More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6814 on replicon NC_013731
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  100 
 
 
219 aa  453  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  76.61 
 
 
227 aa  352  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2683  methyltransferase type 11  39.15 
 
 
220 aa  159  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2428  methyltransferase type 12  33.48 
 
 
225 aa  105  8e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2710  methyltransferase type 11  30.23 
 
 
219 aa  102  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0189478  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2559  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
228 aa  100  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.02 
 
 
215 aa  88.2  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2653  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.86 
 
 
232 aa  84.7  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  29.69 
 
 
283 aa  82.4  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.01 
 
 
237 aa  79  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.05 
 
 
233 aa  77  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0373  Methyltransferase type 11  36.42 
 
 
222 aa  76.6  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.28 
 
 
237 aa  75.1  0.0000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  39.84 
 
 
263 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  29.15 
 
 
213 aa  72.8  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  32.77 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  32.77 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1167  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.33 
 
 
259 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000217887  hitchhiker  0.00731668 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  28.49 
 
 
228 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.64 
 
 
207 aa  72  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1339  methyltransferase type 11  24.54 
 
 
220 aa  72  0.000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1591  UbiE/COQ5 family methlytransferase  24.39 
 
 
221 aa  71.6  0.000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3419  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.17 
 
 
299 aa  71.6  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  38 
 
 
194 aa  70.1  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0160  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.08 
 
 
293 aa  69.7  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0198  methyltransferase type 11  30.34 
 
 
217 aa  69.3  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0695927  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2158  methyltransferase type 11  31.11 
 
 
363 aa  68.9  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1475  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  24.43 
 
 
221 aa  69.3  0.00000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576982  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
348 aa  68.6  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1554  hypothetical protein  26.37 
 
 
315 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000923024  normal  0.0128521 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0469  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.66 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  35.21 
 
 
312 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  26.78 
 
 
239 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  31.67 
 
 
239 aa  66.2  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  33.98 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51145  predicted protein  28.3 
 
 
363 aa  65.9  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  32.04 
 
 
244 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  32.43 
 
 
244 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  32 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3788  type 11 methyltransferase  33.87 
 
 
306 aa  65.1  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0285  hypothetical protein  27.59 
 
 
242 aa  65.1  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218355  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2020  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.75 
 
 
236 aa  65.1  0.0000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  35.85 
 
 
225 aa  65.1  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00761  hypothetical protein  38.83 
 
 
246 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286204  normal  0.107855 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3913  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
305 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.100491  normal  0.248183 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0705  Methyltransferase type 11  29.36 
 
 
300 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.716094  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3864  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
305 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0867  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE, putative  27.15 
 
 
256 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.77 
 
 
241 aa  63.5  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3407  ubiquinone/menaquinone methyltransferase  25.41 
 
 
322 aa  63.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000119678  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3130  hypothetical protein  27.95 
 
 
305 aa  63.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  36 
 
 
309 aa  63.5  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  26.6 
 
 
226 aa  63.5  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  36.79 
 
 
242 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4330  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.67 
 
 
236 aa  63.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.249898  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2096  type 11 methyltransferase  27.75 
 
 
207 aa  63.9  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3444  hypothetical protein  25.41 
 
 
322 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000102357  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3714  hypothetical protein  25.41 
 
 
315 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000001291  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2539  Methyltransferase type 11  30.19 
 
 
237 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.459192  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.08 
 
 
241 aa  63.2  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2332  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.63 
 
 
208 aa  63.2  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000815001  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09391  methyltransferase  33.33 
 
 
351 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.08 
 
 
241 aa  63.2  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  32.65 
 
 
225 aa  62.8  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  33.33 
 
 
292 aa  62.8  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4369  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 
315 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4431  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 
315 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.184386 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0183  methyltransferase type 11  31.72 
 
 
223 aa  62.8  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0293588  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1652  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.87 
 
 
254 aa  62.8  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.583368 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  32.24 
 
 
285 aa  62.8  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.75 
 
 
236 aa  62.4  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0140  methyltransferase  35.71 
 
 
353 aa  62.4  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07721  methyltransferase  34.82 
 
 
353 aa  62.4  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0608577 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2054  hypothetical protein  29.03 
 
 
313 aa  62.4  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.638121  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  34.45 
 
 
257 aa  62.4  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 
240 aa  62  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2710  demethylmenaquinone methyltransferase  28.29 
 
 
243 aa  62.4  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  31.34 
 
 
275 aa  62  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3762  hypothetical protein  26.04 
 
 
315 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000334692  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0879  SAM (and some other nucleotide) binding motif:Generic methyl-transferase  33.65 
 
 
351 aa  62  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4209  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  26.53 
 
 
266 aa  62  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4314  methyltransferase type 11  30.07 
 
 
212 aa  61.6  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3356  ubiquinone/menaquinone methyltransferase  24.87 
 
 
318 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000127941  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  33.93 
 
 
254 aa  60.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11780  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.37 
 
 
262 aa  61.6  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09381  methyltransferase  32.48 
 
 
351 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.398692  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  32.43 
 
 
292 aa  60.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.68 
 
 
258 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10041  methyltransferase  31.97 
 
 
351 aa  60.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0744  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
248 aa  60.8  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0330334  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3373  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.84 
 
 
251 aa  60.5  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4839  putative methyltransferase  32.94 
 
 
271 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3551  demethylmenaquinone methyltransferase  24.74 
 
 
251 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0405  demethylmenaquinone methyltransferase  24.74 
 
 
251 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.403287  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3725  demethylmenaquinone methyltransferase  24.74 
 
 
251 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4096  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.26 
 
 
251 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>