99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0450 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0450  methyltransferase type 12  100 
 
 
263 aa  535  1e-151  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0541  methyltransferase type 12  80.99 
 
 
265 aa  433  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00203248 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2590  methyltransferase type 11  35.34 
 
 
260 aa  139  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205764  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4141  putative methyltransferase  32.7 
 
 
273 aa  138  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.34511  normal  0.0273084 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2192  methyltransferase type 11  28.79 
 
 
279 aa  101  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2323  hypothetical protein  26.4 
 
 
252 aa  75.9  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.569628  normal  0.0283599 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0200  hypothetical protein  26.19 
 
 
311 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3579  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase protein  26.3 
 
 
280 aa  72.8  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.0849156 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0048  Methyltransferase type 11  26.98 
 
 
269 aa  65.5  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5352  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
268 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  37.04 
 
 
243 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
245 aa  61.6  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0618  Methyltransferase type 11  33.82 
 
 
249 aa  60.8  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.269288  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1725  Methyltransferase type 11  35 
 
 
256 aa  59.3  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.873166  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2174  Methyltransferase type 11  28.89 
 
 
276 aa  56.6  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0827328  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  34.85 
 
 
246 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2733  Methyltransferase type 11  22.97 
 
 
256 aa  55.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3369  Methyltransferase type 11  22.97 
 
 
256 aa  55.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.209889  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1533  Methyltransferase type 12  27.21 
 
 
259 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295316  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3523  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 
257 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1282  hypothetical protein  29.57 
 
 
251 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1188  hypothetical protein  29.57 
 
 
251 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.304723  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1428  hypothetical protein  30.91 
 
 
251 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.097485  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48660  Methyltransferase type 11 protein  29.25 
 
 
254 aa  53.9  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302894  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1167  methyltransferase  29.57 
 
 
251 aa  53.9  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1362  hypothetical protein  31.48 
 
 
251 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.40676e-29 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1326  hypothetical protein  29.63 
 
 
251 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1169  methyltransferase  29.06 
 
 
251 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.374772  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  29.63 
 
 
271 aa  53.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29470  hypothetical protein  29.13 
 
 
250 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6503  Methyltransferase type 11  24.77 
 
 
255 aa  52.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2290  Methyltransferase type 11  30.97 
 
 
226 aa  52.8  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  34.09 
 
 
254 aa  52.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  32.52 
 
 
256 aa  52  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  29.85 
 
 
275 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3133  Methyltransferase type 11  25.23 
 
 
246 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998668  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 
259 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4229  hypothetical protein  29.63 
 
 
652 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.60873 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  31.03 
 
 
220 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  25.66 
 
 
267 aa  50.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  31.03 
 
 
220 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1167  methyltransferase type 11  24.31 
 
 
256 aa  50.4  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  31.03 
 
 
220 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  31.03 
 
 
220 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  31.03 
 
 
220 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  31.03 
 
 
220 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  31.03 
 
 
220 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  33.87 
 
 
239 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  33.87 
 
 
239 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  33.87 
 
 
239 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  30.07 
 
 
243 aa  50.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35256  trans-aconitate methyltransferase 2  21.64 
 
 
318 aa  48.9  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0249977  normal  0.183726 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3543  Methyltransferase type 11  29.66 
 
 
261 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  27.74 
 
 
283 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4001  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 
248 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  29.84 
 
 
260 aa  47  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  31.3 
 
 
242 aa  47  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3953  methyltransferase type 11  29.61 
 
 
250 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4501  methyltransferase type 11  24.6 
 
 
249 aa  47  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.162908 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3409  type 11 methyltransferase  30.67 
 
 
263 aa  46.6  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1457  Methyltransferase type 12  23.26 
 
 
248 aa  46.6  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.129024  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  31.91 
 
 
270 aa  46.6  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  26.49 
 
 
269 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  26.49 
 
 
269 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  26.49 
 
 
269 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0795  hypothetical protein  25.71 
 
 
250 aa  46.2  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  26.49 
 
 
269 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  26.49 
 
 
269 aa  46.6  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  26.49 
 
 
269 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1471  Methyltransferase type 11  29.93 
 
 
256 aa  46.2  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3612  methyltransferase type 11  30 
 
 
256 aa  46.2  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  25.83 
 
 
269 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08531  conserved hypothetical protein  27.41 
 
 
305 aa  45.8  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.345186 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2792  hypothetical protein  25.46 
 
 
250 aa  45.8  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3140  Methyltransferase type 11  29 
 
 
255 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0204  Methyltransferase type 12  23.03 
 
 
203 aa  45.4  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3241  Methyltransferase type 11  29 
 
 
255 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.45 
 
 
251 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  26.27 
 
 
255 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52120  trans-aconitate methyltransferase 1  25.33 
 
 
310 aa  44.3  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4526  methyltransferase type 11  23.61 
 
 
253 aa  44.3  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00330  trans-aconitate 3-methyltransferase, putative  27.68 
 
 
405 aa  44.3  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.10395  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6142  methyltransferase type 11  27.03 
 
 
261 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2481  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.27 
 
 
256 aa  43.9  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0101749  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  28.78 
 
 
312 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  30.43 
 
 
341 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5557  Methyltransferase type 12  27.41 
 
 
257 aa  43.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1301  methyltransferase small  40.74 
 
 
417 aa  42.4  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  32.81 
 
 
257 aa  42.4  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  22.29 
 
 
257 aa  42.4  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  26.32 
 
 
260 aa  42.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3042  methyltransferase type 11  29.44 
 
 
254 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2996  methyltransferase type 11  27.65 
 
 
273 aa  42.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5548  Methyltransferase type 11  29.81 
 
 
211 aa  42  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  45.1 
 
 
309 aa  42.4  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  22.91 
 
 
255 aa  42.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4099  methyltransferase type 11  29.13 
 
 
248 aa  42  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4175  methyltransferase type 11  29.13 
 
 
248 aa  42  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14805  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4039  methyltransferase type 12  30.25 
 
 
209 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.668919  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>