More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2025 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2025  sterol-C-methyltransferase  100 
 
 
310 aa  632  1e-180  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  78.88 
 
 
304 aa  502  1e-141  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23681  SAM-binding motif-containing protein  69.77 
 
 
304 aa  444  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0592385 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16281  SAM-binding motif-containing protein  63.76 
 
 
309 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  57.49 
 
 
310 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  58.62 
 
 
311 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  55.08 
 
 
328 aa  364  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19461  SAM-binding motif-containing protein  57.49 
 
 
310 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  59.45 
 
 
310 aa  363  2e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16851  SAM-binding motif-containing protein  55.34 
 
 
311 aa  362  6e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  56.9 
 
 
311 aa  360  1e-98  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  57.59 
 
 
310 aa  360  2e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  54.95 
 
 
328 aa  352  5e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  54.55 
 
 
330 aa  348  9e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  38.72 
 
 
392 aa  216  2.9999999999999998e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  41.36 
 
 
306 aa  208  7e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10269  predicted protein  41.16 
 
 
295 aa  196  3e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20470  tocopherol o-methyltransferase  37.23 
 
 
318 aa  178  8e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  35.21 
 
 
286 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  34.84 
 
 
293 aa  159  6e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  34.16 
 
 
280 aa  159  8e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  34.81 
 
 
342 aa  158  1e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.88 
 
 
280 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  33.45 
 
 
283 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  33.45 
 
 
283 aa  152  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  34.49 
 
 
284 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  33.11 
 
 
382 aa  139  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  35.74 
 
 
274 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  35.26 
 
 
278 aa  102  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  36.42 
 
 
295 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  35.2 
 
 
271 aa  94  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  32.08 
 
 
282 aa  94  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  33.87 
 
 
377 aa  92.4  8e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.88 
 
 
282 aa  90.1  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03100  sterol 24-C-methyltransferase, putative  32.61 
 
 
343 aa  89.7  6e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0399554  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  33.01 
 
 
261 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10824  predicted protein  29.38 
 
 
304 aa  88.2  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0540311  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  34.29 
 
 
279 aa  87.4  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  35.67 
 
 
275 aa  86.3  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3261  SAM-dependent methyltransferase  29.39 
 
 
287 aa  84.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234445  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30710  predicted protein  31.77 
 
 
365 aa  84.3  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.94 
 
 
305 aa  84  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80971  predicted protein  31.64 
 
 
377 aa  83.2  0.000000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0604  methyltransferase type 11  32.02 
 
 
276 aa  79.7  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  35.81 
 
 
295 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2966  Methyltransferase type 11  29.8 
 
 
572 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2447  methyltransferase type 11  31.76 
 
 
277 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2411  methyltransferase type 11  34.46 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  31.22 
 
 
559 aa  73.9  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0809  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
264 aa  73.9  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266836  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  39.83 
 
 
276 aa  73.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  41.44 
 
 
287 aa  73.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42420  predicted protein  26.06 
 
 
317 aa  73.2  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.679564 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1353  Methyltransferase type 11  35 
 
 
280 aa  73.6  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0337053  hitchhiker  0.000000492717 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  40.94 
 
 
273 aa  72.4  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6747  Methyltransferase type 11  33.71 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3306  UbiE/COQ5 family methlytransferase  39.58 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10074  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  35.22 
 
 
347 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2857  methyltransferase type 11  34.09 
 
 
279 aa  68.9  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.295819 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  40.91 
 
 
240 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1677  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  35.56 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0006  hypothetical protein  34.81 
 
 
271 aa  66.6  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.868865  normal  0.0557095 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17021  putative sarcosine-dimethylglycine methyltransferase  31.9 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.650309 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  32.34 
 
 
776 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0228  Methyltransferase type 11  32.5 
 
 
276 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1026  methyltransferase type 11  27.67 
 
 
277 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0676  Methyltransferase type 11  24.69 
 
 
280 aa  65.5  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2451  Methyltransferase type 11  29.79 
 
 
267 aa  64.7  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1559  hypothetical protein  39.81 
 
 
208 aa  63.9  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00538046  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0668  Methyltransferase type 11  40.37 
 
 
288 aa  63.5  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  30.97 
 
 
269 aa  63.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1180  methyltransferase type 11  32.37 
 
 
279 aa  63.2  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 
286 aa  62.8  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1363  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  35.92 
 
 
374 aa  63.2  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000012191  normal  0.473534 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2741  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  38.83 
 
 
400 aa  62.8  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1076  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  25.58 
 
 
371 aa  62.4  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4438  methyltransferase type 11  37.88 
 
 
252 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1480  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  35.92 
 
 
387 aa  62  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4211  methyltransferase type 11  37.88 
 
 
250 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3215  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
278 aa  62.4  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000307808 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4277  methyltransferase type 11  37.88 
 
 
252 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  35.78 
 
 
221 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01614  S-adenosyl-methionine-sterol-C-methyltransferas (AFU_orthologue; AFUA_4G09190)  28.14 
 
 
387 aa  60.8  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787149  normal  0.132042 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87708  predicted protein  38.68 
 
 
267 aa  61.2  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1199  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  36.89 
 
 
372 aa  61.2  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.420763  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1527  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  37.5 
 
 
394 aa  61.6  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1115  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  27.89 
 
 
372 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.9654 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4388  methyltransferase type 11  30.2 
 
 
267 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0989044  normal  0.24508 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  36.88 
 
 
273 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1075  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  40.2 
 
 
387 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0507  Methyltransferase type 11  30.8 
 
 
258 aa  61.6  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459981  hitchhiker  0.00000192307 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  29.38 
 
 
1106 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1047  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  40.38 
 
 
389 aa  60.8  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.196865 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 
252 aa  60.8  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4452  methyltransferase type 11  38.14 
 
 
277 aa  60.8  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.86 
 
 
230 aa  60.1  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1309  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  41.35 
 
 
423 aa  60.5  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  39.22 
 
 
284 aa  60.1  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1184  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  29.92 
 
 
381 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0430464 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>