More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2970 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2970  hypothetical protein  100 
 
 
226 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0549  hypothetical protein  80.44 
 
 
226 aa  353  2e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3404  methyltransferase type 11  65.18 
 
 
226 aa  295  4e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.236605  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1844  Methyltransferase type 11  31.68 
 
 
225 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00648646  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39860  methylase  30.7 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0996  Methyltransferase type 11  32.04 
 
 
246 aa  65.5  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1654  methyltransferase type 11  33.01 
 
 
173 aa  60.5  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.682174  hitchhiker  0.00196009 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2553  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.5 
 
 
229 aa  60.5  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.416549  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0058  Methyltransferase type 11  32.43 
 
 
354 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0981  methyltransferase type 11  45.61 
 
 
229 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0240  methyltransferase type 11  34.51 
 
 
217 aa  59.7  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.164188 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  35.29 
 
 
232 aa  58.2  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0976  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 
220 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  35.21 
 
 
624 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3359  hypothetical protein  28.71 
 
 
239 aa  56.6  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  26 
 
 
249 aa  56.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  40 
 
 
267 aa  56.2  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  37.07 
 
 
228 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2477  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
213 aa  55.5  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
269 aa  55.1  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  32.71 
 
 
259 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3042  methyltransferase type 11  38.24 
 
 
254 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0759  methyltransferase, putative  33.88 
 
 
216 aa  53.5  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2354  methyltransferase type 11  31.86 
 
 
231 aa  53.1  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.202193  normal  0.578326 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.33 
 
 
215 aa  53.1  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2591  methyltransferase  23.74 
 
 
250 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.59659e-17 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  36.7 
 
 
274 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2052  Methyltransferase type 11  33.88 
 
 
216 aa  53.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
269 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2422  hypothetical protein  33.88 
 
 
194 aa  53.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  31.67 
 
 
244 aa  53.5  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0221  Methyltransferase type 11  26.53 
 
 
208 aa  53.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.664721  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.28 
 
 
207 aa  53.1  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  27.63 
 
 
243 aa  52.4  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2828  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.4 
 
 
252 aa  52.4  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0566454  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.85 
 
 
236 aa  52.4  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930008  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  30.7 
 
 
268 aa  52.4  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3140  Methyltransferase type 11  37.25 
 
 
255 aa  52.4  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3241  Methyltransferase type 11  37.25 
 
 
255 aa  52.4  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  32.46 
 
 
269 aa  52  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3807  methyltransferase type 12  26.73 
 
 
237 aa  52  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  28.43 
 
 
252 aa  51.6  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10090  methyltransferase  32.46 
 
 
197 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.542368  normal  0.16327 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  38.53 
 
 
634 aa  51.6  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  29.57 
 
 
258 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0529  methyltransferase  30.61 
 
 
243 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2320  methyltransferase  23.74 
 
 
250 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.407436  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0674  hypothetical protein  30.49 
 
 
247 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.30135e-22 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  37.86 
 
 
273 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0905  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 
216 aa  51.2  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1938  hypothetical protein  34.95 
 
 
232 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000329837 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0795  hypothetical protein  35 
 
 
250 aa  51.2  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  39.32 
 
 
275 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  34.02 
 
 
224 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0533  methyltransferase type 11  29.27 
 
 
243 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  31 
 
 
471 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.76 
 
 
241 aa  51.6  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.874721 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3595  Methyltransferase type 12  34.95 
 
 
192 aa  50.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4108  hypothetical protein  30.93 
 
 
212 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.404315  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  30.69 
 
 
226 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4119  hypothetical protein  30.93 
 
 
212 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0995588  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4011  methyltransferase type 12  35.9 
 
 
317 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.550687  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  28.16 
 
 
246 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2577  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 
227 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1251  methyltransferase, putative  28.79 
 
 
229 aa  50.4  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04540  hypothetical protein  36 
 
 
237 aa  50.8  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4082  methyltransferase type 12  35.64 
 
 
198 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0341683  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02157  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase domain  31.34 
 
 
332 aa  50.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0675721  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0747  hypothetical protein  30.49 
 
 
243 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000483257  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8582  methyltransferase type 11  39 
 
 
247 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563755  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4494  hypothetical protein  30.93 
 
 
212 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.605831  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
263 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4508  hypothetical protein  30.93 
 
 
212 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000692373  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4457  hypothetical protein  30.93 
 
 
212 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.643189  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0585  hypothetical protein  29.27 
 
 
243 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4271  hypothetical protein  30.93 
 
 
212 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.208511  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1350  methyltransferase type 11  38.6 
 
 
244 aa  50.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
268 aa  50.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0085  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 
236 aa  50.1  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4455  hypothetical protein  30.93 
 
 
212 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.821165 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0619  hypothetical protein  29.27 
 
 
243 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4603  hypothetical protein  30.93 
 
 
212 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.964338  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1409  methyltransferase type 11  30.84 
 
 
243 aa  50.1  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.91 
 
 
234 aa  50.1  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4100  NodS  32.32 
 
 
192 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246696  normal  0.139963 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1974  Methyltransferase type 11  42.03 
 
 
260 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00383386  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0671  Methyltransferase type 11  34.21 
 
 
220 aa  49.7  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
339 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  28.57 
 
 
220 aa  49.3  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  28.57 
 
 
220 aa  49.3  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  28.57 
 
 
220 aa  49.3  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  30.69 
 
 
236 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.28 
 
 
256 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  28.57 
 
 
220 aa  49.3  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.7 
 
 
244 aa  49.7  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.28 
 
 
256 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  28.57 
 
 
220 aa  49.3  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2296  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.91 
 
 
236 aa  49.3  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  28.57 
 
 
220 aa  49.3  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  28.57 
 
 
220 aa  49.3  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>