More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0166 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  100 
 
 
257 aa  536  1e-151  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  50.59 
 
 
255 aa  265  5.999999999999999e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  46.64 
 
 
250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  42.69 
 
 
253 aa  226  3e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1279  UbiE/COQ5 methyltransferase  47.04 
 
 
253 aa  224  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  40.4 
 
 
262 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  42.74 
 
 
253 aa  204  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.87 
 
 
259 aa  161  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0198  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.47 
 
 
252 aa  150  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.537911  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 
226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  37.44 
 
 
210 aa  144  2e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  41.94 
 
 
226 aa  143  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.07 
 
 
250 aa  141  9e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  35.68 
 
 
248 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  40.38 
 
 
226 aa  138  7.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4078  methyltransferase type 11  31.62 
 
 
259 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1358  methyltransferase type 11  28.96 
 
 
271 aa  125  8.000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  31.31 
 
 
244 aa  121  9e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.95 
 
 
230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0791082 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4417  methyltransferase type 11  28.68 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.587336 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  32.76 
 
 
225 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0720  hypothetical protein  31.05 
 
 
234 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1222  methyltransferase  29.92 
 
 
272 aa  113  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2248  Methyltransferase type 11  31.7 
 
 
261 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.586689  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2026  Methyltransferase type 11  30.45 
 
 
261 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508606  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39.29 
 
 
155 aa  109  5e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2984  methyltransferase type 11  30.92 
 
 
227 aa  102  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452511  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0543  Methyltransferase type 11  31.33 
 
 
247 aa  99.4  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  30.52 
 
 
258 aa  97.8  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0342  Methyltransferase type 11  29.67 
 
 
252 aa  97.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0468  hypothetical protein  33.56 
 
 
249 aa  97.4  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0352  Methyltransferase type 11  33.77 
 
 
249 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0334  Methyltransferase type 11  42.72 
 
 
257 aa  89  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000194414  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.33 
 
 
250 aa  88.2  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2762  Methyltransferase type 11  30.67 
 
 
265 aa  88.2  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0474  hypothetical protein  25.81 
 
 
252 aa  87  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04480  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.05 
 
 
263 aa  87  3e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.110079  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  27.35 
 
 
233 aa  78.6  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  37.19 
 
 
275 aa  76.6  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1190  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.14 
 
 
272 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  41.84 
 
 
225 aa  74.7  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  34.55 
 
 
213 aa  75.1  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.58 
 
 
244 aa  75.1  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  33.04 
 
 
256 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.04 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0018  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  26.82 
 
 
204 aa  74.3  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000241496  hitchhiker  0.00000138707 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.52 
 
 
258 aa  73.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.04 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  28.48 
 
 
212 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  33.04 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0957  methyltransferase type 11  31.85 
 
 
290 aa  73.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0310  Methyltransferase type 11  31.01 
 
 
259 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  22.9 
 
 
243 aa  73.2  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  28.7 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1747  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.24 
 
 
244 aa  73.2  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  38.89 
 
 
280 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2432  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.17 
 
 
260 aa  73.2  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  34.58 
 
 
258 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3328  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  32.64 
 
 
210 aa  72  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8055  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.87 
 
 
231 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.05 
 
 
243 aa  71.6  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  29.82 
 
 
240 aa  71.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0345  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  29.6 
 
 
228 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0492  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.88 
 
 
232 aa  71.6  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.04 
 
 
256 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.42 
 
 
234 aa  72  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  25.56 
 
 
238 aa  71.2  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  33.15 
 
 
281 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1589  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 
209 aa  70.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00562  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.28 
 
 
259 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  37.76 
 
 
265 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  32.31 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  33.07 
 
 
342 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  40.19 
 
 
276 aa  70.5  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  33.07 
 
 
354 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  33.07 
 
 
349 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2718  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.54 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1439  methyltransferase  36.54 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00779237  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  33.33 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2685  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  29.01 
 
 
229 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.6 
 
 
251 aa  70.1  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.205211 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44851  predicted protein  36.61 
 
 
249 aa  69.7  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2723  Methyltransferase type 11  26.58 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4421  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.46 
 
 
236 aa  69.7  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.32 
 
 
237 aa  69.3  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.05 
 
 
233 aa  69.3  0.00000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001927  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE/COQ5  29.13 
 
 
259 aa  68.9  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4809  Methyltransferase type 11  29.01 
 
 
229 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  30.82 
 
 
227 aa  68.9  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0977  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.33 
 
 
243 aa  68.9  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.270473 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0542  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  31.79 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  26.16 
 
 
270 aa  68.6  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4209  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  31.67 
 
 
266 aa  68.6  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2987  Methyltransferase type 11  31.61 
 
 
290 aa  68.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4211  methyltransferase type 11  28.26 
 
 
250 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  31.17 
 
 
324 aa  68.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  29.93 
 
 
258 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2195  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  37 
 
 
213 aa  68.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4277  methyltransferase type 11  28.26 
 
 
252 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>