130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0312 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0312  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  299  8.000000000000001e-81  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.763248  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1753  putative methyltransferase  76.12 
 
 
257 aa  216  6e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.148038  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1419  putative methyltransferase  75.37 
 
 
257 aa  215  1e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.412346  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0017  Methyltransferase type 11  40.3 
 
 
254 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0407189 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5511  methyltransferase  38.28 
 
 
249 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.139687  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1629  hypothetical protein  37.4 
 
 
258 aa  82.8  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0313  putative methyltransferase  39.06 
 
 
257 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.459942  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1418  putative methyltransferase  39.84 
 
 
259 aa  81.6  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.282901  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1752  putative methyltransferase  39.84 
 
 
253 aa  80.9  0.000000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.610135  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29451  hypothetical protein  36.72 
 
 
249 aa  78.2  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0618  Methyltransferase type 11  34.88 
 
 
249 aa  71.6  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.269288  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  29.92 
 
 
259 aa  70.5  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  39.18 
 
 
243 aa  68.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6308  Methyltransferase type 11  35.11 
 
 
263 aa  68.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  34.92 
 
 
242 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  33.33 
 
 
243 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  30.71 
 
 
255 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0663  hypothetical protein  30.71 
 
 
255 aa  66.6  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1188  hypothetical protein  35.16 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.304723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1167  methyltransferase  35.16 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1282  hypothetical protein  35.16 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  30.23 
 
 
257 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  35.16 
 
 
239 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  35.16 
 
 
239 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  35.16 
 
 
239 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
246 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1362  hypothetical protein  36.07 
 
 
251 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.40676e-29 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2174  Methyltransferase type 11  34.07 
 
 
276 aa  63.5  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0827328  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1169  methyltransferase  34.38 
 
 
251 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.374772  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  32.37 
 
 
255 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  32.56 
 
 
247 aa  63.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  32.81 
 
 
275 aa  61.6  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3567  Methyltransferase type 11  28.68 
 
 
242 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197641  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  32.85 
 
 
256 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00809  hypothetical protein  29.46 
 
 
242 aa  60.8  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721636  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
271 aa  60.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1326  hypothetical protein  32.81 
 
 
251 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
267 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1428  hypothetical protein  33.59 
 
 
251 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.097485  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  31.15 
 
 
255 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0692  methyltransferase type 11  29.37 
 
 
252 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  30.89 
 
 
270 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3418  methyltransferase type 11  28.91 
 
 
254 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.268365  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  31.15 
 
 
259 aa  57  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3543  Methyltransferase type 11  29.85 
 
 
261 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
254 aa  56.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  32.28 
 
 
257 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1533  Methyltransferase type 12  30.28 
 
 
259 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295316  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
245 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0795  hypothetical protein  28.57 
 
 
250 aa  53.9  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  39.18 
 
 
207 aa  53.5  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.33 
 
 
280 aa  53.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.76501  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4070  MerR family transcriptional regulator  27.48 
 
 
260 aa  52.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.487071  normal  0.354959 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3523  Methyltransferase type 11  28.12 
 
 
257 aa  52  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27240  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.58 
 
 
308 aa  52.4  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3499  Methyltransferase type 11  28.12 
 
 
256 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6503  Methyltransferase type 11  26.02 
 
 
255 aa  51.6  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5476  Methyltransferase type 11  32.63 
 
 
252 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608762  normal  0.384797 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2792  hypothetical protein  25.71 
 
 
250 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  26.56 
 
 
254 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3479  methyltransferase type 11  25.19 
 
 
252 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0924796 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  29.23 
 
 
260 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0563  Methyltransferase type 11  27.13 
 
 
253 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.267542  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2163  Methyltransferase type 11  27.13 
 
 
284 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal  0.0704024 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 
252 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1725  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 
256 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.873166  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08931  SAM-binding motif-containing protein  26.32 
 
 
255 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3409  type 11 methyltransferase  30.77 
 
 
263 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6142  methyltransferase type 11  30.47 
 
 
261 aa  48.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86084  methyltransferase  29.2 
 
 
333 aa  47.8  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0255585 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  28.03 
 
 
256 aa  47  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0383  Methyltransferase type 11  26.36 
 
 
277 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29470  hypothetical protein  23.39 
 
 
250 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2319  methyltransferase type 11  30.11 
 
 
178 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690206  normal  0.0712991 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3007  methyltransferase type 11  26.09 
 
 
246 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.036599  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  29.29 
 
 
199 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4001  Methyltransferase type 11  26.81 
 
 
248 aa  45.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3042  methyltransferase type 11  24.09 
 
 
254 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.34 
 
 
265 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  25.76 
 
 
267 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0445  Methyltransferase type 11  26.87 
 
 
252 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00103969  normal  0.712757 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3140  Methyltransferase type 11  24.09 
 
 
255 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3241  Methyltransferase type 11  24.09 
 
 
255 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2590  methyltransferase type 11  26.32 
 
 
260 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205764  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  28.85 
 
 
207 aa  43.9  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3419  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.33 
 
 
299 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.72 
 
 
205 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  30.97 
 
 
283 aa  43.9  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  25.81 
 
 
200 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  25.81 
 
 
200 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0503  hypothetical protein  26.32 
 
 
278 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.61991  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3369  Methyltransferase type 11  27.91 
 
 
256 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.209889  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  27.97 
 
 
244 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2269  methyltransferase type 11  28.83 
 
 
240 aa  43.5  0.0009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.541668  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2733  Methyltransferase type 11  27.91 
 
 
256 aa  43.9  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  25.55 
 
 
269 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2330  hypothetical protein  24.03 
 
 
249 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.291215  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.95 
 
 
269 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0301  Methyltransferase type 12  28.97 
 
 
243 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4501  methyltransferase type 11  28.87 
 
 
249 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.162908 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>