More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3469 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3469  Methyltransferase type 11  100 
 
 
243 aa  503  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.508961  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4679  Methyltransferase type 11  59.9 
 
 
251 aa  248  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2150  methyltransferase type 11  54.67 
 
 
255 aa  247  1e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.301161  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2226  hypothetical protein  50 
 
 
251 aa  246  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0768  Methyltransferase type 11  57 
 
 
276 aa  235  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4188  Methyltransferase type 11  49.37 
 
 
278 aa  198  6e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1181  Methyltransferase type 11  43.51 
 
 
397 aa  112  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.694662  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1338  Methyltransferase type 11  34.48 
 
 
244 aa  99.4  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.482498  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2515  methyltransferase type 11  34.48 
 
 
222 aa  99  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0656  methyltransferase type 11  35.38 
 
 
280 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.656223  normal  0.351614 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1436  Methyltransferase type 11  33.91 
 
 
231 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00774998  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3178  methyltransferase type 11  33.14 
 
 
239 aa  95.9  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.184817 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0667  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 
243 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.0338996 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3622  methyltransferase type 11  33.54 
 
 
243 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.932817  normal  0.0502026 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0635  Methyltransferase type 11  33.08 
 
 
244 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1351  methyltransferase type 11  33.91 
 
 
217 aa  89  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884704  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2464  Methyltransferase type 11  36.09 
 
 
187 aa  88.2  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788915  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6718  Methyltransferase type 11  28.09 
 
 
252 aa  88.2  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2622  Methyltransferase type 11  28.65 
 
 
191 aa  84.3  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.179692  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2707  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 
199 aa  82.8  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3326  Methyltransferase type 11  35.09 
 
 
186 aa  80.9  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2897  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 
189 aa  79  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4278  Methyltransferase type 11  34.57 
 
 
186 aa  77.8  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.867588  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4328  Methyltransferase type 11  35.57 
 
 
188 aa  77  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  35.34 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0558  Methyltransferase type 11  33.62 
 
 
188 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0166016  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1507  hypothetical protein  30.37 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3707  Methyltransferase type 11  33.72 
 
 
184 aa  71.2  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.52514  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0881  hypothetical protein  31.16 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.421379  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2313  generic methyltransferase  34.45 
 
 
252 aa  66.2  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0714275  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1251  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 
216 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000494899  normal  0.377886 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0437  Methyltransferase type 11  32.59 
 
 
189 aa  64.7  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.598014  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  25 
 
 
211 aa  63.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  29.03 
 
 
283 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4221  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 
220 aa  63.5  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0758  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 
189 aa  63.5  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00287175  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  27.75 
 
 
312 aa  62.8  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1067  transcriptional regulator, ArsR family  35.58 
 
 
305 aa  63.2  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.420275 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  38.89 
 
 
263 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0557  Methyltransferase type 11  26.49 
 
 
206 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  36.45 
 
 
277 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.78 
 
 
207 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 
415 aa  60.1  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  25.62 
 
 
250 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.21 
 
 
201 aa  59.7  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8173  Methyltransferase type 11  28.74 
 
 
254 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781909  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  25 
 
 
420 aa  59.3  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0604  Methyltransferase type 11  24.31 
 
 
194 aa  58.9  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1832  methyltransferase type 11  30.71 
 
 
203 aa  58.9  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3310  methyltransferase type 11  35.4 
 
 
192 aa  58.5  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00554158  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5813  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 
258 aa  58.9  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288082  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  32.9 
 
 
190 aa  58.5  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  34.58 
 
 
277 aa  58.5  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.58 
 
 
280 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2559  methyltransferase type 11  27.97 
 
 
228 aa  58.5  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2303  Methyltransferase type 11  29.35 
 
 
190 aa  58.5  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0543227  normal  0.375483 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2377  Methyltransferase type 11  35.65 
 
 
190 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.954171  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  25.85 
 
 
250 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.98 
 
 
207 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3456  hypothetical protein  24.86 
 
 
251 aa  57  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1330  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.34 
 
 
205 aa  55.8  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.283996  normal  0.0130791 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
288 aa  55.8  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  25.35 
 
 
250 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28.92 
 
 
266 aa  55.8  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  35.92 
 
 
239 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0687  hypothetical protein  24.18 
 
 
249 aa  55.5  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.96804  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  35.92 
 
 
239 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  35.92 
 
 
239 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3596  methyltransferase type 11  28.41 
 
 
241 aa  54.7  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1475  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.56 
 
 
221 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576982  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0246  methyltransferase type 11  26.32 
 
 
201 aa  54.7  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2029  Methyltransferase type 12  26.43 
 
 
215 aa  55.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  35.64 
 
 
242 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  30.57 
 
 
280 aa  55.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1654  methyltransferase type 11  30.83 
 
 
173 aa  54.7  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.682174  hitchhiker  0.00196009 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2395  Methyltransferase type 11  27.5 
 
 
208 aa  55.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000965249  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2447  methyltransferase type 11  28.1 
 
 
284 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.204404  normal  0.251404 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  33.33 
 
 
258 aa  54.3  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1433  methyltransferase type 11  28.67 
 
 
190 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2993  methyltransferase type 12  27.88 
 
 
351 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1693  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.43 
 
 
234 aa  54.3  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6246  Methyltransferase type 12  30.97 
 
 
349 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106567  normal  0.283014 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5491  methyltransferase  26.37 
 
 
281 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0707326 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  23.29 
 
 
250 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1710  methyltransferase type 11  35 
 
 
262 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  23.97 
 
 
250 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  23.97 
 
 
250 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  33.59 
 
 
267 aa  53.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3209  precorrin-8W decarboxylase  27.78 
 
 
186 aa  53.5  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4072  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 
192 aa  53.5  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  23.29 
 
 
250 aa  53.5  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1278  putative methyltransferase  27.33 
 
 
275 aa  52.8  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.337373  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.95 
 
 
209 aa  53.1  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  29.41 
 
 
285 aa  53.1  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  23.97 
 
 
250 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  23.97 
 
 
250 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
262 aa  53.1  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0457  methyltransferase type 11  27.37 
 
 
208 aa  53.1  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  26.45 
 
 
265 aa  52.8  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>