More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1231 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1231  Methyltransferase type 12  100 
 
 
242 aa  498  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0005  methyltransferase  59.75 
 
 
267 aa  318  5e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.168517  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2379  Methyltransferase type 12  54.55 
 
 
240 aa  250  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2979  methyltransferase type 12  30.04 
 
 
237 aa  99.4  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1672  methyltransferase type 12  31.33 
 
 
258 aa  93.6  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3177  Methyltransferase type 12  30.3 
 
 
229 aa  92  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.616832  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3550  Methyltransferase type 12  28.63 
 
 
250 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2563  Methyltransferase type 12  28.63 
 
 
250 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.415136 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3069  Methyltransferase type 12  30.04 
 
 
229 aa  89.4  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0717  Methyltransferase type 12  31.09 
 
 
238 aa  89  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  28.95 
 
 
225 aa  87  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0530  putative methylase  29.7 
 
 
269 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1540  methyltransferase type 12  29.46 
 
 
229 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.549481  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1085  methyltransferase type 12  27.39 
 
 
235 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0285  hypothetical protein  25.22 
 
 
242 aa  82.4  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218355  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1197  methyltransferase type 12  28.76 
 
 
223 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.500309 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2686  methyltransferase type 12  29.11 
 
 
246 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0980634  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4615  Methyltransferase type 11  28.27 
 
 
253 aa  80.1  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369451  hitchhiker  0.00577635 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1549  methyltransferase type 12  25.21 
 
 
223 aa  78.6  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3301  hypothetical protein  26.32 
 
 
242 aa  78.6  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.163975 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  30.05 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39660  hypothetical protein  27.8 
 
 
269 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0142  hypothetical protein  27.95 
 
 
233 aa  72.8  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.233923  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1580  type 11 methyltransferase  24.03 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.487753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7775  hypothetical protein  24.89 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3981  methyltransferase type 12  24.5 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.457714  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1299  methyltransferase type 12  31.43 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3913  Methyltransferase type 12  29.46 
 
 
258 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00040245  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2412  Methyltransferase type 11  23.04 
 
 
240 aa  63.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.125357  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2559  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
228 aa  63.5  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1013  putative methyltransferase  22.57 
 
 
234 aa  62.4  0.000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.500806  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  27.52 
 
 
474 aa  62.4  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0676  conserved hypothetical protein, possible methylase  22.91 
 
 
234 aa  62.4  0.000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  41.23 
 
 
215 aa  62  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2655  Methyltransferase type 12  24.24 
 
 
270 aa  62  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0191778  normal  0.203757 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1203  Methyltransferase type 11  25.24 
 
 
239 aa  61.6  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
255 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3312  hypothetical protein  26.36 
 
 
211 aa  60.1  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
228 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0758  methyltransferase type 11  34.78 
 
 
261 aa  59.7  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00805232  hitchhiker  0.00000000000141502 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  25.59 
 
 
235 aa  59.3  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10090  methyltransferase  30.16 
 
 
197 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.542368  normal  0.16327 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  31.53 
 
 
268 aa  57.4  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0855  Methyltransferase type 11  26.42 
 
 
240 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.4 
 
 
264 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  33.09 
 
 
307 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.08 
 
 
205 aa  57  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0079  methyltransferase  22.77 
 
 
251 aa  57  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0729  putative methyltransferase  26.54 
 
 
246 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2399  Methyltransferase type 11  31.34 
 
 
210 aa  56.2  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.521103  normal  0.920683 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  25.37 
 
 
254 aa  56.2  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1449  hypothetical protein  26.09 
 
 
226 aa  56.2  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2730  methyltransferase type 12  28.26 
 
 
422 aa  56.2  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184055  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3993  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
358 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207791  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1384  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.43 
 
 
247 aa  55.5  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44871  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  25.58 
 
 
221 aa  55.5  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  28.5 
 
 
252 aa  55.5  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  30.63 
 
 
219 aa  55.8  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0698  putative methyltransferase  25 
 
 
242 aa  55.5  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  27.97 
 
 
190 aa  55.5  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  34.17 
 
 
252 aa  55.1  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3864  Methyltransferase type 11  27.1 
 
 
305 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  31.67 
 
 
259 aa  54.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0950  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  25.37 
 
 
230 aa  55.1  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.512948  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  29.8 
 
 
558 aa  54.7  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3913  Methyltransferase type 11  27.33 
 
 
305 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.100491  normal  0.248183 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.35 
 
 
258 aa  54.7  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 
268 aa  54.7  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  27.78 
 
 
202 aa  54.7  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2545  methyltransferase  21.55 
 
 
249 aa  53.9  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  30.07 
 
 
309 aa  53.9  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  33.06 
 
 
210 aa  53.9  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1275  putative methyltransferase  32.2 
 
 
234 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.46 
 
 
258 aa  54.3  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3087  methyltransferase type 11  30.49 
 
 
212 aa  54.3  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01042  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  23.9 
 
 
286 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2036  putative methyltransferase  25.11 
 
 
243 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3130  hypothetical protein  27.41 
 
 
305 aa  53.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  30 
 
 
314 aa  53.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1933  putative methyltransferase  25.11 
 
 
243 aa  53.5  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  28.21 
 
 
274 aa  53.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2425  putative methyltransferase  25.11 
 
 
243 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155722  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2309  putative methyltransferase  25.11 
 
 
243 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0515376  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3415  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.15 
 
 
260 aa  53.5  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2354  methyltransferase type 11  29.01 
 
 
231 aa  53.9  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.202193  normal  0.578326 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2081  putative methyltransferase  22.65 
 
 
243 aa  53.1  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.505974  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4083  Trans-aconitate 2-methyltransferase  30.51 
 
 
257 aa  52.8  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.30188 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3050  methyltransferase type 12  38.24 
 
 
224 aa  53.1  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  28.35 
 
 
263 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  25 
 
 
257 aa  52.8  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.89 
 
 
259 aa  52.8  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1654  methyltransferase type 11  28.06 
 
 
236 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.190237  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2435  methyltransferase, putative  25.11 
 
 
243 aa  52.4  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2579  methyltransferase type 11  31.96 
 
 
217 aa  52.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000242226  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2038  methyltransferase  25.11 
 
 
243 aa  52.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0465007  hitchhiker  0.0000090476 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3996  putative methyltransferase  26.83 
 
 
289 aa  52.4  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 
218 aa  52.4  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51145  predicted protein  25.97 
 
 
363 aa  52.4  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0872  hypothetical protein  27.56 
 
 
316 aa  52  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0354264  normal  0.0675112 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0628  methyltransferase type 11  30.25 
 
 
235 aa  52  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>