More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2354 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2354  methyltransferase type 11  100 
 
 
231 aa  468  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.202193  normal  0.578326 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1504  Methyltransferase type 11  96.97 
 
 
198 aa  364  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39860  methylase  46.19 
 
 
241 aa  170  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2553  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  40.69 
 
 
229 aa  95.9  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.416549  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0981  methyltransferase type 11  38.41 
 
 
229 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1844  Methyltransferase type 11  30.99 
 
 
225 aa  68.2  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00648646  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1350  methyltransferase type 11  36.03 
 
 
244 aa  67.4  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0549  hypothetical protein  28.44 
 
 
226 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.26 
 
 
205 aa  61.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  32.08 
 
 
200 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  32.08 
 
 
200 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  27.56 
 
 
285 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  27.56 
 
 
285 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0198  methyltransferase type 11  34.58 
 
 
217 aa  60.1  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0695927  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  25.98 
 
 
285 aa  59.7  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  27.08 
 
 
202 aa  59.3  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  31.03 
 
 
237 aa  58.9  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.09 
 
 
258 aa  57.8  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  28.3 
 
 
293 aa  57  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 
269 aa  57  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1056  methyltransferase type 11  26.85 
 
 
221 aa  56.6  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.270016  normal  0.802402 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  35.09 
 
 
210 aa  56.6  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  27.42 
 
 
287 aa  56.6  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  33.01 
 
 
199 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  31.52 
 
 
239 aa  56.2  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  27.81 
 
 
274 aa  55.5  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3821  methyltransferase type 11  34.48 
 
 
203 aa  55.1  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951673  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  28.04 
 
 
201 aa  55.5  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  32.28 
 
 
237 aa  54.3  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  31.15 
 
 
243 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  31.15 
 
 
243 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  31.15 
 
 
243 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.95 
 
 
238 aa  54.7  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2358  methyltransferase type 11  35.16 
 
 
216 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.53267  normal  0.0101141 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  30.07 
 
 
238 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  33 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2970  hypothetical protein  30.77 
 
 
226 aa  53.9  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1546  NodS  32.28 
 
 
283 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377082  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  33 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1231  Methyltransferase type 12  29.01 
 
 
242 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  33.02 
 
 
262 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  33.62 
 
 
243 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0183  methyltransferase type 11  29.91 
 
 
223 aa  53.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0293588  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  31.62 
 
 
241 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  34.26 
 
 
187 aa  53.1  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  30.67 
 
 
319 aa  52.8  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  24.78 
 
 
213 aa  52.4  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0228  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 
276 aa  52.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  26.05 
 
 
317 aa  52.4  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  32.61 
 
 
278 aa  52.4  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 
257 aa  52.4  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1989  methyltransferase type 11  30.16 
 
 
218 aa  52  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512707  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  34.62 
 
 
241 aa  52  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  35 
 
 
208 aa  52  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  34.17 
 
 
275 aa  52  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 
221 aa  52  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4117  methyltransferase type 11  29.56 
 
 
250 aa  51.6  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0846884  normal  0.805423 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3788  type 11 methyltransferase  26.32 
 
 
306 aa  51.6  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.13 
 
 
235 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
282 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  22.61 
 
 
263 aa  51.2  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
268 aa  51.2  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  33.65 
 
 
241 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0373  Methyltransferase type 11  36.19 
 
 
222 aa  51.2  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
295 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  33.06 
 
 
243 aa  50.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2758  demethylmenaquinone methyltransferase  35.24 
 
 
256 aa  50.4  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0152  methyltransferase type 11  27.48 
 
 
296 aa  50.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.86 
 
 
269 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0368  Methyltransferase type 11  26.87 
 
 
365 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5837  Methyltransferase type 11  34.48 
 
 
206 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  34.23 
 
 
324 aa  50.1  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 
241 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.82 
 
 
241 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  34.21 
 
 
210 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 
252 aa  50.1  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1569  methyltransferase type 11  30.16 
 
 
268 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  21.6 
 
 
206 aa  50.1  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  31.68 
 
 
232 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  31.62 
 
 
241 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.77 
 
 
233 aa  50.1  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  26.81 
 
 
259 aa  49.7  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3056  methyltransferase type 11  31.07 
 
 
223 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000799279  normal  0.774854 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0600  methyltransferase type 11  34.75 
 
 
218 aa  49.7  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.93996  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  30.4 
 
 
190 aa  49.7  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  27.54 
 
 
204 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  27.54 
 
 
204 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  27.48 
 
 
204 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0864  methyltransferase type 11  29.27 
 
 
235 aa  49.7  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.81939  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  34 
 
 
228 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  29.19 
 
 
269 aa  49.3  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.78 
 
 
215 aa  49.3  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2472  methyltransferase type 11  32.35 
 
 
367 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3259  methyltransferase type 11  44.26 
 
 
244 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0507  Methyltransferase type 11  38.24 
 
 
258 aa  49.3  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459981  hitchhiker  0.00000192307 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  30.71 
 
 
265 aa  49.3  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3404  methyltransferase type 11  26.37 
 
 
226 aa  49.3  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.236605  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  30.83 
 
 
200 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2233  Methyltransferase type 11  30.14 
 
 
204 aa  49.3  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.569046  hitchhiker  0.00169364 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 
266 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>