More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2158 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2158  methyltransferase type 11  100 
 
 
363 aa  716    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3833  methyltransferase type 11  37.46 
 
 
363 aa  211  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2414  hypothetical protein  37.1 
 
 
351 aa  202  7e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.177274  normal  0.0190439 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10041  methyltransferase  41.32 
 
 
351 aa  202  9e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16301  methyltransferase  42.47 
 
 
357 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.346442 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09391  methyltransferase  40.5 
 
 
351 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09381  methyltransferase  40.25 
 
 
351 aa  200  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.398692  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0879  SAM (and some other nucleotide) binding motif:Generic methyl-transferase  35.93 
 
 
351 aa  200  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07721  methyltransferase  34.62 
 
 
353 aa  197  3e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0608577 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0140  methyltransferase  34.94 
 
 
353 aa  197  3e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2995  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 
363 aa  196  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482606  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2205  Methyltransferase type 11  33.43 
 
 
362 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000273998 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10291  methyltransferase  35.69 
 
 
352 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.55915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0149  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.63 
 
 
351 aa  193  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1266  generic methyl-transferase  36.88 
 
 
357 aa  192  6e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_4986  predicted protein  46.38 
 
 
239 aa  192  7e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.778509 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1204  generic methyl-transferase  38.22 
 
 
363 aa  190  4e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0368  Methyltransferase type 11  35.52 
 
 
365 aa  186  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  36.33 
 
 
317 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  31.98 
 
 
286 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  31 
 
 
283 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3419  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.32 
 
 
299 aa  90.9  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51145  predicted protein  29.05 
 
 
363 aa  81.6  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0758  methyltransferase type 11  32.12 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00805232  hitchhiker  0.00000000000141502 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2054  hypothetical protein  31.76 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.638121  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  30.62 
 
 
263 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3788  type 11 methyltransferase  29.55 
 
 
306 aa  78.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3913  Methyltransferase type 11  29.44 
 
 
305 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.100491  normal  0.248183 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3864  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 
305 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2096  type 11 methyltransferase  31.34 
 
 
207 aa  74.7  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  37.9 
 
 
227 aa  73.2  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2233  Methyltransferase type 11  35.62 
 
 
204 aa  72  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.569046  hitchhiker  0.00169364 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4441  methyltransferase type 11  28.18 
 
 
294 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1339  methyltransferase type 11  29.03 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1591  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.49 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3130  hypothetical protein  25.4 
 
 
305 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  31.11 
 
 
219 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1475  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.26 
 
 
221 aa  68.6  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576982  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  36.03 
 
 
212 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1836  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  30.77 
 
 
246 aa  67  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  30.26 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2730  methyltransferase type 12  30 
 
 
422 aa  66.2  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184055  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2539  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
237 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.459192  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0872  hypothetical protein  28.82 
 
 
316 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0354264  normal  0.0675112 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0705  Methyltransferase type 11  27.95 
 
 
300 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.716094  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2596  Methyltransferase type 11  26.53 
 
 
311 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0152  methyltransferase type 11  24.77 
 
 
296 aa  63.9  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2956  methyltransferase type 11  26.01 
 
 
304 aa  63.5  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626473  normal  0.0682436 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  34.44 
 
 
200 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  34.44 
 
 
200 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.79 
 
 
207 aa  63.2  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6252  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
251 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.015779 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  33.92 
 
 
293 aa  62.4  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1645  methyltransferase  32.95 
 
 
209 aa  62  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  38.83 
 
 
199 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  28.83 
 
 
268 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1272  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35 
 
 
228 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  28.83 
 
 
268 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  27.81 
 
 
211 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2016  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.55 
 
 
299 aa  60.8  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
209 aa  60.8  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4082  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 
235 aa  60.8  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  36.59 
 
 
242 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3821  methyltransferase type 11  35.45 
 
 
203 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951673  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  30.15 
 
 
214 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  36.59 
 
 
242 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12966  methyltransferase  34.38 
 
 
270 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0711  Methyltransferase type 11  28.23 
 
 
275 aa  60.1  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0787386  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.19 
 
 
272 aa  60.1  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  29.38 
 
 
281 aa  60.1  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.8 
 
 
215 aa  60.1  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4330  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.14 
 
 
236 aa  60.1  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.249898  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1190  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.66 
 
 
272 aa  60.1  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2422  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
221 aa  59.7  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.840321  normal  0.14599 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  32.38 
 
 
399 aa  60.1  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  35.45 
 
 
207 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  34.23 
 
 
281 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.93 
 
 
241 aa  59.7  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.93 
 
 
241 aa  59.7  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07641  methyltransferase  31.28 
 
 
209 aa  59.7  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  35.45 
 
 
207 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  30.3 
 
 
243 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  35.66 
 
 
250 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  33.64 
 
 
399 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0316  Methyltransferase type 11  37.82 
 
 
251 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3844  hypothetical protein  36.45 
 
 
524 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0476944 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  32.88 
 
 
272 aa  59.3  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00761  hypothetical protein  35.77 
 
 
246 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286204  normal  0.107855 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32.91 
 
 
268 aa  58.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1236  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.77 
 
 
237 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.228899  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0353  methyltransferase type 12  30.77 
 
 
300 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0874936 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.68 
 
 
245 aa  58.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0381  methyltransferase type 11  29.61 
 
 
200 aa  58.5  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0402  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.61 
 
 
200 aa  57.8  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  37.37 
 
 
207 aa  57.8  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1367  23S rRNA methyltransferase A  33.33 
 
 
269 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000667026  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3056  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
223 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000799279  normal  0.774854 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.68 
 
 
223 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  37.04 
 
 
347 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  36.19 
 
 
202 aa  58.2  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>