More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13761 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2795  radical SAM domain-containing protein  76.15 
 
 		 530 aa  805    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.420815  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  100 
 
 		 776 aa  1584    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2597  radical SAM domain-containing protein  74.46 
 
 		 523 aa  793    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1986  radical SAM domain-containing protein  45.49 
 
 		 453 aa  395  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0409  radical SAM family protein  39.7 
 
 		 474 aa  313  7.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0823  Radical SAM domain protein  36.12 
 
 		 463 aa  311  4e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0254  hypothetical protein  37.94 
 
 		 471 aa  310  5e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2134  radical SAM family Fe-S protein  38.41 
 
 		 479 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426592  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2391  MoaA/NifB/PqqE family protein  38.31 
 
 		 455 aa  298  4e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426665  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0301  radical SAM domain-containing protein  36.07 
 
 		 481 aa  283  9e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4048  radical SAM family Fe-S protein  33.54 
 
 		 486 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1684  radical SAM domain-containing protein  33.47 
 
 		 472 aa  228  3e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.622804  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  49.81 
 
 		 271 aa  225  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3420  MoaA/NifB/PqqE family protein  30.36 
 
 		 506 aa  223  9e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.53604  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0574  radical SAM domain-containing protein  28.21 
 
 		 496 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.983421  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2362  Radical SAM domain protein  31.7 
 
 		 512 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0225  Fe-S oxidoreductase  32.61 
 
 		 459 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1807  radical SAM family protein  33.26 
 
 		 465 aa  221  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0681457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1003  radical SAM domain-containing protein  31.36 
 
 		 489 aa  221  5e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00934778  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1614  Radical SAM domain protein  32.54 
 
 		 471 aa  219  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0931  Radical SAM domain protein  30.39 
 
 		 436 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996122  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  47.53 
 
 		 271 aa  218  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1557  Radical SAM domain protein  32.98 
 
 		 467 aa  216  9e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344613  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2615  Radical SAM domain protein  32.76 
 
 		 471 aa  215  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0843  radical SAM domain-containing protein  30.18 
 
 		 487 aa  212  2e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.996552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1889  Radical SAM domain protein  32.3 
 
 		 441 aa  212  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1314  radical SAM domain-containing protein  32.66 
 
 		 470 aa  211  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  hitchhiker  0.000205505 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1938  radical SAM domain-containing protein  31.39 
 
 		 727 aa  212  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1106  radical SAM family protein  29.62 
 
 		 495 aa  210  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3141  Radical SAM domain protein  30.99 
 
 		 441 aa  208  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1009  radical SAM domain-containing protein  29.32 
 
 		 573 aa  208  3e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209169  hitchhiker  0.0000165729 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3275  Radical SAM domain protein  28.45 
 
 		 447 aa  206  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1003  radical SAM domain-containing protein  32.47 
 
 		 458 aa  206  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1446  radical SAM domain-containing protein  28.54 
 
 		 573 aa  206  2e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1818  Radical SAM domain protein  32.82 
 
 		 519 aa  205  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630442  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0802  radical SAM family Fe-S protein  28.46 
 
 		 561 aa  205  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1809  radical SAM domain-containing protein  28.33 
 
 		 578 aa  204  4e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.335774  normal  0.27889 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0703  radical SAM domain-containing protein  28.87 
 
 		 609 aa  201  6e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1639  radical SAM domain-containing protein  28.68 
 
 		 579 aa  200  7.999999999999999e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2775  MoaA/NifB/PqqE family protein  26.64 
 
 		 495 aa  200  9e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0603856  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0319  hypothetical protein  27.71 
 
 		 491 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1813  Radical SAM domain protein  32.62 
 
 		 442 aa  198  4.0000000000000005e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1470  Radical SAM domain protein  29.49 
 
 		 445 aa  197  6e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3435  Radical SAM domain protein  29.94 
 
 		 492 aa  193  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0089  radical SAM domain-containing protein  27.22 
 
 		 569 aa  186  2.0000000000000003e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.63352  normal  0.503154 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0580  Radical SAM domain protein  27.7 
 
 		 513 aa  184  4.0000000000000006e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3544  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.2 
 
 		 464 aa  183  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4236  radical SAM family protein  29.91 
 
 		 514 aa  181  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767249  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4615  radical SAM domain-containing protein  29.91 
 
 		 514 aa  181  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4322  radical SAM domain-containing protein  29.91 
 
 		 514 aa  181  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0183  radical SAM domain-containing protein  29.86 
 
 		 608 aa  181  7e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0115  radical SAM domain-containing protein  27.11 
 
 		 559 aa  179  2e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000926294 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3844  radical SAM domain-containing protein  29.18 
 
 		 533 aa  178  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  40.84 
 
 		 261 aa  169  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0637  Radical SAM domain protein  39.27 
 
 		 588 aa  167  5e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179441 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0020  radical SAM domain-containing protein  25.49 
 
 		 581 aa  165  3e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00170872 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1579  radical SAM domain-containing protein  35.76 
 
 		 543 aa  154  4e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.803741  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1215  Radical SAM domain protein  25.75 
 
 		 582 aa  154  5.9999999999999996e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0970517  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4050  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.35 
 
 		 261 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0793  radical SAM family Fe-S protein  25.05 
 
 		 706 aa  113  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768021  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.17 
 
 		 283 aa  91.7  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  30.94 
 
 		 276 aa  82.8  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0668  Methyltransferase type 11  35.62 
 
 		 288 aa  82.4  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  29.01 
 
 		 278 aa  81.3  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0809  Methyltransferase type 11  27.82 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266836  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2451  Methyltransferase type 11  28.63 
 
 		 267 aa  79.7  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.73 
 
 		 277 aa  79.3  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6747  Methyltransferase type 11  37.8 
 
 		 286 aa  80.1  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4893  methyltransferase type 11  32.16 
 
 		 274 aa  79.7  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.14 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.14 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  30.64 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4452  methyltransferase type 11  33.67 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0601  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 268 aa  76.6  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  32.58 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  29.29 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  29.24 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 		 355 aa  73.9  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  32.95 
 
 		 304 aa  73.9  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  27.55 
 
 		 267 aa  73.6  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0172  methyltransferase type 11  32.56 
 
 		 275 aa  73.9  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.11 
 
 		 265 aa  73.2  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3215  methyltransferase type 11  26.56 
 
 		 278 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000307808 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2966  Methyltransferase type 11  27.85 
 
 		 572 aa  72.8  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  30.99 
 
 		 279 aa  72.8  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 263 aa  72.4  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  32.24 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0251  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32.94 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0110  methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 328 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  32.64 
 
 		 265 aa  70.5  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.47 
 
 		 266 aa  70.5  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 286 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1577  methyltransferase type 11  28.99 
 
 		 301 aa  70.1  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0911179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.11 
 
 		 268 aa  69.7  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1514  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28.93 
 
 		 280 aa  69.3  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.732855  normal  0.394631 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  29.02 
 
 		 389 aa  69.7  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1472  Methyltransferase type 11  29.75 
 
 		 242 aa  69.3  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 254 aa  68.9  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>