More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0707 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  100 
 
 		 250 aa  518  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  79.6 
 
 		 242 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  79.44 
 
 		 244 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  76.21 
 
 		 242 aa  380  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  76.21 
 
 		 242 aa  380  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_003296  RS00761  hypothetical protein  72.11 
 
 		 246 aa  364  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286204  normal  0.107855 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  71.6 
 
 		 239 aa  360  9e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  71.6 
 
 		 239 aa  360  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  65.53 
 
 		 241 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  62.13 
 
 		 239 aa  296  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  61.28 
 
 		 244 aa  291  7e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  33.12 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  40.74 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  35.11 
 
 		 1106 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  29.56 
 
 		 204 aa  72  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  29.8 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2210  methyltransferase type 11  32.05 
 
 		 203 aa  71.2  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  34.44 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  35.04 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  29.53 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0147  Methyltransferase type 11  33.08 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  35.54 
 
 		 265 aa  68.6  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  34.92 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  29.38 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  29.38 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  40.54 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  30 
 
 		 204 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  30 
 
 		 204 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1559  Methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 233 aa  67  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0523794  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3903  methyltransferase type 11  28.48 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.808495 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3895  methyltransferase type 11  28.48 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  31.14 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1922  Methyltransferase type 11  34.13 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  29.01 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  34.58 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3264  methyltransferase type 11  33.11 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.776715 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  37.82 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.14 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  29.58 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  36.3 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.59 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.17 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.19 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72050  hypothetical protein  28.42 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.892313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09381  methyltransferase  33.04 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.398692  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2320  methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  37.38 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  33.59 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  27.75 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  32.68 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  31.67 
 
 		 1005 aa  62.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  34.81 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0879  SAM (and some other nucleotide) binding motif:Generic methyl-transferase  33.04 
 
 		 351 aa  62.4  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  33.64 
 
 		 292 aa  62.4  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  32.82 
 
 		 244 aa  62  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1127  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 		 246 aa  62  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2395  Methyltransferase type 11  34.15 
 
 		 208 aa  62  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000965249  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3171  methyltransferase type 11  29.94 
 
 		 204 aa  62  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2736  Methyltransferase type 11  37.59 
 
 		 225 aa  62  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2303  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 390 aa  62  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.342078  normal  0.305361 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.4 
 
 		 223 aa  62  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  33.64 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3846  putative methyltransferase ubiE/COQ5 family  31.68 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  29.89 
 
 		 1000 aa  61.6  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  38.68 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2376  Methyltransferase type 11  28.75 
 
 		 210 aa  62  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578401  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09391  methyltransferase  32.17 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1407  hypothetical protein  33.62 
 
 		 191 aa  61.6  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.709337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0889  methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0190942  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  36.19 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2269  methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.541668  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.11 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  31.67 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0549  Methyltransferase type 11  30.07 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43205  predicted protein  33.12 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000000000040449  normal  0.10617 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4310  hypothetical protein  40.78 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  31.33 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  34.71 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  36.7 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0552  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.26 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  26.07 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  34.07 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  33.6 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  32.76 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  28.86 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  34.4 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0725  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2319  methyltransferase type 11  35.34 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690206  normal  0.0712991 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  28.77 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1693  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.21 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.89 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1113  methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0629842  normal  0.748747 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  26.55 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5795  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>