More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0474 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0474  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  521  1e-147  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0543  Methyltransferase type 11  33.19 
 
 
247 aa  129  6e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0468  hypothetical protein  35.45 
 
 
249 aa  124  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0352  Methyltransferase type 11  31.2 
 
 
249 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.3 
 
 
250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  29.87 
 
 
258 aa  107  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0334  Methyltransferase type 11  31.44 
 
 
257 aa  106  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000194414  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.71 
 
 
250 aa  105  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.24 
 
 
253 aa  102  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  33.18 
 
 
248 aa  101  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04480  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.21 
 
 
263 aa  99.4  5e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.110079  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.37 
 
 
253 aa  98.6  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0342  Methyltransferase type 11  30 
 
 
252 aa  96.3  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.01 
 
 
255 aa  96.3  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2762  Methyltransferase type 11  27.76 
 
 
265 aa  95.1  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1279  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.05 
 
 
253 aa  94.7  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  26.58 
 
 
226 aa  94.7  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  33.99 
 
 
210 aa  93.6  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4078  methyltransferase type 11  31.55 
 
 
259 aa  92.8  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.18 
 
 
259 aa  90.5  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  27.23 
 
 
262 aa  88.6  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  25.81 
 
 
257 aa  87  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1222  methyltransferase  29.61 
 
 
272 aa  84  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2248  Methyltransferase type 11  30.97 
 
 
261 aa  83.2  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.586689  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1358  methyltransferase type 11  28.76 
 
 
271 aa  83.2  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  25.39 
 
 
226 aa  82.4  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2026  Methyltransferase type 11  29.07 
 
 
261 aa  82  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508606  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  29.11 
 
 
226 aa  80.5  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2984  methyltransferase type 11  26.32 
 
 
227 aa  79  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452511  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.97 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4417  methyltransferase type 11  32.24 
 
 
269 aa  76.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.587336 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0720  hypothetical protein  30.07 
 
 
234 aa  73.2  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.98 
 
 
230 aa  73.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0791082 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.07 
 
 
250 aa  71.6  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  28.84 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  24.07 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0198  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.08 
 
 
252 aa  67.8  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.537911  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1157  methyltransferase type 11  29.19 
 
 
187 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120807  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3814  Methyltransferase type 11  27.21 
 
 
230 aa  59.3  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212556  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0252  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.1 
 
 
232 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  35.87 
 
 
284 aa  56.6  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0228  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.41 
 
 
232 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2692  Methyltransferase type 11  32.63 
 
 
190 aa  55.5  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.46 
 
 
243 aa  55.5  0.0000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.46 
 
 
234 aa  55.1  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3550  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
248 aa  54.7  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  36.63 
 
 
190 aa  54.7  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  32.65 
 
 
209 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2012  methyltransferase type 12  25.64 
 
 
292 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0990636  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  34.4 
 
 
255 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0730  hypothetical protein  35.35 
 
 
273 aa  53.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2906  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.03 
 
 
247 aa  53.5  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3086  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.16 
 
 
247 aa  53.1  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.516357 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0334  hypothetical protein  32.59 
 
 
258 aa  52.8  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04067  SAM-dependent methyltransferase  28.07 
 
 
390 aa  52.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.882987  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.5 
 
 
209 aa  52.4  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3316  methyltransferase type 11  29.84 
 
 
257 aa  52.8  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00129805  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1722  putative metallothionein SmtA  29.06 
 
 
261 aa  52.4  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2584  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.33 
 
 
232 aa  52.4  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  29.61 
 
 
210 aa  52.4  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2856  methyltransferase type 12  26.42 
 
 
269 aa  52  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23211 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2589  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.45 
 
 
262 aa  52  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.52 
 
 
239 aa  51.6  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.09 
 
 
296 aa  51.2  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0947  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29 
 
 
252 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  31.36 
 
 
215 aa  51.6  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3569  Methyltransferase type 11  23.38 
 
 
259 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131533  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0170  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
269 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000954595  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2971  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  42.67 
 
 
444 aa  51.2  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.422086  hitchhiker  0.0000745246 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2260  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.3 
 
 
254 aa  52  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0516247  normal  0.429891 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  29.73 
 
 
341 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
268 aa  51.6  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  33.02 
 
 
246 aa  50.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.29 
 
 
244 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0677  Methyltransferase type 11  35 
 
 
233 aa  50.8  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  25.99 
 
 
340 aa  50.8  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6748  Methyltransferase type 11  27.13 
 
 
267 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
268 aa  50.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4471  methyltransferase type 11  41.18 
 
 
214 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00423193 
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  29.93 
 
 
341 aa  50.4  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  29.93 
 
 
341 aa  50.4  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2208  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.89 
 
 
233 aa  50.1  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.44599  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0358  hypothetical protein  28.67 
 
 
258 aa  50.1  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0440  methyltransferase type 12  28.46 
 
 
284 aa  50.1  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000034912  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4222  methyltransferase type 11  30.72 
 
 
212 aa  50.4  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2776  methyltransferase type 11  30.4 
 
 
279 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.917399  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4457  hypothetical protein  31.37 
 
 
212 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.643189  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4271  hypothetical protein  31.37 
 
 
212 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.208511  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0641  smtA protein  27.82 
 
 
249 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4455  hypothetical protein  31.37 
 
 
212 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.821165 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1467  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30 
 
 
243 aa  49.7  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4508  hypothetical protein  31.37 
 
 
212 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000692373  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4603  hypothetical protein  31.37 
 
 
212 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.964338  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0298  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30 
 
 
254 aa  50.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4494  hypothetical protein  31.37 
 
 
212 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.605831  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1262  type 11 methyltransferase  35.51 
 
 
273 aa  49.3  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.653357  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0742  hypothetical protein  31.37 
 
 
212 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1181  methyltransferase type 12  23.32 
 
 
268 aa  49.3  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0623  methyltransferase type 12  26.47 
 
 
249 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766953 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  26.04 
 
 
237 aa  49.3  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>