More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0786 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0786  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 539 aa  1120    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0837  Methyltransferase type 12  89.1 
 
 		 532 aa  989    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0451  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  43.82 
 
 		 557 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.591016  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2382  hypothetical protein  38.46 
 
 		 439 aa  291  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2385  hypothetical protein  47.96 
 
 		 115 aa  116  8.999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  33.72 
 
 		 382 aa  76.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1115  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  35.07 
 
 		 372 aa  65.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.9654 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  32.53 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  28.17 
 
 		 274 aa  62.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  31.58 
 
 		 310 aa  62  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  39.39 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1880  methionine biosynthesis protein MetW  32.67 
 
 		 242 aa  61.6  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0239131 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23681  SAM-binding motif-containing protein  33.58 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0592385 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0436  methionine biosynthesis protein MetW  33.98 
 
 		 217 aa  59.7  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 		 261 aa  60.1  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  34.23 
 
 		 311 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  38.68 
 
 		 275 aa  59.3  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2291  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.39 
 
 		 416 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.38812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1363  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  30.6 
 
 		 374 aa  59.3  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000012191  normal  0.473534 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4888  methionine biosynthesis MetW  31.52 
 
 		 202 aa  58.5  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2359  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1077  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.45 
 
 		 447 aa  57  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5273  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.94 
 
 		 418 aa  57  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3871  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.8 
 
 		 428 aa  57  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  30.71 
 
 		 310 aa  57  0.0000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5144  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.94 
 
 		 394 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.278517  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5365  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.94 
 
 		 428 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.552994  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1133  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  25.75 
 
 		 375 aa  56.6  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1535  methionine biosynthesis protein MetW  30.69 
 
 		 229 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0530604 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1759  methionine biosynthesis protein MetW  30.69 
 
 		 229 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2095  methionine biosynthesis protein MetW  30.69 
 
 		 229 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273549  normal  0.170685 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5415  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.08 
 
 		 394 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424397 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2025  sterol-C-methyltransferase  35.34 
 
 		 310 aa  56.2  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1831  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  31.16 
 
 		 370 aa  56.2  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1341  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  36.67 
 
 		 394 aa  55.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0005734 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2447  methyltransferase type 11  26.49 
 
 		 277 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  26.88 
 
 		 342 aa  55.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0798  cyclopropane fatty acid synthase-like protein  26.97 
 
 		 374 aa  56.2  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000275065  hitchhiker  2.13005e-17 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0580  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.46 
 
 		 426 aa  55.1  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1137  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  25.3 
 
 		 375 aa  55.5  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20470  tocopherol o-methyltransferase  28.03 
 
 		 318 aa  55.1  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0967  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.03 
 
 		 446 aa  55.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  normal  0.0206245 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1024  methionine biosynthesis protein MetW  27.56 
 
 		 214 aa  55.1  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0141813 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16851  SAM-binding motif-containing protein  30.88 
 
 		 311 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0271  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.74 
 
 		 413 aa  55.5  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.419642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16281  SAM-binding motif-containing protein  35.29 
 
 		 309 aa  55.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0957  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  29.85 
 
 		 378 aa  54.7  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4101  methionine biosynthesis protein MetW  30.43 
 
 		 202 aa  54.7  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3810  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.8 
 
 		 366 aa  54.3  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.22407 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  30.63 
 
 		 328 aa  54.3  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1714  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  30.95 
 
 		 383 aa  54.3  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.580096  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2160  putative cyclopropane fatty acid synthase  25.83 
 
 		 423 aa  53.9  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  32.46 
 
 		 392 aa  53.9  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  27.56 
 
 		 271 aa  53.9  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0146  methionine biosynthesis protein MetW  26.92 
 
 		 194 aa  53.9  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2964  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.41 
 
 		 408 aa  53.5  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.151793 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05688  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04190)  28.17 
 
 		 517 aa  53.5  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1682  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  28.4 
 
 		 383 aa  53.5  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1580  methionine biosynthesis protein MetW  29.59 
 
 		 208 aa  53.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 279 aa  52.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.08 
 
 		 330 aa  53.5  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1187  putative methionine biosynthesis protein (MetW)  32.99 
 
 		 220 aa  53.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1184  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  27.43 
 
 		 381 aa  53.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430464 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0050  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  38.55 
 
 		 471 aa  52.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6043  methionine biosynthesis protein MetW  29.35 
 
 		 194 aa  53.5  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  30.32 
 
 		 287 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  24.26 
 
 		 305 aa  52.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2400  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.37 
 
 		 420 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0816  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.08 
 
 		 403 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0386837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2317  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  39.51 
 
 		 414 aa  52.4  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.175202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0640  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.29 
 
 		 432 aa  52.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00257211  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4124  methionine biosynthesis protein MetW  26.8 
 
 		 194 aa  52.4  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0726  methionine biosynthesis protein MetW  30.69 
 
 		 221 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.263476  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2592  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.12 
 
 		 424 aa  52.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  27.38 
 
 		 280 aa  52.8  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0677  methionine biosynthesis MetW  32.67 
 
 		 222 aa  52  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1109  methionine biosynthesis protein MetW  30.69 
 
 		 220 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331654  normal  0.297557 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3482  methionine biosynthesis protein MetW  26.8 
 
 		 194 aa  52.4  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73140  hypothetical protein  31.58 
 
 		 394 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2662  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  28.57 
 
 		 371 aa  52.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.360692  normal  0.0481393 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1199  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  30.53 
 
 		 372 aa  52  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.420763  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4280  methionine biosynthesis MetW  31.96 
 
 		 222 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.558319  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01774  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.63 
 
 		 356 aa  52  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.441761  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81203  predicted protein  28.66 
 
 		 507 aa  52  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  26.14 
 
 		 284 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1441  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.2 
 
 		 419 aa  52  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.351858 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  35.48 
 
 		 244 aa  51.6  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2192  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  31.2 
 
 		 383 aa  51.2  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0331221  hitchhiker  0.00000592673 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  30.08 
 
 		 310 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0956  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  30.83 
 
 		 387 aa  51.2  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0129  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.47 
 
 		 403 aa  51.6  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.483434  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01818  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.23 
 
 		 418 aa  51.6  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0405  methionine biosynthesis MetW  28.12 
 
 		 193 aa  51.6  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3368  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.81 
 
 		 426 aa  51.6  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0604  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 276 aa  51.6  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0898  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.83 
 
 		 260 aa  50.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000544337  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2436  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.54 
 
 		 658 aa  51.2  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0586  methionine biosynthesis MetW  33.66 
 
 		 229 aa  51.2  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5666  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.3 
 
 		 395 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228934  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0234  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.05 
 
 		 420 aa  51.2  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.950577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>