More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3616 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3616  S-adenosylmethionine:diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase-like protein  100 
 
 
216 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.324719  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2516  methyltransferase type 11  74.76 
 
 
210 aa  296  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0857  S-adenosylmethionine-diacylgycerolhomoserine-N- methlytransferase  74.76 
 
 
210 aa  296  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3050  methyltransferase type 12  52.13 
 
 
224 aa  204  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0729  putative methyltransferase  52.2 
 
 
246 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0628  methyltransferase type 11  52.2 
 
 
235 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2022  methyltransferase type 11  51.44 
 
 
220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.488297  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2111  methyltransferase type 11  51.66 
 
 
224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296971 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1727  methyltransferase type 12  48.15 
 
 
230 aa  196  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1275  putative methyltransferase  52.45 
 
 
234 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0820  methyltransferase type 11  51.21 
 
 
226 aa  192  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191685  normal  0.813143 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2916  O-methyltransferase  49.51 
 
 
206 aa  186  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2874  Methyltransferase type 11  51.11 
 
 
224 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0919365  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0797  Methyltransferase type 12  49.76 
 
 
245 aa  185  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2614  Methyltransferase type 11  50.55 
 
 
224 aa  185  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126775  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4002  Methyltransferase type 11  31.54 
 
 
238 aa  71.6  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42872  predicted protein  32.97 
 
 
808 aa  68.2  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32640  predicted protein  30.13 
 
 
771 aa  67.4  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.622568  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  33.9 
 
 
271 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  29.31 
 
 
200 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  29.31 
 
 
200 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27669  predicted protein  26.99 
 
 
907 aa  62  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3689  Methyltransferase type 11  38.14 
 
 
195 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2862  methyltransferase type 11  30.29 
 
 
207 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.11 
 
 
269 aa  58.5  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0402  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
235 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2685  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  37.86 
 
 
229 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0403  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
235 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204673  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0374  demethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 
235 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  32.11 
 
 
199 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2559  methyltransferase type 11  32.53 
 
 
228 aa  56.6  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0730  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.05 
 
 
207 aa  56.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  37.72 
 
 
212 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2097  hypothetical protein  31.15 
 
 
207 aa  55.8  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  31.39 
 
 
319 aa  55.5  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1939  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.78 
 
 
220 aa  55.5  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  24.52 
 
 
211 aa  55.1  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1497  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35.17 
 
 
212 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3961  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35.66 
 
 
212 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19610  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.19 
 
 
207 aa  55.1  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0633091  normal  0.0668245 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  26.04 
 
 
213 aa  54.3  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  27.27 
 
 
202 aa  54.7  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0988  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  36.99 
 
 
212 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.387372  decreased coverage  0.00000591406 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  36.7 
 
 
202 aa  54.7  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2195  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  35.24 
 
 
213 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5117  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.17 
 
 
217 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.013812  hitchhiker  0.00397391 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.58 
 
 
258 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0345  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.33 
 
 
228 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0696  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 
229 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.82 
 
 
205 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4115  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.72 
 
 
212 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2021  Methyltransferase type 11  45.59 
 
 
268 aa  53.5  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0696  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.87 
 
 
212 aa  53.9  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5739  methyltransferase type 11  31.11 
 
 
208 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  37.84 
 
 
268 aa  53.1  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3328  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  41.51 
 
 
210 aa  53.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1882  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  30.73 
 
 
211 aa  52.8  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43688  predicted protein  35.71 
 
 
378 aa  52.8  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.569479  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3833  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
363 aa  52.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2161  Methyltransferase type 12  32.03 
 
 
237 aa  52.8  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.135573  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4204  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.59 
 
 
233 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2086  hypothetical protein  30.33 
 
 
207 aa  52.4  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1427  Methyltransferase type 11  38.32 
 
 
237 aa  52  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.527187  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0914  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.33 
 
 
255 aa  52.4  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2232  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.68 
 
 
232 aa  52.4  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.618001  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6211  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  35.78 
 
 
225 aa  52  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2210  methyltransferase type 11  35.51 
 
 
203 aa  52  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4809  Methyltransferase type 11  36.43 
 
 
229 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  29.41 
 
 
204 aa  51.6  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0604  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.43 
 
 
212 aa  50.8  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.977459  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4492  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  26.32 
 
 
218 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2440  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.56 
 
 
204 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.330514 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  32.14 
 
 
270 aa  50.8  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2189  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.4 
 
 
229 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  31.09 
 
 
204 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2376  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  29.37 
 
 
204 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0368  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 
365 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0721  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  29.37 
 
 
204 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.635481  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  32.41 
 
 
233 aa  50.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1309  Methyltransferase type 11  32.34 
 
 
231 aa  50.8  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.0297047 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6066  Methyltransferase type 11  29.22 
 
 
217 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.451332  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.78 
 
 
234 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360433  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  30 
 
 
204 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3244  methyltransferase type 11  33.71 
 
 
208 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596392  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1535  methyltransferase type 11  38.4 
 
 
265 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0615869  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.24 
 
 
233 aa  49.7  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1620  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  25.73 
 
 
218 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 
204 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  30 
 
 
204 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  31.09 
 
 
204 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  30 
 
 
204 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0007  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  31.4 
 
 
250 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2593  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.4 
 
 
250 aa  49.3  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00547032  decreased coverage  0.0000000226487 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1338  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  31.4 
 
 
250 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3996  putative methyltransferase  29.19 
 
 
289 aa  49.7  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  30.25 
 
 
204 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0492  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  29.5 
 
 
232 aa  49.7  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  31.53 
 
 
267 aa  49.3  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0519  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.43 
 
 
229 aa  49.7  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  31.86 
 
 
256 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>