More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6862 on replicon NC_013732
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  100 
 
 
227 aa  468  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  76.61 
 
 
219 aa  352  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2683  methyltransferase type 11  41.43 
 
 
220 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2428  methyltransferase type 12  34.25 
 
 
225 aa  111  8.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2710  methyltransferase type 11  34.42 
 
 
219 aa  111  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0189478  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2559  methyltransferase type 11  33.49 
 
 
228 aa  107  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.57 
 
 
237 aa  89  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.2 
 
 
215 aa  87  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  39.25 
 
 
286 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  32.07 
 
 
283 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0373  Methyltransferase type 11  43.61 
 
 
222 aa  85.1  7e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1591  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25.24 
 
 
221 aa  84  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  33.72 
 
 
228 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1339  methyltransferase type 11  25.34 
 
 
220 aa  82.8  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1475  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  24.89 
 
 
221 aa  81.6  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576982  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0198  methyltransferase type 11  36.24 
 
 
217 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0695927  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.82 
 
 
233 aa  78.6  0.00000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3419  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.58 
 
 
299 aa  78.6  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  38.74 
 
 
239 aa  77  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2653  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.22 
 
 
232 aa  76.6  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1652  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.32 
 
 
254 aa  75.9  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.583368 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  40.35 
 
 
312 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  43.75 
 
 
194 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.68 
 
 
207 aa  74.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1167  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.5 
 
 
259 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000217887  hitchhiker  0.00731668 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2158  methyltransferase type 11  37.9 
 
 
363 aa  73.9  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.18 
 
 
237 aa  73.9  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  36.75 
 
 
348 aa  72.4  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  38.53 
 
 
269 aa  72.4  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  35.25 
 
 
213 aa  72  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  36.75 
 
 
275 aa  72  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  33.17 
 
 
226 aa  72  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  37.7 
 
 
242 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  35.59 
 
 
244 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  37.7 
 
 
242 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  30.54 
 
 
239 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  34.1 
 
 
212 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  38.24 
 
 
240 aa  69.7  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.6 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  33.54 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2020  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.68 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0469  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.97 
 
 
234 aa  68.9  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  30.82 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0705  Methyltransferase type 11  33.02 
 
 
300 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.716094  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  40.4 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4096  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.1 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  29.08 
 
 
239 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0183  methyltransferase type 11  28.97 
 
 
223 aa  67  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0293588  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2054  hypothetical protein  32.08 
 
 
313 aa  66.6  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.638121  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.81 
 
 
223 aa  66.6  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.19 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  33.82 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4209  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  25.88 
 
 
266 aa  65.9  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7094  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.54 
 
 
244 aa  66.2  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000661752  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.29 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  33.82 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  29.1 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0867  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE, putative  32.09 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  33.9 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2539  Methyltransferase type 11  35.24 
 
 
237 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.459192  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0744  Methyltransferase type 11  29.57 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0330334  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3373  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.1 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3996  putative methyltransferase  39.64 
 
 
289 aa  65.9  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3913  Methyltransferase type 11  27.91 
 
 
305 aa  65.5  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.100491  normal  0.248183 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3202  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  35.29 
 
 
251 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  34.38 
 
 
307 aa  65.5  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3864  Methyltransferase type 11  27.91 
 
 
305 aa  65.5  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16301  methyltransferase  33.33 
 
 
357 aa  65.9  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.346442 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3788  type 11 methyltransferase  31.19 
 
 
306 aa  65.5  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.52 
 
 
234 aa  65.1  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360433  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2596  Methyltransferase type 11  30.25 
 
 
311 aa  65.1  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0160  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.79 
 
 
293 aa  65.1  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  35.07 
 
 
710 aa  65.1  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.28 
 
 
251 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  36.13 
 
 
285 aa  64.3  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  35.06 
 
 
187 aa  64.7  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  37.27 
 
 
276 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  30.11 
 
 
207 aa  64.7  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03675  hypothetical protein  32.28 
 
 
251 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  31.87 
 
 
317 aa  64.3  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.65 
 
 
244 aa  64.7  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4146  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.28 
 
 
251 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0506  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 
251 aa  63.9  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4199  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  28.57 
 
 
251 aa  63.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0419  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 
251 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5274  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.28 
 
 
251 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.123369  normal  0.211011 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2096  type 11 methyltransferase  28.57 
 
 
207 aa  64.3  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4175  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.28 
 
 
251 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0431  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 
251 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159062  hitchhiker  0.0000667 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4216  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.28 
 
 
251 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227535 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  36.36 
 
 
271 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4057  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.28 
 
 
251 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3895  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 
251 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.4649  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  39.66 
 
 
270 aa  63.5  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4354  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.28 
 
 
251 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.556022  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4305  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.28 
 
 
251 aa  63.9  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3790  methyltransferase type 11  39.18 
 
 
196 aa  63.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0445  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 
251 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187756  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2710  demethylmenaquinone methyltransferase  26.42 
 
 
243 aa  63.2  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>