More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4275 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4275  methyltransferase type 11  100 
 
 		 251 aa  513  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3306  Methyltransferase type 11  54.22 
 
 		 249 aa  256  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0942  Methyltransferase type 11  52.8 
 
 		 249 aa  238  8e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000927283 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  37.05 
 
 		 261 aa  177  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2423  methyltransferase type 11  38.4 
 
 		 254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0780053 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  38.98 
 
 		 251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3055  methyltransferase type 11  38.8 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000014304  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2234  Methyltransferase type 11  39.52 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  hitchhiker  0.000669188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0292  MCP methyltransferase, CheR-type  36.8 
 
 		 253 aa  132  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3413  Methyltransferase type 12  33.07 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  31.05 
 
 		 244 aa  122  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2877  methyltransferase type 12  26.83 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0377935 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1301  Generic methyltransferase  30 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2259  Generic methyltransferase  29.6 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2948  hypothetical protein  30.12 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3074  hypothetical protein  30 
 
 		 248 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404761  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2633  hypothetical protein  29.25 
 
 		 244 aa  106  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2382  generic methyltransferase  27.53 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.680927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6131  UbiE Methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 289 aa  92.4  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0287  generic methyltransferase  27.2 
 
 		 292 aa  89.4  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16206  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3106  generic methyltransferase  27.72 
 
 		 311 aa  86.7  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33572  normal  0.0489041 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  32.57 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3322  methyltransferase type 12  27.2 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.595734  normal  0.302163 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4625  hypothetical protein  28.69 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394037  normal  0.982559 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1368  hypothetical protein  29.8 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1408  hypothetical protein  29.8 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1461  hypothetical protein  28.06 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1003  hypothetical protein  27.67 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1485  hypothetical protein  27.67 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38639  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  27.13 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1490  Methyltransferase type 11  29.64 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818174 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5370  Methyltransferase type 11  26.8 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.328033 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1380  hypothetical protein  28.17 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7221  putative 3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.37 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5629  Methyltransferase type 12  25.4 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879577  normal  0.697867 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0962  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.14 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  35.83 
 
 		 672 aa  63.2  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1190  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.11 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1074  methyltransferase type 11  33.58 
 
 		 436 aa  62  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.257037  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3939  Methyltransferase type 12  29.78 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136325 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  29.24 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4115  methyltransferase type 12  29.63 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1757  methylase  26.06 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4536  methyltransferase type 12  25.81 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 239 aa  58.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.01 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1730  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.14 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224217 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0248  methyltransferase type 11  31.75 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  39.8 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3067  methyltransferase type 11  30.37 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  29.06 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  31.73 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5793  Methyltransferase type 11  28.65 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  34.21 
 
 		 1162 aa  55.5  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.72 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  32 
 
 		 215 aa  55.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  26.02 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2066  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.10278  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.64 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3855  Methyltransferase type 12  28.49 
 
 		 249 aa  54.7  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.841093  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.77 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  26.5 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1234  hypothetical protein  32.38 
 
 		 524 aa  54.3  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0873345 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  36.28 
 
 		 266 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  31.97 
 
 		 208 aa  54.3  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.42 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0045  Methyltransferase type 12  29.32 
 
 		 264 aa  53.1  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.2 
 
 		 238 aa  53.1  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  31.5 
 
 		 310 aa  53.1  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4732  Methyltransferase type 11  37.19 
 
 		 241 aa  53.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1501  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.37 
 
 		 235 aa  53.1  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.209044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1825  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.37 
 
 		 235 aa  53.1  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6253  methyltransferase domain-containing protein  27.16 
 
 		 276 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2305  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.5 
 
 		 256 aa  52.8  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2962  methyltransferase type 11  30.1 
 
 		 401 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2589  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.31 
 
 		 262 aa  52.8  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  32.65 
 
 		 214 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7600  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.35 
 
 		 254 aa  52.4  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.192206 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 265 aa  52.4  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2319  hypothetical protein  27.5 
 
 		 356 aa  52.4  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5464  Methyltransferase type 11  32.28 
 
 		 212 aa  52.4  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.873364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2304  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.5 
 
 		 241 aa  52  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000612438 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2462  hypothetical protein  28.33 
 
 		 356 aa  52  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 238 aa  52.4  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  26.98 
 
 		 297 aa  52.4  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.59 
 
 		 230 aa  52  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  29.94 
 
 		 330 aa  52  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2114  Methyltransferase type 11  31.34 
 
 		 237 aa  52  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0120  Methyltransferase type 12  33.79 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1272  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.69 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.24 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0876  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.91 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000138589  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  32.1 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0201  methyltransferase type 12  34.34 
 
 		 185 aa  51.6  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0474  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.2 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  25.13 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>