More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2559 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2559  methyltransferase type 11  100 
 
 		 228 aa  457  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2710  methyltransferase type 11  47.37 
 
 		 219 aa  172  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0189478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2428  methyltransferase type 12  39.44 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2683  methyltransferase type 11  34.1 
 
 		 220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  33.49 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0373  Methyltransferase type 11  40.12 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  33.14 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  33.12 
 
 		 239 aa  78.2  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0198  methyltransferase type 11  33.79 
 
 		 217 aa  78.2  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0695927  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3419  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.6 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  38.83 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  33.53 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0183  methyltransferase type 11  31.72 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0293588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  35.56 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.36 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4511  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  32.28 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1088  Methyltransferase type 11  44.44 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2116  methyltransferase type 11  40.86 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.518004  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  37.25 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1652  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.17 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.583368 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2111  methyltransferase type 11  37.86 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.296971 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1475  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  28.26 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576982  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04551  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.38 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.95 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5586  Methyltransferase type 11  43.21 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.196982  hitchhiker  0.00869296 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0005  methyltransferase  29.71 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.168517  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1231  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4204  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.06 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0197  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0186  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3222  methyltransferase type 12  38.27 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.361207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0374  demethylmenaquinone methyltransferase  32.61 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0403  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.61 
 
 		 235 aa  62  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204673  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04271  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.39 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0402  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.61 
 
 		 235 aa  62  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3894  methyltransferase type 11  40.74 
 
 		 257 aa  62  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0729  putative methyltransferase  30 
 
 		 246 aa  62  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4209  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  30.22 
 
 		 248 aa  62  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  38.24 
 
 		 244 aa  62  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0797  Methyltransferase type 12  32.42 
 
 		 245 aa  62  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1762  demethylmenaquinone methyltransferase  27.45 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  33.79 
 
 		 253 aa  61.6  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2641  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  30.57 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  37.69 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1338  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  29.45 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0007  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  29.45 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  37.96 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04841  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  26.8 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0927  Methyltransferase type 11  40.74 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  36.28 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04861  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  28.75 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.020806  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0193  methyltransferase type 12  32.43 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.111686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5849  Methyltransferase type 12  34.58 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.13763 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0628  methyltransferase type 11  30.99 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  36.75 
 
 		 400 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4141  methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2379  Methyltransferase type 12  33.6 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0501  methyltransferase type 12  38.75 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2593  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.14 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00547032  decreased coverage  0.0000000226487 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  36.75 
 
 		 400 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.25 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0924  Methyltransferase type 11  39.51 
 
 		 253 aa  58.5  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.132405  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1760  type 11 methyltransferase  34.31 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0430  demethylmenaquinone methyltransferase  28.75 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1591  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.57 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2232  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.27 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.618001  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1886  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  27.39 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0876  methyltransferase type 11  38.27 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2198  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.05 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0914  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.11 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 275 aa  57  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3368  2-polyprenylmethoxybenozoquinol methylase  29.41 
 
 		 250 aa  57  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2697  methyltransferase type 12  34.57 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3616  S-adenosylmethionine:diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase-like protein  32.53 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.324719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  31.97 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2359  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.53 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.36 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0503  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.09 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1570  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.08 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.375212  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2054  hypothetical protein  26.76 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.638121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11406  transferase  30.91 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000309281  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4744  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.06 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.752989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  30.46 
 
 		 440 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1261  Methyltransferase type 12  36.25 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506996 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2248  demethylmenaquinone methyltransferase  30.5 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10090  methyltransferase  29.79 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.542368  normal  0.16327 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2254  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.4 
 
 		 417 aa  55.8  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.249887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.99 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0285  hypothetical protein  25.17 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218355  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  30.25 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3469  Methyltransferase type 11  26.12 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.508961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1312  methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 257 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3130  hypothetical protein  25.52 
 
 		 305 aa  54.7  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  35.51 
 
 		 414 aa  54.7  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2259  methyltransferase type 11  28 
 
 		 196 aa  55.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>