More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2815 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  100 
 
 
232 aa  460  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  32.74 
 
 
220 aa  145  5e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  32.74 
 
 
220 aa  145  5e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  32.74 
 
 
220 aa  145  5e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  32.74 
 
 
220 aa  145  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  32.74 
 
 
220 aa  145  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  32.74 
 
 
220 aa  145  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  32.74 
 
 
220 aa  145  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.77 
 
 
244 aa  78.2  0.00000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  35.48 
 
 
257 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2807  methyltransferase, putative  36.71 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.432539  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  31.69 
 
 
246 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  41.05 
 
 
252 aa  70.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  31.3 
 
 
400 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  41.35 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  30.39 
 
 
243 aa  68.9  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  40.4 
 
 
269 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1328  methyl transferase  37.89 
 
 
242 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39.68 
 
 
200 aa  68.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0754126  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0923  biotin biosynthesis protein BioC  34.15 
 
 
251 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00600636  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  45.26 
 
 
251 aa  67.4  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  40.4 
 
 
269 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0860  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00894914  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  30.77 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.12 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0996  Methyltransferase type 11  34.34 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.12 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  36 
 
 
274 aa  65.9  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0946  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 
251 aa  65.5  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000915647  normal  0.885447 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  37.61 
 
 
215 aa  65.5  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  26.39 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.48 
 
 
234 aa  65.1  0.0000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.48 
 
 
243 aa  65.1  0.0000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 
251 aa  65.1  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189171  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.09 
 
 
250 aa  64.7  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  26.83 
 
 
255 aa  64.7  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.33 
 
 
233 aa  64.7  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.420732  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1679  methyltransferase type 11  32.32 
 
 
243 aa  64.7  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  38.14 
 
 
260 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.14 
 
 
215 aa  63.2  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10090  methyltransferase  37.37 
 
 
197 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.542368  normal  0.16327 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  38.38 
 
 
259 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  39.25 
 
 
276 aa  63.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5925  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.45 
 
 
248 aa  62.8  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  36.63 
 
 
269 aa  62.4  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  32.09 
 
 
253 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  30.83 
 
 
208 aa  62  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43688  predicted protein  33.16 
 
 
378 aa  62.4  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.569479  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  32.3 
 
 
202 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  39.58 
 
 
251 aa  61.6  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  30.48 
 
 
268 aa  61.2  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  35.2 
 
 
253 aa  61.2  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.29 
 
 
291 aa  60.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  35.83 
 
 
269 aa  61.6  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1254  methyltransferase type 12  39.13 
 
 
226 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.452774  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  23.68 
 
 
206 aa  61.6  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0388  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 
226 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0410842 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  25.67 
 
 
278 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  39.39 
 
 
242 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  32 
 
 
258 aa  60.5  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  36.73 
 
 
252 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  27.86 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  25.85 
 
 
269 aa  60.5  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.76 
 
 
252 aa  60.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.91 
 
 
255 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2080  methyltransferase type 11  36.43 
 
 
265 aa  60.1  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.517961 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2440  Methyltransferase type 11  34.11 
 
 
216 aa  59.7  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0165065  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  26.74 
 
 
244 aa  60.1  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  31.72 
 
 
208 aa  59.7  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  36.76 
 
 
291 aa  59.7  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2114  Methyltransferase type 11  27.48 
 
 
237 aa  59.7  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  33.68 
 
 
268 aa  59.7  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  33.67 
 
 
225 aa  59.7  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2962  methyltransferase type 11  28.08 
 
 
401 aa  59.7  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.14 
 
 
241 aa  59.3  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0885  methyltransferase, putative  32.08 
 
 
214 aa  59.3  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.784579  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 
319 aa  59.3  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5476  Methyltransferase type 11  33.94 
 
 
252 aa  59.3  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608762  normal  0.384797 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  31.9 
 
 
274 aa  58.9  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  31.76 
 
 
250 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  31.76 
 
 
250 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  36 
 
 
232 aa  58.9  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  28.28 
 
 
246 aa  58.9  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  31.95 
 
 
215 aa  58.9  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.15 
 
 
235 aa  58.9  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.69 
 
 
260 aa  58.5  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  36.11 
 
 
272 aa  58.5  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  31.08 
 
 
250 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  32.69 
 
 
204 aa  58.5  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4275  methyltransferase type 11  39.8 
 
 
251 aa  57.8  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.86 
 
 
241 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2970  hypothetical protein  35.29 
 
 
226 aa  58.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1546  NodS  29.27 
 
 
283 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377082  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  33.07 
 
 
273 aa  58.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  30.43 
 
 
253 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
249 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4501  methyltransferase type 11  35.92 
 
 
249 aa  58.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.162908 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  35.07 
 
 
355 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  35.42 
 
 
268 aa  57.8  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>