More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_12360 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_12360  methyltransferase family protein  100 
 
 
203 aa  404  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.661079  normal  0.539281 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5548  Methyltransferase type 11  43.27 
 
 
211 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5212  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  39.3 
 
 
200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0540942  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.13 
 
 
200 aa  103  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0754126  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2752  Methyltransferase type 12  36.5 
 
 
225 aa  99  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.64 
 
 
268 aa  90.9  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1258  hypothetical protein  41.54 
 
 
238 aa  86.3  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4583  Methyltransferase type 11  33.99 
 
 
220 aa  84  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.130075 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1502  Methyltransferase type 12  35.27 
 
 
223 aa  78.2  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.16 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.420732  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10090  methyltransferase  32.84 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.542368  normal  0.16327 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4082  methyltransferase type 12  30.14 
 
 
198 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0341683  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  34.75 
 
 
246 aa  62.4  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  39.25 
 
 
202 aa  61.6  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  34.43 
 
 
232 aa  60.8  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3212  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  40 
 
 
239 aa  59.3  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.812098  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0876  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.75 
 
 
245 aa  58.5  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000138589  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.25 
 
 
242 aa  58.5  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00359705  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1203  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 
239 aa  57.8  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2138  Methyltransferase type 11  38.84 
 
 
260 aa  57.8  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  32.77 
 
 
258 aa  56.6  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3833  Methyltransferase type 11  38.37 
 
 
213 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1197  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 
289 aa  57  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1622  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  39.08 
 
 
242 aa  56.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2131  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.3 
 
 
240 aa  57  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2071  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.38 
 
 
236 aa  56.2  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000425101  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003110  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.78 
 
 
242 aa  56.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.35235  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1104  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.5 
 
 
239 aa  56.2  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  35.25 
 
 
265 aa  55.8  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3981  methyltransferase type 12  31.82 
 
 
235 aa  55.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.457714  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2699  methyltransferase type 12  39.39 
 
 
231 aa  55.8  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2412  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 
240 aa  55.5  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.125357  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2186  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.95 
 
 
239 aa  55.5  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0852291  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3953  Methyltransferase type 12  32.48 
 
 
249 aa  55.8  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.988562  normal  0.116443 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  34.26 
 
 
225 aa  55.1  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  41.53 
 
 
218 aa  55.1  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.85 
 
 
155 aa  55.1  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1311  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.44 
 
 
242 aa  55.1  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.310574  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.44 
 
 
242 aa  55.1  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.167435  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2847  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.44 
 
 
242 aa  55.1  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.170371  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2553  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  39.13 
 
 
229 aa  54.7  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.416549  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3270  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.44 
 
 
241 aa  53.9  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0514123  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2413  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.22 
 
 
236 aa  53.9  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.14 
 
 
241 aa  53.5  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.69336  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1162  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.35 
 
 
238 aa  53.5  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1918  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.61 
 
 
236 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00158805  hitchhiker  0.0000000749006 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  36.21 
 
 
457 aa  53.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1730  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.96 
 
 
237 aa  53.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224217 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1974  Methyltransferase type 11  40.57 
 
 
260 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00383386  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
305 aa  53.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3020  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  37.5 
 
 
249 aa  53.1  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1190  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.71 
 
 
241 aa  52.8  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2288  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.29 
 
 
236 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434685  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2061  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.29 
 
 
236 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000216259  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2057  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.29 
 
 
236 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00373445  unclonable  0.00000000000181282 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2405  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.29 
 
 
236 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0031453  unclonable  0.0000107222 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  34.11 
 
 
221 aa  52.8  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4970  Methyltransferase type 12  39.09 
 
 
196 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1179  tellurite resistance protein TehB  28.76 
 
 
184 aa  52.4  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28171  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.21 
 
 
238 aa  52.4  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  25.35 
 
 
235 aa  52.8  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1113  bifunctional 3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase and 2-octaprenyl-6-hydroxy phenol methylase  29.06 
 
 
241 aa  52.4  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02731  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.61 
 
 
235 aa  52.4  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2305  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.5 
 
 
256 aa  52.4  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  37.93 
 
 
305 aa  52  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2743  methyltransferase type 12  32.04 
 
 
290 aa  52  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  37.04 
 
 
247 aa  51.6  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  40.23 
 
 
238 aa  51.6  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  38.54 
 
 
202 aa  51.2  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2207  Methyltransferase type 11  40.66 
 
 
219 aa  51.2  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  38.24 
 
 
241 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
266 aa  51.2  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  32.41 
 
 
285 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  36.69 
 
 
227 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2060  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.43 
 
 
236 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000109149  unclonable  0.0000217963 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0626  methyltransferase type 11  33.64 
 
 
224 aa  51.2  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00710227 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.94 
 
 
258 aa  51.2  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1971  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.99 
 
 
236 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000321939  hitchhiker  0.00000717465 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2495  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.56 
 
 
238 aa  50.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1825  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.69 
 
 
235 aa  50.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  25.19 
 
 
235 aa  50.1  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2800  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.75 
 
 
242 aa  50.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0471  ArsR family transcriptional regulator  29.93 
 
 
335 aa  50.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.421006  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.93 
 
 
235 aa  50.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.38 
 
 
234 aa  50.1  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1501  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.69 
 
 
235 aa  50.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.209044  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  37.66 
 
 
208 aa  50.4  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  35 
 
 
241 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  31.4 
 
 
214 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  29.09 
 
 
215 aa  50.4  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.38 
 
 
243 aa  49.7  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2304  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.99 
 
 
241 aa  50.1  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000612438 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.58 
 
 
232 aa  49.7  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2407  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  40.58 
 
 
250 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8582  methyltransferase type 11  34.88 
 
 
247 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563755  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0491  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.1 
 
 
229 aa  49.7  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372241  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  30.3 
 
 
400 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.03 
 
 
285 aa  49.3  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.47 
 
 
229 aa  49.3  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.36 
 
 
237 aa  49.3  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>