294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0837 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0837  Methyltransferase type 12  100 
 
 
532 aa  1107    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0786  Methyltransferase type 12  89.1 
 
 
539 aa  989    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0451  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  42.94 
 
 
557 aa  429  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.591016  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2382  hypothetical protein  38.42 
 
 
439 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2385  hypothetical protein  47.96 
 
 
115 aa  111  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  33.75 
 
 
382 aa  72  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0271  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.99 
 
 
413 aa  65.1  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.419642  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  33.82 
 
 
311 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3871  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.77 
 
 
428 aa  61.2  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1115  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  32.84 
 
 
372 aa  60.8  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.9654 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5415  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.12 
 
 
394 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.424397 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 
261 aa  60.5  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  34.72 
 
 
275 aa  60.1  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23681  SAM-binding motif-containing protein  32.69 
 
 
304 aa  60.1  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0592385 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  41.67 
 
 
304 aa  59.7  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5365  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.08 
 
 
428 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.552994  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5144  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.56 
 
 
394 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.278517  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5273  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.08 
 
 
418 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  29.32 
 
 
274 aa  58.9  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  28.57 
 
 
280 aa  59.3  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1880  methionine biosynthesis protein MetW  31.68 
 
 
242 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0239131 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  36.46 
 
 
310 aa  58.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1363  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  30.6 
 
 
374 aa  57.8  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000012191  normal  0.473534 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  31.65 
 
 
311 aa  57.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1077  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.45 
 
 
447 aa  58.2  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1831  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  38.2 
 
 
370 aa  57.4  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0436  methionine biosynthesis protein MetW  33.98 
 
 
217 aa  57  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 
284 aa  57  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0967  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.03 
 
 
446 aa  56.2  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  normal  0.0206245 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  32.79 
 
 
279 aa  56.6  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2025  sterol-C-methyltransferase  31.82 
 
 
310 aa  56.2  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  33.98 
 
 
310 aa  56.2  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 
271 aa  56.6  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4888  methionine biosynthesis MetW  31.52 
 
 
202 aa  56.2  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  28.65 
 
 
286 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0640  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.14 
 
 
432 aa  55.1  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00257211  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  34.12 
 
 
328 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4101  methionine biosynthesis protein MetW  30.43 
 
 
202 aa  54.7  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1199  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  30.57 
 
 
372 aa  54.3  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.420763  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1238  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.41 
 
 
683 aa  54.3  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.306171  normal  0.747537 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  26.29 
 
 
342 aa  54.7  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1341  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  40.79 
 
 
394 aa  54.3  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0005734 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2095  methionine biosynthesis protein MetW  29.7 
 
 
229 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273549  normal  0.170685 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1759  methionine biosynthesis protein MetW  29.7 
 
 
229 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16281  SAM-binding motif-containing protein  36.78 
 
 
309 aa  54.3  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1535  methionine biosynthesis protein MetW  29.7 
 
 
229 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0530604 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1133  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  36.25 
 
 
375 aa  53.9  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2436  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.52 
 
 
658 aa  53.5  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3368  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.49 
 
 
426 aa  53.5  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0050  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.07 
 
 
471 aa  53.9  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1441  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.39 
 
 
419 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.351858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.98 
 
 
280 aa  53.5  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5944  methyltransferase type 12  34.59 
 
 
320 aa  53.5  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199024  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4656  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.32 
 
 
301 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0957  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  29.85 
 
 
378 aa  53.5  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2447  methyltransferase type 11  24.2 
 
 
277 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1714  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  31.03 
 
 
383 aa  52.8  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.580096  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20470  tocopherol o-methyltransferase  27.39 
 
 
318 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2317  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  39.51 
 
 
414 aa  52.4  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.175202  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1116  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.08 
 
 
422 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1682  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  27.81 
 
 
383 aa  52.4  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  37.65 
 
 
330 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  31.03 
 
 
392 aa  52.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5666  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  24.31 
 
 
395 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228934  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2291  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.95 
 
 
416 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.38812  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01818  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.17 
 
 
418 aa  52.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73140  hypothetical protein  31.62 
 
 
394 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1137  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  35.44 
 
 
375 aa  52  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2964  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.37 
 
 
408 aa  51.2  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.151793 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6043  methionine biosynthesis protein MetW  29.35 
 
 
194 aa  51.6  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2359  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  24.23 
 
 
412 aa  51.6  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1184  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  37.84 
 
 
381 aa  51.6  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0430464 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0803  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  36.59 
 
 
291 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  34.41 
 
 
244 aa  51.2  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16851  SAM-binding motif-containing protein  30.83 
 
 
311 aa  51.2  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2592  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.12 
 
 
424 aa  51.2  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3461  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.71 
 
 
407 aa  51.2  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.248427  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1910  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.33 
 
 
420 aa  50.8  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0146  methionine biosynthesis protein MetW  27.27 
 
 
194 aa  50.8  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1076  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  33.75 
 
 
371 aa  50.8  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  24.26 
 
 
305 aa  50.4  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1024  methionine biosynthesis protein MetW  26.88 
 
 
214 aa  50.8  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0141813 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4722  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.34 
 
 
438 aa  50.4  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0234  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.87 
 
 
420 aa  50.4  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.950577 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1187  putative methionine biosynthesis protein (MetW)  31.96 
 
 
220 aa  50.4  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1395  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.23 
 
 
430 aa  50.4  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.196126  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  27.49 
 
 
287 aa  50.1  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2329  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.79 
 
 
421 aa  49.7  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.105465  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6348  hypothetical protein  31.62 
 
 
394 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3810  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.08 
 
 
366 aa  49.7  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.22407 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0956  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.79 
 
 
422 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.753631  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1580  methionine biosynthesis protein MetW  29.9 
 
 
208 aa  50.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.216776 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2192  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  34.07 
 
 
383 aa  49.7  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0331221  hitchhiker  0.00000592673 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01777  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  24.62 
 
 
431 aa  49.7  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.150744  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4280  methionine biosynthesis MetW  30.93 
 
 
222 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.558319  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0677  methionine biosynthesis MetW  31.68 
 
 
222 aa  49.7  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  22.99 
 
 
293 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1620  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.66 
 
 
419 aa  50.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.690918 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1109  methionine biosynthesis protein MetW  30.69 
 
 
220 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331654  normal  0.297557 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4452  methyltransferase type 11  30.91 
 
 
277 aa  49.7  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>