More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3249 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  100 
 
 
382 aa  772    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  36.49 
 
 
286 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  36.24 
 
 
280 aa  196  6e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  36.33 
 
 
284 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  34.14 
 
 
283 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  34.14 
 
 
283 aa  186  8e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20470  tocopherol o-methyltransferase  33.33 
 
 
318 aa  182  8.000000000000001e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  34.25 
 
 
280 aa  177  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  32.66 
 
 
293 aa  175  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  33.79 
 
 
342 aa  170  4e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  34.87 
 
 
328 aa  154  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  35.66 
 
 
311 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19461  SAM-binding motif-containing protein  33.22 
 
 
310 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  33.22 
 
 
310 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  35.71 
 
 
311 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  32.57 
 
 
392 aa  149  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.92 
 
 
330 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  36.56 
 
 
304 aa  147  4.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23681  SAM-binding motif-containing protein  35.17 
 
 
304 aa  146  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0592385 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  31.62 
 
 
306 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16851  SAM-binding motif-containing protein  33.57 
 
 
311 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  37.39 
 
 
310 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  39.6 
 
 
282 aa  144  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  34.04 
 
 
328 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  35.53 
 
 
274 aa  142  9e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2025  sterol-C-methyltransferase  33.11 
 
 
310 aa  139  1e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  34.13 
 
 
310 aa  138  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16281  SAM-binding motif-containing protein  32.77 
 
 
309 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  35.59 
 
 
278 aa  137  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.58 
 
 
305 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  35.59 
 
 
275 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  43.6 
 
 
261 aa  124  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10269  predicted protein  31.13 
 
 
295 aa  119  7e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  40.94 
 
 
271 aa  119  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  38.46 
 
 
279 aa  114  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3261  SAM-dependent methyltransferase  33.93 
 
 
287 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234445  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1026  methyltransferase type 11  33.45 
 
 
277 aa  110  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0604  methyltransferase type 11  35.41 
 
 
276 aa  109  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  31 
 
 
287 aa  109  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2447  methyltransferase type 11  34.97 
 
 
277 aa  106  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  33.91 
 
 
377 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.91 
 
 
282 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  33.91 
 
 
295 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03100  sterol 24-C-methyltransferase, putative  36.09 
 
 
343 aa  102  8e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0399554  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42420  predicted protein  28.95 
 
 
317 aa  101  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.679564 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30710  predicted protein  27.39 
 
 
365 aa  99  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0521  Methyltransferase type 11  34.92 
 
 
1012 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200159  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4893  methyltransferase type 11  37.65 
 
 
274 aa  97.4  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0809  Methyltransferase type 11  33.18 
 
 
264 aa  97.4  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266836  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6747  Methyltransferase type 11  32.6 
 
 
286 aa  96.7  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10824  predicted protein  29.46 
 
 
304 aa  96.3  8e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0540311  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80971  predicted protein  28.73 
 
 
377 aa  94.4  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4388  methyltransferase type 11  30.74 
 
 
267 aa  93.6  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0989044  normal  0.24508 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  39.6 
 
 
295 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4452  methyltransferase type 11  42.15 
 
 
277 aa  90.5  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2966  Methyltransferase type 11  30.05 
 
 
572 aa  90.1  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_003296  RS04686  methyltransferase protein  41.03 
 
 
274 aa  88.2  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2147  methyltransferase type 11  28.65 
 
 
283 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  42.72 
 
 
284 aa  86.7  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  43.69 
 
 
286 aa  86.7  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  34.13 
 
 
559 aa  86.3  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0676  Methyltransferase type 11  25 
 
 
280 aa  86.3  9e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2451  Methyltransferase type 11  30.73 
 
 
267 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1180  methyltransferase type 11  33.52 
 
 
279 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1353  Methyltransferase type 11  31.19 
 
 
280 aa  84.3  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0337053  hitchhiker  0.000000492717 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2857  methyltransferase type 11  28.83 
 
 
279 aa  84  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.295819 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  40.71 
 
 
276 aa  83.2  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2619  Methyltransferase type 11  31.35 
 
 
286 aa  83.2  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0188551  normal  0.0120808 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0668  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 
288 aa  81.6  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2375  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.98 
 
 
494 aa  80.1  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.241919 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0172  methyltransferase type 11  43.59 
 
 
275 aa  80.5  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2157  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.98 
 
 
434 aa  79.7  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.016063  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4613  Methyltransferase type 11  30.67 
 
 
282 aa  79.7  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000005749 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  44.63 
 
 
276 aa  78.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0786  Methyltransferase type 12  33.72 
 
 
539 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1677  methyltransferase type 11  28.88 
 
 
278 aa  76.6  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.98 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2411  methyltransferase type 11  32.63 
 
 
263 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  37.74 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0451  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.43 
 
 
426 aa  74.7  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.291736  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0457  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.43 
 
 
426 aa  74.7  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.566128  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2592  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.99 
 
 
424 aa  75.1  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0180  Methyltransferase type 11  29.55 
 
 
282 aa  75.1  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  33.86 
 
 
285 aa  73.9  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2958  hypothetical protein  33.65 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2136  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.26 
 
 
457 aa  73.6  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000408941 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  35.81 
 
 
254 aa  73.2  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0565  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.56 
 
 
426 aa  73.6  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.567073  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  35.81 
 
 
254 aa  73.2  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  47.12 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.48 
 
 
283 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17021  putative sarcosine-dimethylglycine methyltransferase  28.3 
 
 
282 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.650309 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3306  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.09 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10074  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0837  Methyltransferase type 12  33.75 
 
 
532 aa  72  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_2019  predicted protein  29.65 
 
 
877 aa  72  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0204163 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  33.91 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1238  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.24 
 
 
683 aa  72  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.306171  normal  0.747537 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  36.18 
 
 
225 aa  72  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2870  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.76 
 
 
482 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.24578  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  41.58 
 
 
265 aa  70.5  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>