More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0797 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0797  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 245 aa  501  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0729  putative methyltransferase  76.19 
 
 		 246 aa  364  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0628  methyltransferase type 11  76.09 
 
 		 235 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1275  putative methyltransferase  66.37 
 
 		 234 aa  298  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0820  methyltransferase type 11  55.3 
 
 		 226 aa  212  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191685  normal  0.813143 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3050  methyltransferase type 12  52.86 
 
 		 224 aa  210  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1727  methyltransferase type 12  48.39 
 
 		 230 aa  195  7e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2022  methyltransferase type 11  49.28 
 
 		 220 aa  193  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.488297  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2874  Methyltransferase type 11  50.72 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0919365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2614  Methyltransferase type 11  49.52 
 
 		 224 aa  188  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2111  methyltransferase type 11  49.07 
 
 		 224 aa  186  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.296971 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3616  S-adenosylmethionine:diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase-like protein  49.76 
 
 		 216 aa  185  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.324719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0857  S-adenosylmethionine-diacylgycerolhomoserine-N- methlytransferase  49.03 
 
 		 210 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2516  methyltransferase type 11  49.03 
 
 		 210 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2916  O-methyltransferase  49.04 
 
 		 206 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4002  Methyltransferase type 11  36.31 
 
 		 238 aa  86.7  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27669  predicted protein  30.99 
 
 		 907 aa  68.9  0.00000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32640  predicted protein  30.48 
 
 		 771 aa  66.2  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.622568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 278 aa  62  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2559  methyltransferase type 11  32.42 
 
 		 228 aa  62  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3735  Methyltransferase type 11  30.07 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286886  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  32.12 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.71 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3996  putative methyltransferase  29.55 
 
 		 289 aa  58.5  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  30.37 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2021  Methyltransferase type 11  25.13 
 
 		 268 aa  55.1  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0696  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.45 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 337 aa  55.1  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2676  Methyltransferase type 11  29.31 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  32.61 
 
 		 341 aa  55.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7094  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.68 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000661752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0469  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.6 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2716  Methyltransferase type 11  29.33 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.182754  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  31.01 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 268 aa  53.5  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2685  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.53 
 
 		 229 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  29.55 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0730  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.92 
 
 		 207 aa  53.1  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0604  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.92 
 
 		 212 aa  53.1  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.977459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.44 
 
 		 269 aa  53.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 317 aa  53.1  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  31.3 
 
 		 240 aa  52.8  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1882  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  31.51 
 
 		 211 aa  52.8  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  29.49 
 
 		 252 aa  52.8  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1427  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 237 aa  52.4  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.527187  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1475  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  22.86 
 
 		 221 aa  52.4  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576982  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1437  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.53 
 
 		 237 aa  52  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0826  methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 224 aa  52  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.457177  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  32.2 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42872  predicted protein  29.01 
 
 		 808 aa  51.6  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1339  methyltransferase type 11  25.34 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0696  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.64 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2418  Methyltransferase type 11  33.58 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.224648 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1569  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.53 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.781622  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 337 aa  50.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1280  Methyltransferase type 11  26.8 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.78 
 
 		 276 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3086  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  34.04 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.97 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360433  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.86 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.89 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  28.38 
 
 		 199 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1462  methyltransferase type 11  26.61 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3776  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.53 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0393069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.15 
 
 		 241 aa  50.1  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.15 
 
 		 241 aa  50.1  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 206 aa  50.4  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 261 aa  50.4  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  34.51 
 
 		 228 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_002936  DET1591  UbiE/COQ5 family methlytransferase  24.66 
 
 		 221 aa  49.7  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1640  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.85 
 
 		 237 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.169643  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1423  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.85 
 
 		 237 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.85 
 
 		 237 aa  49.7  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.85 
 
 		 237 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 327 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1534  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.85 
 
 		 237 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3036  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.16 
 
 		 229 aa  50.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.133888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  29.2 
 
 		 344 aa  49.7  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.98 
 
 		 245 aa  49.7  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2161  Methyltransferase type 12  29.05 
 
 		 237 aa  49.7  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.135573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  27.97 
 
 		 254 aa  49.7  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.85 
 
 		 237 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000970326  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5049  methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 273 aa  49.7  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1607  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.85 
 
 		 237 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000707225 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3259  hypothetical protein  25 
 
 		 248 aa  49.3  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.15 
 
 		 248 aa  49.3  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0843  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  28.57 
 
 		 217 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 341 aa  49.3  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2195  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  31.69 
 
 		 213 aa  49.7  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0758  methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 261 aa  49.3  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00805232  hitchhiker  0.00000000000141502 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.95 
 
 		 235 aa  49.3  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1497  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.35 
 
 		 212 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4809  Methyltransferase type 11  27.88 
 
 		 229 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2440  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.36 
 
 		 204 aa  48.9  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.330514 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2428  methyltransferase type 12  26.16 
 
 		 225 aa  48.9  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1231  Methyltransferase type 12  30.83 
 
 		 242 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2676  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30 
 
 		 485 aa  48.9  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4690  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32 
 
 		 206 aa  48.5  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.179715 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.2 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>