More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_04480 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_04480  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  100 
 
 		 263 aa  547  1e-155  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.110079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2762  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 265 aa  199  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  41.25 
 
 		 258 aa  182  7e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0352  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0342  Methyltransferase type 11  34.75 
 
 		 252 aa  150  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0468  hypothetical protein  32.55 
 
 		 249 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0543  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 247 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0334  Methyltransferase type 11  32.57 
 
 		 257 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000194414  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.59 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30 
 
 		 250 aa  108  7.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  35.22 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.58 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  37.66 
 
 		 226 aa  99.8  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  38.22 
 
 		 225 aa  99.8  4e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0474  hypothetical protein  28.21 
 
 		 252 aa  99.4  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  35.67 
 
 		 248 aa  99.4  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.15 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0791082 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.77 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1279  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.13 
 
 		 253 aa  95.9  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.89 
 
 		 250 aa  94.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2248  Methyltransferase type 11  28.03 
 
 		 261 aa  92.8  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.586689  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  36.54 
 
 		 226 aa  92.4  7e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0720  hypothetical protein  31.68 
 
 		 234 aa  92  9e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.53 
 
 		 253 aa  91.7  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4078  methyltransferase type 11  36.94 
 
 		 259 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2026  Methyltransferase type 11  26.78 
 
 		 261 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  31.1 
 
 		 244 aa  86.7  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  32.05 
 
 		 257 aa  87  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.55 
 
 		 259 aa  86.3  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  32.03 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1222  methyltransferase  32.73 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  29.01 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4417  methyltransferase type 11  32.4 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.587336 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  41.51 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0198  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.35 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.537911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  44.86 
 
 		 276 aa  74.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.77 
 
 		 155 aa  73.6  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1358  methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  38.52 
 
 		 349 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  38.52 
 
 		 354 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  36.23 
 
 		 342 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  40.95 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  41.44 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  37.29 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  39.64 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  39.64 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  38.52 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3440  Methyltransferase type 11  43.4 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2984  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452511  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 327 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  35.17 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  39.64 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  39.53 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  41.9 
 
 		 335 aa  67.4  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.02 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  39.64 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  30.23 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  39.53 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  35.19 
 
 		 263 aa  67  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.19 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  31.47 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1008  methyltransferase type 11  42.45 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1596  Methyltransferase type 11  35.48 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.76 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  41.28 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  32.64 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0519  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.4 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.76 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.76 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.76 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  29.68 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  39.5 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  38.58 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1594  methyltransferase type 11  34.27 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  40 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  36.19 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  39.81 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.14 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.76 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  33.12 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.14 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  40.95 
 
 		 256 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  30.87 
 
 		 238 aa  65.1  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  40 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  37.8 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  40.78 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.72 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  38.24 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  35.33 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  38.68 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  37.8 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  37.8 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  40.5 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  37.38 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  26.8 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.59 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>