More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4090 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  100 
 
 		 239 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  98.74 
 
 		 239 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  73.42 
 
 		 242 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  73.42 
 
 		 242 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  71.6 
 
 		 250 aa  360  8e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  72.92 
 
 		 242 aa  359  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  71.37 
 
 		 244 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_003296  RS00761  hypothetical protein  72.81 
 
 		 246 aa  337  8e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286204  normal  0.107855 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  66.09 
 
 		 239 aa  317  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  65.94 
 
 		 241 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  64.35 
 
 		 244 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  33.12 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  33.12 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  33.12 
 
 		 204 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  32.05 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  39.53 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  33.12 
 
 		 204 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  33.12 
 
 		 204 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2320  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  33.8 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  36.63 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  30.26 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2210  methyltransferase type 11  29.93 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1559  Methyltransferase type 11  33.76 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0523794  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.07 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1986  methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110241 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  38.14 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  36.43 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  35.25 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3264  methyltransferase type 11  31.52 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.776715 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  33.85 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  29.08 
 
 		 227 aa  67  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 202 aa  67  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2376  Methyltransferase type 11  28.22 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578401  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3895  methyltransferase type 11  31.45 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3903  methyltransferase type 11  31.45 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.808495 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2526  methyltransferase type 11  35.04 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0981998 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 		 1106 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3171  methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19610  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.33 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0633091  normal  0.0668245 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0182  Methyltransferase type 11  32.24 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0334724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0314  putative methyltransferase  26.9 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.19 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  36.63 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  31.29 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  31.09 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  36.08 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0260  hypothetical protein  27.91 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0274  hypothetical protein  27.91 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.80045  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  37.61 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  33.67 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  34.97 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  36.27 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  29.11 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  33.07 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3814  methyltransferase type 11  35.9 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  30.15 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  29.84 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  36.54 
 
 		 352 aa  62.4  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1161  methyltransferase type 11  35.85 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10041  methyltransferase  26.79 
 
 		 351 aa  62  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0320  hypothetical protein  29.32 
 
 		 290 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2319  generic methyltransferase  31.13 
 
 		 210 aa  62  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.897419  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0335  hypothetical protein  27.91 
 
 		 290 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39860  methylase  34.19 
 
 		 241 aa  62  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  38.6 
 
 		 271 aa  61.6  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1811  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  32.43 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  29.11 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  29.11 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  35.92 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  34.48 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  29.25 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  31.48 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.35 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.03 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5795  Methyltransferase type 11  36 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4310  hypothetical protein  40.82 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1127  Methyltransferase type 11  28.66 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2862  methyltransferase type 11  31.06 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  35.54 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  35.58 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3846  putative methyltransferase ubiE/COQ5 family  31.17 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.583895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>