145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5296 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5296  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 282 aa  554  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.374487  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1760  type 11 methyltransferase  50 
 
 		 275 aa  251  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4141  methyltransferase type 11  48.39 
 
 		 273 aa  239  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2163  Methyltransferase type 11  48.94 
 
 		 284 aa  236  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal  0.0704024 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2869  Methyltransferase type 11  47 
 
 		 275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5336  hypothetical protein  50.36 
 
 		 274 aa  229  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2382  Methyltransferase type 11  44.49 
 
 		 495 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.571429  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4001  Methyltransferase type 11  34.71 
 
 		 248 aa  127  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2918  Methyltransferase type 11  29.39 
 
 		 264 aa  87.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0383  Methyltransferase type 11  26.75 
 
 		 277 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0503  hypothetical protein  24.18 
 
 		 278 aa  85.9  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.61991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1533  Methyltransferase type 12  25.09 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  29.43 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6308  Methyltransferase type 11  35.37 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  27.82 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1167  methyltransferase  28.02 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1188  hypothetical protein  28.02 
 
 		 251 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.304723  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1282  hypothetical protein  28.02 
 
 		 251 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  34.36 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1169  methyltransferase  25.82 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.374772  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  27.07 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  27.07 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  27.07 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  35.76 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  30.27 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  31.14 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1362  hypothetical protein  27.01 
 
 		 251 aa  72  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.40676e-29 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  33.56 
 
 		 246 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1428  hypothetical protein  24.71 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.097485  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27240  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.5 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1326  hypothetical protein  25.67 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.93 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  28.98 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  35.81 
 
 		 259 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  34.46 
 
 		 255 aa  67  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  28.67 
 
 		 247 aa  67  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  27.33 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  32.43 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2996  methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  35.71 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5557  Methyltransferase type 12  28.04 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  31.85 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  34.57 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  28 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3409  type 11 methyltransferase  36.49 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  36.49 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1725  Methyltransferase type 11  35.03 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.873166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6142  methyltransferase type 11  35.86 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3652  Methyltransferase type 11  29.56 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1457  Methyltransferase type 12  31.62 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.129024  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6333  Methyltransferase type 11  37.38 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00315247  hitchhiker  0.000727551 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  30.72 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0692  methyltransferase type 11  27.62 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3123  hypothetical protein  24.58 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00809  hypothetical protein  27.4 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721636  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3567  Methyltransferase type 11  38.24 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197641  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0663  hypothetical protein  29.85 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0017  Methyltransferase type 11  28.82 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0407189 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0618  Methyltransferase type 11  24.64 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.269288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1753  putative methyltransferase  24.07 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.148038  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  28.57 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3418  methyltransferase type 11  35.44 
 
 		 254 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.268365  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1419  putative methyltransferase  23.46 
 
 		 257 aa  53.1  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.412346  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3523  Methyltransferase type 11  25.53 
 
 		 257 aa  53.5  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2174  Methyltransferase type 11  31.17 
 
 		 276 aa  53.1  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0827328  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.05 
 
 		 280 aa  53.1  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.76501  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86084  methyltransferase  23.95 
 
 		 333 aa  52.8  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0255585 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3140  Methyltransferase type 11  30.29 
 
 		 255 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3241  Methyltransferase type 11  30.29 
 
 		 255 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  30.67 
 
 		 248 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  32.76 
 
 		 214 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  37.89 
 
 		 270 aa  50.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  30 
 
 		 269 aa  49.7  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2559  methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 228 aa  49.3  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  28.83 
 
 		 270 aa  49.3  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3543  Methyltransferase type 11  31.33 
 
 		 261 aa  48.9  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  39.42 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3042  methyltransferase type 11  29.07 
 
 		 254 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  28.89 
 
 		 210 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1535  methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 265 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0615869  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  29.05 
 
 		 457 aa  48.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52120  trans-aconitate methyltransferase 1  26.97 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.27 
 
 		 250 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  33.33 
 
 		 258 aa  47.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1471  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 256 aa  47  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1773  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.83 
 
 		 265 aa  46.6  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  34.83 
 
 		 252 aa  46.2  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.42 
 
 		 258 aa  46.2  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2792  hypothetical protein  30.82 
 
 		 250 aa  45.8  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  36.27 
 
 		 228 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  24.24 
 
 		 255 aa  45.8  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1647  Methyltransferase type 12  35.94 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00330  trans-aconitate 3-methyltransferase, putative  29 
 
 		 405 aa  45.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.10395  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5212  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.26 
 
 		 200 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0540942  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4501  methyltransferase type 11  36.26 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.162908 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  30.21 
 
 		 211 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 341 aa  44.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0198  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.31 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.537911  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>