168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0451 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0451  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  100 
 
 
557 aa  1145    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.591016  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2382  hypothetical protein  66.44 
 
 
439 aa  607  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0786  Methyltransferase type 12  43.82 
 
 
539 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0837  Methyltransferase type 12  42.94 
 
 
532 aa  429  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2385  hypothetical protein  74.11 
 
 
115 aa  173  6.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
382 aa  60.5  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  43.68 
 
 
304 aa  58.2  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3339  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.02 
 
 
428 aa  57.8  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169518  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  34.59 
 
 
275 aa  57.8  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0967  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.98 
 
 
446 aa  57  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  normal  0.0206245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.83 
 
 
330 aa  57  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3991  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.05 
 
 
428 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000734624  normal  0.0404434 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1831  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  38.96 
 
 
370 aa  57  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0428  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.22 
 
 
440 aa  56.2  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2433  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.77 
 
 
419 aa  56.6  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.419003 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  27.99 
 
 
274 aa  56.6  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2160  putative cyclopropane fatty acid synthase  28.11 
 
 
423 aa  55.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 
328 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1253  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.74 
 
 
420 aa  56.2  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.087118  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7150  cyclopropane fatty-acyl-phospholipid synthase  28.11 
 
 
419 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133822  normal  0.013333 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1077  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.4 
 
 
447 aa  54.7  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1199  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  25.63 
 
 
372 aa  54.3  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.420763  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23681  SAM-binding motif-containing protein  42.86 
 
 
304 aa  54.3  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0592385 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2436  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.09 
 
 
658 aa  53.9  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  34.17 
 
 
310 aa  53.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  27.12 
 
 
286 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  33.1 
 
 
279 aa  53.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0957  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  32.09 
 
 
378 aa  53.5  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13752  fatty acid synthase  29.36 
 
 
420 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.496318 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1115  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  31.54 
 
 
372 aa  52.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.9654 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2359  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.88 
 
 
412 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3969  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  23.17 
 
 
298 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00511048  normal  0.410057 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  40.91 
 
 
287 aa  52.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07375  conserved hypothetical protein  31.88 
 
 
510 aa  52  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1137  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  33.33 
 
 
375 aa  52  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2592  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.64 
 
 
424 aa  52  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  42.27 
 
 
274 aa  52  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2144  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.65 
 
 
403 aa  51.6  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4888  methionine biosynthesis MetW  32.94 
 
 
202 aa  51.6  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16281  SAM-binding motif-containing protein  39.08 
 
 
309 aa  51.6  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0716  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.14 
 
 
406 aa  51.6  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.719598  normal  0.139789 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0818  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.65 
 
 
403 aa  51.6  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5080  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.96 
 
 
395 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2025  sterol-C-methyltransferase  40.23 
 
 
310 aa  51.2  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0604  methyltransferase type 11  34.78 
 
 
276 aa  51.2  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  37.5 
 
 
310 aa  50.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1838  cyclopropane fatty acid synthase  25.54 
 
 
434 aa  50.8  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2870  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.95 
 
 
482 aa  50.8  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.24578  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  31.67 
 
 
328 aa  50.8  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  27.22 
 
 
280 aa  49.7  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1363  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  27.48 
 
 
374 aa  50.1  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000012191  normal  0.473534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5273  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.77 
 
 
418 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  30.4 
 
 
282 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5415  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.48 
 
 
394 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.424397 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5365  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.77 
 
 
428 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.552994  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1133  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  32.61 
 
 
375 aa  49.7  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  36.36 
 
 
311 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 
271 aa  49.3  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1917  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.27 
 
 
424 aa  49.3  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0513783  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1620  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25 
 
 
419 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.690918 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0786  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.74 
 
 
406 aa  49.3  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0668711  normal  0.244469 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20470  tocopherol o-methyltransferase  31.54 
 
 
318 aa  49.7  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0956  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  31.54 
 
 
387 aa  49.3  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1441  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25 
 
 
419 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.351858 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0234  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.79 
 
 
420 aa  48.5  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.950577 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81203  predicted protein  28.57 
 
 
507 aa  48.5  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 
284 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1910  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  39.76 
 
 
420 aa  48.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5006  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  24.71 
 
 
413 aa  48.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110355  normal  0.20351 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5144  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.81 
 
 
394 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.278517  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1238  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  42.86 
 
 
683 aa  47.8  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.306171  normal  0.747537 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0816  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.49 
 
 
403 aa  47.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0386837  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2223  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  39.19 
 
 
385 aa  47.8  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.399173  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  36.36 
 
 
311 aa  47.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1509  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  59.38 
 
 
424 aa  47.4  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6043  methionine biosynthesis protein MetW  30.59 
 
 
194 aa  47.4  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1574  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.73 
 
 
420 aa  47  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00420728  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  32.08 
 
 
261 aa  47  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3041  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  57.14 
 
 
417 aa  47.4  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.178354 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1333  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34 
 
 
398 aa  47  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.108479 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4101  methionine biosynthesis protein MetW  31.76 
 
 
202 aa  47  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0580  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.79 
 
 
426 aa  47.4  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0129  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.57 
 
 
403 aa  47  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.483434  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  24.84 
 
 
283 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1385  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.26 
 
 
385 aa  47  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1981  O-antigen methyl transferase, putative  27.95 
 
 
574 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.9515  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  28.57 
 
 
310 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0814  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.89 
 
 
411 aa  46.6  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01774  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.57 
 
 
356 aa  47  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.441761  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0271  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.01 
 
 
413 aa  46.2  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.419642  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0127  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.95 
 
 
430 aa  47  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1075  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  30.08 
 
 
387 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0803  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.75 
 
 
291 aa  47  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5532  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.9 
 
 
440 aa  46.6  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0932  putative O-antigen methyl transferase  27.95 
 
 
574 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.179107  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1843  putative O-antigen methyl transferase  27.95 
 
 
574 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  24.55 
 
 
342 aa  46.6  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0640  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.67 
 
 
432 aa  46.2  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00257211  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0436  methionine biosynthesis protein MetW  30.3 
 
 
217 aa  46.6  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2964  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30 
 
 
408 aa  46.2  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.151793 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>