More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2054 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2054  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  644    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.638121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3864  Methyltransferase type 11  54.81 
 
 		 305 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3130  hypothetical protein  56.59 
 
 		 305 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3913  Methyltransferase type 11  55.13 
 
 		 305 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.100491  normal  0.248183 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3788  type 11 methyltransferase  56.48 
 
 		 306 aa  358  5e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2596  Methyltransferase type 11  52.68 
 
 		 311 aa  346  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0705  Methyltransferase type 11  55.52 
 
 		 300 aa  346  4e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.716094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2956  methyltransferase type 11  53.35 
 
 		 304 aa  345  8e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626473  normal  0.0682436 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0872  hypothetical protein  41.48 
 
 		 316 aa  251  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0354264  normal  0.0675112 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4009  type 11 methyltransferase  39.35 
 
 		 319 aa  241  7.999999999999999e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3698  Methyltransferase type 11  40.97 
 
 		 323 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4431  Methyltransferase type 11  37.58 
 
 		 315 aa  232  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.184386 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4369  Methyltransferase type 11  37.58 
 
 		 315 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51145  predicted protein  37.94 
 
 		 363 aa  219  5e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  36.09 
 
 		 286 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_4846  predicted protein  37.16 
 
 		 218 aa  139  6e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.291862  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3419  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.09 
 
 		 299 aa  139  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  36.52 
 
 		 283 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  33.77 
 
 		 263 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0353  methyltransferase type 12  29.13 
 
 		 300 aa  98.2  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0874936 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4441  methyltransferase type 11  29.44 
 
 		 294 aa  92.8  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2414  hypothetical protein  29.48 
 
 		 351 aa  86.7  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.177274  normal  0.0190439 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46747  predicted protein  30.52 
 
 		 335 aa  84.3  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07721  methyltransferase  30.04 
 
 		 353 aa  84  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0608577 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0368  Methyltransferase type 11  27.95 
 
 		 365 aa  84.3  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0140  methyltransferase  29.6 
 
 		 353 aa  83.2  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2995  Methyltransferase type 11  29.48 
 
 		 363 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1204  generic methyl-transferase  29.15 
 
 		 363 aa  80.5  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16301  methyltransferase  30.18 
 
 		 357 aa  80.5  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.346442 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2730  methyltransferase type 12  36.16 
 
 		 422 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184055  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2158  methyltransferase type 11  31.76 
 
 		 363 aa  79.3  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10291  methyltransferase  27.23 
 
 		 352 aa  79.3  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.55915 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09381  methyltransferase  27.82 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.398692  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3833  methyltransferase type 11  28.17 
 
 		 363 aa  75.9  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2205  Methyltransferase type 11  27.61 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000273998 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0879  SAM (and some other nucleotide) binding motif:Generic methyl-transferase  26.4 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09391  methyltransferase  27.02 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0149  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.57 
 
 		 351 aa  73.9  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  26.52 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1266  generic methyl-transferase  26.84 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10041  methyltransferase  27.56 
 
 		 351 aa  72.8  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 226 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_4986  predicted protein  25.76 
 
 		 239 aa  67  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.778509 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  37.5 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0198  methyltransferase type 11  32.71 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0695927  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2539  Methyltransferase type 11  29.6 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.459192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0152  methyltransferase type 11  23.27 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.19 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1828  Methyltransferase type 11  29.27 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225649  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2411  methyltransferase type 11  28.97 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 355 aa  59.7  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  29.8 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  29.8 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1645  methyltransferase  32.35 
 
 		 209 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0758  Methyltransferase type 11  29.09 
 
 		 189 aa  58.9  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00287175  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3724  methyltransferase type 11  30.93 
 
 		 240 aa  58.9  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2206  methyltransferase type 12  37.76 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  35.85 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.82 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  28.05 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0373  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  28.93 
 
 		 258 aa  57  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  38.38 
 
 		 399 aa  57  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  32.47 
 
 		 284 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  29.6 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  30.63 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  38.46 
 
 		 399 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  29.6 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.69 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2559  methyltransferase type 11  26.76 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07641  methyltransferase  30.06 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.63 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  30.51 
 
 		 202 aa  55.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.33 
 
 		 244 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  31.19 
 
 		 295 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  32.43 
 
 		 286 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.27 
 
 		 234 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.88 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2248  demethylmenaquinone methyltransferase  27.91 
 
 		 250 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  27.13 
 
 		 239 aa  55.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  40 
 
 		 395 aa  54.7  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1785  methyltransferase type 11  29.13 
 
 		 275 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0456688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  35.83 
 
 		 400 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  28 
 
 		 213 aa  54.3  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 273 aa  53.9  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  30 
 
 		 269 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  28.27 
 
 		 256 aa  53.9  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2837  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.3 
 
 		 247 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1804  methyltransferase type 11  28.8 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.84 
 
 		 237 aa  53.9  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1851  methyltransferase type 11  28.8 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.249225 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1742  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.09 
 
 		 239 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 268 aa  53.5  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  32.17 
 
 		 225 aa  53.5  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.65 
 
 		 207 aa  53.1  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>