 11  32.07 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197641  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3930  Methyltransferase type 11  35.85 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.56855 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  25.11 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4043  Methyltransferase type 11  35.85 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  31.34 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  35.58 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1326  hypothetical protein  31.03 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1188  hypothetical protein  31.03 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.304723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1167  methyltransferase  24.3 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48660  Methyltransferase type 11 protein  25.23 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1282  hypothetical protein  31.03 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  34.48 
 
 		 246 aa  62  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1428  hypothetical protein  31.03 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.097485  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4501  methyltransferase type 11  25.48 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.162908 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  36.76 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29470  hypothetical protein  28.03 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48590  hypothetical protein  42.55 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00740974  normal  0.0133617 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  29.49 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2792  hypothetical protein  25.46 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.94 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  23.39 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  31.54 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  31.54 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2269  methyltransferase type 11  28.87 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.541668  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2729  SAM-dependent methyltransferase  30.66 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1169  methyltransferase  30.17 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.374772  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  31.39 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  31.39 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  31.39 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  33.99 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  30.94 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0503  hypothetical protein  27.61 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.61991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  29.81 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.19 
 
 		 233 aa  58.5  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.420732  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3543  Methyltransferase type 11  32.61 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  35.64 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  26.42 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.39 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.39 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  35.64 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  29.25 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6142  methyltransferase type 11  27.63 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  36.27 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  35.85 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.92 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0017  Methyltransferase type 11  29.79 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0407189 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  33.58 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  29.71 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3652  Methyltransferase type 11  32.05 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.19 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  33.33 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1437  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.32 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3953  methyltransferase type 11  26.89 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  26.54 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.19 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0711  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0787386  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0132  Methyltransferase type 11  26.39 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0567  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.54 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.445388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  29.19 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.19 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3852  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.28 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  29.77 
 
 		 275 aa  55.5  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  37.29 
 
 		 274 aa  55.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  36 
 
 		 341 aa  55.5  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  40.57 
 
 		 270 aa  55.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  34.91 
 
 		 341 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  27.78 
 
 		 255 aa  54.7  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>