More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5778 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 276 aa  564  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  53.38 
 
 		 284 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  53.38 
 
 		 286 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0668  Methyltransferase type 11  48.16 
 
 		 288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4893  methyltransferase type 11  49.81 
 
 		 274 aa  250  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4452  methyltransferase type 11  49.06 
 
 		 277 aa  248  7e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3306  UbiE/COQ5 family methlytransferase  41.48 
 
 		 273 aa  225  6e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10074  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0172  methyltransferase type 11  47.74 
 
 		 275 aa  211  7.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3215  methyltransferase type 11  41.26 
 
 		 278 aa  206  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000307808 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2958  hypothetical protein  39.26 
 
 		 278 aa  204  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0809  Methyltransferase type 11  36.04 
 
 		 264 aa  103  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266836  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6747  Methyltransferase type 11  33.53 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2451  Methyltransferase type 11  42.52 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  40.71 
 
 		 342 aa  97.1  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  38.89 
 
 		 559 aa  96.3  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  42.42 
 
 		 271 aa  94.7  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 271 aa  94  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  30.81 
 
 		 275 aa  93.6  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  38.93 
 
 		 284 aa  92  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  37.43 
 
 		 271 aa  90.9  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.42 
 
 		 283 aa  89.7  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.98 
 
 		 305 aa  87.8  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2857  methyltransferase type 11  30.94 
 
 		 279 aa  87.8  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295819 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20470  tocopherol o-methyltransferase  39.13 
 
 		 318 aa  87.8  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  34.53 
 
 		 286 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  38.16 
 
 		 311 aa  87  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  32.89 
 
 		 261 aa  87  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2966  Methyltransferase type 11  30.11 
 
 		 572 aa  86.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  37.23 
 
 		 279 aa  86.3  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  41.18 
 
 		 392 aa  85.9  7e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  32.43 
 
 		 280 aa  85.5  8e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  40.68 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2447  methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4388  methyltransferase type 11  31.79 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0989044  normal  0.24508 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  42.02 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.43 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  40.52 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  40.71 
 
 		 382 aa  83.2  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  40.87 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  34.4 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  34.6 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  34.4 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  30.94 
 
 		 776 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  38.98 
 
 		 311 aa  82.4  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  36.52 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  40.68 
 
 		 310 aa  82  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  39.83 
 
 		 310 aa  82  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  35.34 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04686  methyltransferase protein  34.01 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  35.65 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  38.26 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  38.26 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19461  SAM-binding motif-containing protein  39.83 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3261  SAM-dependent methyltransferase  33.14 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  32.8 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.12 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  32.29 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  29.11 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1677  methyltransferase type 11  29.81 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  33.6 
 
 		 283 aa  79  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  39.83 
 
 		 304 aa  79  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0604  methyltransferase type 11  32.64 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  39.81 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4175  methyltransferase type 11  40.65 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16851  SAM-binding motif-containing protein  38.14 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  39.45 
 
 		 328 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0744  Methyltransferase type 11  33.13 
 
 		 248 aa  78.2  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0330334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17021  putative sarcosine-dimethylglycine methyltransferase  28.57 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.650309 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.18 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  31.84 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32.28 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80971  predicted protein  33.33 
 
 		 377 aa  75.9  0.0000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 267 aa  75.5  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  36.59 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32.81 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16281  SAM-binding motif-containing protein  36.44 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04480  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  44.86 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.110079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1785  methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0456688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0521  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 1012 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2025  sterol-C-methyltransferase  39.83 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2791  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.33 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  33.88 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4050  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.17 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  40.35 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23681  SAM-binding motif-containing protein  38.18 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0592385 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  40.78 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  43.69 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  32.72 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10824  predicted protein  32.56 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0540311  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0676  Methyltransferase type 11  28.15 
 
 		 280 aa  72  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  39.81 
 
 		 225 aa  72  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1683  Methyltransferase type 11  41.96 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.430407  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  32.03 
 
 		 168 aa  70.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.91 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1607  Methyltransferase type 11  41.96 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  31.64 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>