140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4001 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4001  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 248 aa  488  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2382  Methyltransferase type 11  41.25 
 
 		 495 aa  149  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.571429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4141  methyltransferase type 11  39.52 
 
 		 273 aa  136  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2869  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1760  type 11 methyltransferase  38.13 
 
 		 275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2163  Methyltransferase type 11  49.63 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal  0.0704024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5336  hypothetical protein  39.6 
 
 		 274 aa  118  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5296  Methyltransferase type 11  34.3 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.374487  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 239 aa  101  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  35.24 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  35.24 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  34.43 
 
 		 243 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  34.88 
 
 		 242 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 254 aa  92  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  32.88 
 
 		 246 aa  92  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  38 
 
 		 257 aa  87  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  42.19 
 
 		 275 aa  87.8  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  41.79 
 
 		 256 aa  85.9  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  34.48 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6308  Methyltransferase type 11  41.54 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27240  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.31 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0383  Methyltransferase type 11  27.86 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  33.8 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1167  methyltransferase  27.6 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1188  hypothetical protein  33.11 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.304723  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1282  hypothetical protein  33.11 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1362  hypothetical protein  27.6 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.40676e-29 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 259 aa  75.1  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1428  hypothetical protein  31.37 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.097485  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1326  hypothetical protein  27.31 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1169  methyltransferase  32.43 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.374772  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  42.11 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5511  methyltransferase  36.67 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.139687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1533  Methyltransferase type 12  29.55 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0017  Methyltransferase type 11  34.81 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0407189 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.29 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6142  methyltransferase type 11  38.41 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3409  type 11 methyltransferase  28.69 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  38.17 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0618  Methyltransferase type 11  37.4 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.269288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2918  Methyltransferase type 11  27.73 
 
 		 264 aa  65.1  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0503  hypothetical protein  28.79 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.61991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1418  putative methyltransferase  34.45 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.282901  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29451  hypothetical protein  31.79 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  34.04 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  27.9 
 
 		 255 aa  62  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  40.16 
 
 		 243 aa  62  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1457  Methyltransferase type 12  37.88 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.129024  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  35.61 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.47 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.76501  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00809  hypothetical protein  34.11 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721636  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  31.82 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0541  methyltransferase type 12  30.77 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00203248 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0692  methyltransferase type 11  28.43 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  35.33 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  36.23 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5557  Methyltransferase type 12  26.34 
 
 		 257 aa  58.5  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1725  Methyltransferase type 11  33.59 
 
 		 256 aa  58.5  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.873166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1752  putative methyltransferase  32.77 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.610135  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0313  putative methyltransferase  31.71 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.459942  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2996  methyltransferase type 11  27.66 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6333  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00315247  hitchhiker  0.000727551 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1629  hypothetical protein  31.97 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  37.1 
 
 		 270 aa  55.1  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3567  Methyltransferase type 11  35.82 
 
 		 242 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197641  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3652  Methyltransferase type 11  36.09 
 
 		 266 aa  54.7  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1471  Methyltransferase type 11  28.02 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3418  methyltransferase type 11  35.92 
 
 		 254 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.268365  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1419  putative methyltransferase  24.12 
 
 		 257 aa  52.8  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.412346  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  34.97 
 
 		 232 aa  52.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1753  putative methyltransferase  24.12 
 
 		 257 aa  52  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.148038  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48660  Methyltransferase type 11 protein  34.13 
 
 		 254 aa  52  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302894  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3523  Methyltransferase type 11  31.06 
 
 		 257 aa  51.2  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00330  trans-aconitate 3-methyltransferase, putative  32.41 
 
 		 405 aa  50.8  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.10395  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3579  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase protein  30.38 
 
 		 280 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.0849156 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0663  hypothetical protein  33.33 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  34.11 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86084  methyltransferase  24.36 
 
 		 333 aa  48.5  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0255585 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4141  putative methyltransferase  24.81 
 
 		 273 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.34511  normal  0.0273084 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0450  methyltransferase type 12  28.99 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12360  methyltransferase family protein  32.26 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.661079  normal  0.539281 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2174  Methyltransferase type 11  30.37 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0827328  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4583  Methyltransferase type 11  34.26 
 
 		 220 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.130075 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4222  methyltransferase type 11  24.58 
 
 		 212 aa  47  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3543  Methyltransferase type 11  34.72 
 
 		 261 aa  46.6  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.85 
 
 		 269 aa  46.6  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  31.17 
 
 		 258 aa  46.2  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2106  methyltransferase type 12  26.11 
 
 		 565 aa  46.2  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2169  hypothetical protein  39.42 
 
 		 223 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0742  hypothetical protein  24.58 
 
 		 212 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  26.77 
 
 		 267 aa  45.4  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  33.09 
 
 		 212 aa  45.8  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4457  hypothetical protein  23.73 
 
 		 212 aa  45.4  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.643189  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4271  hypothetical protein  23.73 
 
 		 212 aa  45.4  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.208511  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4603  hypothetical protein  23.73 
 
 		 212 aa  45.4  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.964338  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4508  hypothetical protein  23.73 
 
 		 212 aa  45.4  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000692373  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4494  hypothetical protein  23.73 
 
 		 212 aa  45.4  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.605831  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4455  hypothetical protein  23.73 
 
 		 212 aa  45.4  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.821165 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0312  hypothetical protein  26.81 
 
 		 142 aa  45.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.763248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>