More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0905 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0905  Methyltransferase type 11  100 
 
 
216 aa  434  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0759  methyltransferase, putative  91.67 
 
 
216 aa  396  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2052  Methyltransferase type 11  86.57 
 
 
216 aa  378  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0189  Methyltransferase type 11  81.13 
 
 
213 aa  352  2.9999999999999997e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.14372  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2422  hypothetical protein  87.5 
 
 
194 aa  340  1e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2207  Methyltransferase type 11  54.72 
 
 
219 aa  215  5e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0626  methyltransferase type 11  44.71 
 
 
224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00710227 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  39.58 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0009  hypothetical protein  39.24 
 
 
246 aa  98.2  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  33.19 
 
 
265 aa  95.5  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0026  methyltransferase type 11  39.16 
 
 
262 aa  92  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  37.42 
 
 
225 aa  89.4  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  39.24 
 
 
221 aa  88.6  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3111  Methyltransferase type 11  36.31 
 
 
241 aa  85.5  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0720  methyltransferase type 11  38.51 
 
 
225 aa  85.1  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1525  methyltransferase type 11  32.35 
 
 
273 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2036  Methyltransferase type 11  39.29 
 
 
268 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.98 
 
 
230 aa  79.3  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  38.24 
 
 
238 aa  79.3  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  35.29 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  41.75 
 
 
259 aa  72  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  28.71 
 
 
240 aa  71.6  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1587  SAM-dependent methyltransferase  32.17 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1306  Methyltransferase type 11  31.39 
 
 
223 aa  70.1  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  35.77 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  39.02 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  45.35 
 
 
232 aa  69.3  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1607  Methyltransferase type 11  42.06 
 
 
238 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12035  hypothetical protein  36.04 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4211  methyltransferase type 11  43.16 
 
 
250 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4277  methyltransferase type 11  43.16 
 
 
252 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  44 
 
 
291 aa  68.6  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4438  methyltransferase type 11  43.16 
 
 
252 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  37.37 
 
 
269 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  37.37 
 
 
269 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0010  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0544  Methyltransferase type 11  28.96 
 
 
212 aa  67  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0016502  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0840  methyltransferase type 11  25.97 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000045318  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  34.44 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  33.9 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  41.12 
 
 
258 aa  65.5  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  44.86 
 
 
236 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.26 
 
 
237 aa  64.3  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  40 
 
 
255 aa  64.3  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  32.03 
 
 
244 aa  63.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3929  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.72 
 
 
269 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.880276  normal  0.214466 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 
270 aa  63.5  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  34.95 
 
 
263 aa  62.8  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 
240 aa  62.8  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  32.58 
 
 
226 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  36.09 
 
 
276 aa  62.4  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  35.85 
 
 
355 aa  62.4  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  32.58 
 
 
226 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1526  methyltransferase type 11  27.17 
 
 
207 aa  62  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164104  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1951  methyltransferase type 11  30.21 
 
 
226 aa  62  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.319095  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2127  methyltransferase type 11  30.37 
 
 
229 aa  62  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0382045  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2186  hypothetical protein  32.58 
 
 
199 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286296  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.43 
 
 
250 aa  61.6  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  39.83 
 
 
266 aa  61.6  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3259  methyltransferase type 11  36.09 
 
 
244 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  31.82 
 
 
236 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  30.11 
 
 
225 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00200  conserved hypothetical protein  34.62 
 
 
276 aa  60.8  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40 
 
 
235 aa  60.8  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  42.11 
 
 
252 aa  60.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2106  hypothetical protein  31.82 
 
 
209 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5711  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
265 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  30.47 
 
 
261 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3301  methyltransferase type 11  40.86 
 
 
225 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0094  methyltransferase type 11  37.58 
 
 
235 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  31.82 
 
 
236 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2440  Methyltransferase type 11  36.07 
 
 
216 aa  61.2  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0165065  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0103  methyltransferase type 11  37.58 
 
 
235 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0892786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0084  methyltransferase type 11  37.58 
 
 
235 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.315622 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  37.23 
 
 
275 aa  60.5  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  34.09 
 
 
265 aa  60.1  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  31.82 
 
 
236 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  31.82 
 
 
236 aa  60.5  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  33.11 
 
 
266 aa  60.5  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  31.82 
 
 
236 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  38.24 
 
 
255 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  42.39 
 
 
283 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  36.84 
 
 
267 aa  60.1  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  35.29 
 
 
268 aa  60.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2460  methyltransferase type 11  38.68 
 
 
260 aa  60.5  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.930517  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0738  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
236 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0105  methyltransferase type 11  32.88 
 
 
247 aa  60.5  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 
235 aa  60.5  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  34 
 
 
201 aa  60.1  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  45.16 
 
 
262 aa  60.1  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1193  Methyltransferase type 11  24.88 
 
 
215 aa  60.1  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0170367  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  25.48 
 
 
235 aa  59.3  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  38.05 
 
 
273 aa  59.3  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  35.65 
 
 
319 aa  59.3  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1487  methyltransferase type 11  30.12 
 
 
207 aa  59.3  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
328 aa  58.9  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3206  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 
234 aa  58.9  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.457665  normal  0.153588 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4073  Methyltransferase type 11  31.18 
 
 
208 aa  59.3  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0601  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
268 aa  58.9  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>