More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_04350 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  100 
 
 		 155 aa  316  7e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  41.5 
 
 		 255 aa  123  7e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.71 
 
 		 253 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.31 
 
 		 250 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1279  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.31 
 
 		 253 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  39.29 
 
 		 257 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  37.75 
 
 		 262 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.86 
 
 		 250 aa  107  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1222  methyltransferase  38.41 
 
 		 272 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0198  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.86 
 
 		 252 aa  102  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.537911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.67 
 
 		 259 aa  100  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 226 aa  101  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  40.85 
 
 		 210 aa  100  6e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0720  hypothetical protein  38.1 
 
 		 234 aa  98.2  4e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  36.13 
 
 		 226 aa  97.4  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4417  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 269 aa  95.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.587336 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2026  Methyltransferase type 11  34.69 
 
 		 261 aa  94.7  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0468  hypothetical protein  37.5 
 
 		 249 aa  93.2  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2248  Methyltransferase type 11  34.01 
 
 		 261 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.586689  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2762  Methyltransferase type 11  36.62 
 
 		 265 aa  92  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  38.02 
 
 		 248 aa  91.3  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 226 aa  90.9  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.53 
 
 		 253 aa  90.5  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  36.99 
 
 		 258 aa  90.9  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  33.33 
 
 		 244 aa  90.5  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.65 
 
 		 230 aa  88.2  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0791082 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.12 
 
 		 250 aa  87.4  6e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4078  methyltransferase type 11  36.3 
 
 		 259 aa  87.8  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0352  Methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 249 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  37.58 
 
 		 225 aa  85.5  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0334  Methyltransferase type 11  39.83 
 
 		 257 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000194414  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  39.31 
 
 		 212 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.69 
 
 		 230 aa  77.8  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2984  methyltransferase type 11  39.84 
 
 		 227 aa  77.8  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452511  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1358  methyltransferase type 11  34.69 
 
 		 271 aa  77.4  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0474  hypothetical protein  34.97 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0543  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04480  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.77 
 
 		 263 aa  73.6  0.0000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.110079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  35.46 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  28.79 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  39.6 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  45.92 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0976  Methyltransferase type 11  34.25 
 
 		 220 aa  72  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1554  hypothetical protein  31.15 
 
 		 315 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000923024  normal  0.0128521 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0310  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 259 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0342  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 		 252 aa  71.2  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 327 aa  70.5  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3007  methyltransferase type 11  40.62 
 
 		 429 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 339 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1911  methyltransferase type 11  43.75 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.257162  hitchhiker  0.000127679 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  42.42 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  37.23 
 
 		 265 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3356  ubiquinone/menaquinone methyltransferase  31.75 
 
 		 318 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000127941  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  33.01 
 
 		 235 aa  68.2  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  40 
 
 		 252 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2195  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  33.12 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3682  hypothetical protein  30.95 
 
 		 315 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000635868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3687  hypothetical protein  30.89 
 
 		 315 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 280 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3762  hypothetical protein  28.86 
 
 		 315 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000334692  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10090  methyltransferase  40 
 
 		 197 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.542368  normal  0.16327 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2653  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.08 
 
 		 232 aa  67  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1339  methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 220 aa  67  0.00000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5212  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  42.45 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0540942  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2248  demethylmenaquinone methyltransferase  32.91 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  31.11 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.65 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.13 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  40.4 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1444  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  37.04 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0474733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  35.11 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1535  methyltransferase type 11  41.67 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0615869  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.13 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.84 
 
 		 283 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3206  Methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.457665  normal  0.153588 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.87 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  31.17 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  42.16 
 
 		 283 aa  65.1  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 337 aa  64.7  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  36.63 
 
 		 256 aa  65.1  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.4 
 
 		 235 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  34.9 
 
 		 341 aa  65.1  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5711  Methyltransferase type 11  31.88 
 
 		 265 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4023  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.65 
 
 		 240 aa  64.7  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0730  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.09 
 
 		 207 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34 
 
 		 237 aa  64.3  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  43.81 
 
 		 244 aa  64.3  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 328 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3341  methyltransferase type 11  32.04 
 
 		 315 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000506511  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1591  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.33 
 
 		 221 aa  64.3  0.0000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  34.15 
 
 		 213 aa  64.3  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.05 
 
 		 200 aa  64.3  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0754126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1620  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  36.79 
 
 		 218 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  36.6 
 
 		 257 aa  64.3  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  38 
 
 		 241 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  33.56 
 
 		 341 aa  64.3  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  46.79 
 
 		 281 aa  64.3  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  38 
 
 		 241 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  39.6 
 
 		 287 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>